Bioinformatiker

Vill du bidra till medicinsk forskning av toppkvalitet?

Du kommer att ingå i de dynamiska och samarbetsvilliga grupperna med professor Maja Jagodic och professor Fredrik Piehl vid Institutionen för klinisk neurovetenskap, där du får möjlighet att bidra till interaktiv forskning som drivs av relevanta kliniska frågor och som kombinerar mekanistisk förståelse av multipel skleros (MS) med stark klinisk expertis. Teamen ingår i Karolinska Neuroimmunology and Multiple Sclerosis (KNIMS), ett nätverk som samlar omkring 60 forskare som arbetar med olika aspekter av MS-patogenesen, inklusive genetik, epidemiologi, immunologi och epigenetik, med utmärkta kliniska kohorter och experimentella modeller. Du kommer därför att dra nytta av en mycket samarbetsvillig och engagerad forskningsmiljö som är engagerad i att utforska innovativa translationella idéer inom precisionsmedicin, där du kommer att ha möjlighet att bedriva forskning på högsta internationella nivå inom området.

Din roll

Vi strävar efter att avslöja molekylära mekanismer som ligger till grund för neuroinflammation och neurodegeneration vid MS genom att använda både storskaliga omikmetoder i unika kliniska prover i kombination med funktionella experiment. MS är en ledande orsak till progressivt funktionshinder hos unga vuxna och en mycket heterogen sjukdom med avseende på klinisk presentation och behandlingssvar. Du kommer att implementera bioinformatiska pipelines för att analysera data från t.ex. nästa generations sekvenseringstekniker (NGS) och förhöra flera omikslag med hjälp av epigenetisk och transkriptomisk analys från bulkvävnad och enskilda celler. Arbetet kommer att omfatta utformning av analysen, databehandling, kvalitetskontroll, statistisk analys, visualisering av data, tolkning och presentation i form av vetenskapliga publikationer, bidragsansökningar och vid möten och konferenser. Den sökande förväntas interagera med många medarbetare vid KI och externt och bidra till att enheten fungerar effektivt.

Vem är du?

Vi söker dig som delar vår passion för translationell forskning, som är redo att gå med i vårt mycket samarbetsvilliga team och som är mycket motiverad att utföra beräkningsarbete. Du måste ha en masterexamen inom ett relevant område.

Krav

Examen i biovetenskap inom området beräkningsvetenskap/biologi
Goda kunskaper i programmering, särskilt i R
Dokumenterade färdigheter i analys, visualisering och tolkning av omikdata
Dokumenterade kunskaper i statistik
Erfarenhet av högpresterande databehandling
Förmåga att hantera multitasking
Goda kunskaper i engelska i tal och skrift

Meriter

Du bör också ha god kommunikationsförmåga och dokumenterad förmåga att samarbeta professionellt. Erfarenhet av NGS-baserad omikanalys (t.ex. analys av RNA, metylom, öppet kromatin i bulk eller enskilda celldata) i samband med en komplex mänsklig sjukdom kommer att betraktas som en extra merit.

Vad erbjuder vi?

En kreativ, internationell och inspirerande miljö fylld av kompetens och nyfikenhet. Karolinska Institutet är ett av världens ledande medicinska universitet. Vår vision är att driva utvecklingen av kunskap om livet och verka för en bättre hälsa för alla. Här bedriver vi framgångsrik medicinsk forskning och har det största utbudet av medicinska utbildningar i Sverige. Som universitet är Karolinska Institutet en statlig myndighet. Det gör att du får goda förmåner genom vårt kollektivavtal. Medarbetare på KI erbjuds också möjlighet till ett flexibelt arbetssätt. Det innebär att om den verksamhet du jobbar i tillåter, så kan du arbeta en del av din arbetstid på distans. Du får även träna fritt i våra moderna friskvårdsanläggningar där utbildad personal finns på plats.

Placering: Solna

Läs mer om Institutionen för klinisk neurovetenskap här
Läs mer om den forskargrupp du kommer att ingå i här

Ansökan

Varmt välkommen med din ansökan senast den 29 januari 2023.

Ansökan ska göras via rekryteringssystemet Varbi. I denna rekrytering söker du med ditt CV utan personligt brev. I ansökningsformuläret kommer du istället att få svara på några frågor om varför du söker jobbet.

Vill du göra skillnad – och bidra till en bättre hälsa för alla? Sök jobb hos oss!