Forskningsassistent för digital patologi

Vill du bidra till medicinsk forskning av toppkvalitet?

Institutionen för medicinsk epidemiologi och biostatistik bedriver forskning inom epidemiologi och biostatistik inom ett brett spektrum av områden inom biomedicinsk vetenskap. Institutionen är bland de största inom sitt område i Europa och har särskilt starka forskningsprofiler inom psykiatrisk, cancer-, reproduktiv, pediatrisk, farmakologisk, genetisk och geriatrisk epidemiologi, ätstörningar, precisionsmedicin, och biostatistik.

En del av framgången för institutionen beror på vår samarbetsanda, där en stor bidragande faktor är att forskare vid institutionen delar och samfinansierar gemensamma resurser (som t.ex. IT och en tillämpad biostatistikgrupp). Institutionen ligger på campus Solna. Mer information finns på http://ki.se/meb.

Prostatacancergruppen på MEB bedriver internationell spetsforskning inom prostatadiagnostik och skräddarsydd behandling. Specifikt har gruppen under fler år jobbat med artificiell intelligens-baserade modeller för att assistera patologer i deras bedömning av prostatabiopsier.

Din roll

För att bygga modeller baserade på artificiell intelligens som ska användas för patologisk bedömning av prostatabiopsier krävs att de fysiska glasen som biopsierna sitter på digitaliseras med hjälp av speciella skannrar för digital patologi. Kliniska variabler som beskriver biopsierna behöver också samlas in från rapporter skrivna av patologer på flera olika språk. Efter avslutad datainsamling är syftet med projektet att jämföra den diagnostiska prestandan hos en AI-baserad algoritm mellan olika skannerenheter.

Ditt ansvar är 1): att sammanställa patologiinformation från medicinska rapporter skrivna på italienska och franska till strukturerade Excel-tabeller; 2) att digitalisera objektglas av prostatabiopsier till högupplösta bilder med en digital patologiskanner; 3) att utföra beräkningsexperiment för att utvärdera AI-diagnostik på de digitaliserade bilderna.

Tjänsten är en heltidsanställning på 2 månader (19 juni – 20 augusti 2023). Arbetet kan endast bedrivas på plats i Solna.

Vem är du?

Du är noggrann och arbetar väl självständigt och tillsammans med andra. Att kunna läsa rapporterna på franska och italienska är ett krav. Du ska även kunna kommunicera med kollegor på engelska. Vi kräver även tidigare erfarenhet av digital patologiskanning på Grundium Ocus-skannrar. Erfarenhet av att bearbeta whole slide bilder från Leica, Hamamatsu, Philips och Grundium skannrar, utveckling av diagnostiska AI-algoritmer i PyTorch och högpresterande GPU-beräkningar är meriterande.

Andra kunskaper i medicin, digital patologi eller datavetenskap är meriterande.

Stor vikt läggs vid personlig lämplighet.

Vad erbjuder vi?

En kreativ, internationell och inspirerande miljö fylld av kompetens och nyfikenhet. Karolinska Institutet är ett av världens ledande medicinska universitet. Vår vision är att driva utvecklingen av kunskap om livet och verka för en bättre hälsa för alla. Här bedriver vi framgångsrik medicinsk forskning och har det största utbudet av medicinska utbildningar i Sverige. Som universitet är Karolinska Institutet en statlig myndighet. Det gör att du får goda förmåner genom vårt kollektivavtal. Medarbetare på KI erbjuds också möjlighet till ett flexibelt arbetssätt. Det innebär att om den verksamhet du jobbar i tillåter, så kan du arbeta en del av din arbetstid på distans. Du får även träna fritt i våra moderna friskvårdsanläggningar där utbildad personal finns på plats.

Placering: Solna

Tio skäl att välja Karolinska Institutet

Ansökan

Varmt välkommen med din ansökan senast den 4 maj 2023.

Ansökan ska göras via rekryteringssystemet Varbi. I denna rekrytering söker du med ditt CV utan personligt brev. I ansökningsformuläret kommer du istället att få svara på några frågor om varför du söker jobbet.

Vill du göra skillnad – och bidra till en bättre hälsa för alla? Sök jobb hos oss