Postdoktor till enheten för integrativ metabolomik

Vill du bidra till medicinsk forskning av toppkvalitet?

Vi söker en kandidat som vill vidareutveckla våra arbetsflöden inom rumsbiologi. Den framgångsrika kandidaten förväntas utveckla vår nyligen etablerade DESI-MRM masspektrometriska avbildningsmetod (se PMID:39460704). Sökande kommer också att vara involverade i utvecklingen av vårt multimodala avbildningsarbetsflöde som kopplar DESI-MRM med rumslig transkriptomik för att kartlägga rumslig dysreglering i metabolism. Rumsliga analyser kommer att utföras i flera modellsystem inklusive ex vivo mänsklig lungvävnad och in vivo djurmodeller med användning av både gnagare och zebrafiskbaserade modeller. Dessa ansträngningar kommer att inkludera avbildning av metaboliska svar på specifika utmaningar inklusive pro-inflammatoriska exponeringar (t.ex. T1- och T2-cytokiner) såväl som oroande miljökemikalier (t.ex. PFAS, mikroplaster) följt av rumslig transkriptomik för att identifiera de immuncellsnischer som är associerade med bildandet av specifika metaboliter. Resultaten kommer att integreras med hjälp av egen programvara utvecklad i samarbete med Spatial Biology-plattformarna vid Science for Life Laboratory.

Din roll

Ansvarsområden och arbetsuppgifter:

• Utföra målinriktad LC-MS/MS och DESI-MRM förvärv av biologiska prover (inklusive vävnadsextraktion och kryosnitt)
• Bearbeta och analysera dessa datamodaliteter (med öppen källkod R- och python-paket)
• Designa experiment för att undersöka obesvarade rumsliga frågor i metabolisk dysreglering
• Vidareutveckla vår masspektrometriska avbildningsmetod för att öka sensitivitet, molekylär täckning, rumslig upplösning och molekylär specificitet
• Bygga och implementera verktyg med öppen källkod för att utveckla våra multimodala ansträngningar för att rumsligt korrelera cell-, transkript- och metabolitdistributioner
• Utföra rumslig transkriptomik med MERFISH (inklusive sondval)
  Vävnadsdissektion och ex vivo-stimuleringar i mänsklig lunga
• Utföra zebrafiskodling och utföra riktade exponeringar

Vem är du?

Vi söker en mycket motiverad kandidat med en doktorsexamen inom ett relevant område. Med tanke på forskningens omfattning kan en rad olika bakgrunder vara lämpliga, exempelvis bioanalytisk kemi, masspektrometri, rumslig biologi eller bioinformatik. Den framgångsrika kandidaten förväntas använda och vidareutveckla masspektrometribaserade metoder för avbildning av små molekyler i en rad vävnader. Tidigare erfarenhet av arbete med masspektrometri avbildning eller rumslig biologi ses som meriterande. Utmärkt kommunikationsförmåga och förmåga att interagera socialt och vetenskapligt med andra medlemmar av laboratoriet och med internationella samarbetspartners är avgörande.

För att anställas som postdoktor krävs avlagd doktorsexamen eller en utländsk examen som bedöms motsvara en svensk doktorsexamen. Detta behörighetskrav ska vara uppfyllt senast vid tidpunkten då anställningsbeslutet fattas. Det är meriterande om du har avlagt din doktorsexamen inom de tre senaste åren, om det finns särskilda skäl kan din examen ha avlagts tidigare.

Vad erbjuder vi?

Vi erbjuder en kreativ och inspirerande miljö full av expertis och nyfikenhet, som inkluderar utmärkta möjligheter till utbildning i rumsbiologi. Laboratoriet erbjuder toppmodern utrustning, inklusive dedikerade flera masspektrometrar (för LC-MS/MS och MSI) i en ny specialdesignad toppmodern analytisk anläggning med starka samarbeten med industrin (som möjliggör tillgång till nya instrument och utbildning). Forskningsmiljön inkluderar en levande rumslig biologigemenskap vid Science For Life Laboratory (SciLifeLab; https://tinyurl.com/3uvd4smu) med direkt tillgång till den senaste rumsliga teknologin, inklusive lasermikrodissektion, scanning av objektglas, MERFISH, VISIUM och SCRINSHOT, samt dessa för att utbilda och hjälpa erfarna arbetstekniker att integrera vår personal. Lokala resurser inkluderar BioImage Informatics Facility (BIIF; https://tinyurl.com/5n7swkdh), Biomedicum Imaging Center (BIC; https://tinyurl.com/3e72f275) och Histology Core Facility (HistoCore; https://tinyurl.com/2ftj8vxb) såväl som Zebrafisken (https://tinyurl.com/yvmcfe3t), som är den största i Skandinavien.

Karolinska institutet

Karolinska Institutet är ett av världens ledande medicinska universitet. Dess uppdrag är att bidra till att förbättra människors hälsa genom forskning och utbildning. Vår vision är att driva utvecklingen av kunskap om livet och främja en bättre hälsa för alla. På Karolinska Institutet bedriver vi framgångsrik medicinsk forskning och har det största utbudet av medicinsk utbildning i Sverige. Karolinska Institutet är en statlig högskola, som berättigar till flera förmåner som förlängd semester och generös tjänstepension. Anställda har även gratis tillgång till vårt moderna gym och får ersättning för sjukvård. Den framgångsrika sökande kommer att tillhöra enheten för integrativ metabolomik vid Institutet för miljömedicin. Tjänsten är en tvåårig visstidsanställning. 

Placering: Solna 

http://www.metabolomics.se/

https://ki.se/en/imm/unit-of-integrative-metabolomics

Tio skäl att välja Karolinska Institutet

Ansökan

Ansökan ska bestå av följande handlingar, skrivna på engelska eller svenska:

• Bevis om doktorsexamen
• Ett komplett CV inkluderande disputationsdatum, avhandlingens titel, tidigare akademiska befattningar, akademisk titel, nuvarande befattning, akademiska utmärkelser samt kommittéarbete
• En komplett publikationslista
• En sammanfattning av nuvarande arbete (maximalt en sida)

Ansökan ska göras via rekryteringssystemet Varbi.  

Vill du göra skillnad – och bidra till en bättre hälsa för alla? Sök jobb hos oss!