Postdoctoral Researcher in single-cell bioinformatics with focus on Polycystic ovary syndrome

Vill du bidra till medicinsk forskning av toppkvalitet?

Forskningen vid Institutionen för kvinnors och barns hälsa (KBH) behandlar både grundläggande och klinisk vetenskap. Forskningen sker i sju avdelningar med separata vetenskapliga profiler. Enheterna varierar i storlek och har flera forskargrupper. Vi är också engagerade i utbildning på grundnivå (MD-program), specialist (barnsjuksköterskor, barnmorskor, läkare) och forskarnivå.

Grupper:

Professor Angelica Lindén Hirschbergs forskargrupp inom avdelningen för obstetrik och gynekologi studerar de grundläggande hormonella mekanismerna och genetiska sambanden mellan metabolism och reproduktion . Hennes forskargrupp har internationellt rykte inom området gynekologisk endokrinologi och metabolism, läs mer här. Polycystiskt ovariesyndrom (PCOS) som är den vanligaste endokrina störningen hos kvinnor i fertil ålder, har samband med hyperandrogenism, insulinresistens och hyperinsulinem. PCOS har kopplats till subfertilitet och en mängd olika graviditetskomplikationer. Vår forskning inom PCOS är translationell från experimentella in vitro-studier till randomiserade kontrollerade studier utförda i samarbete med nationella och internationella forskningsnätverk, såsom PCOS Nordic Network och PCOS International Guideline Development Group. Vi undersöker för närvarande effekter av livsstilsintervention och viktförändring på vävnadsspecifika metaboliska markörer.

Forskargruppen Baryawno finns vid BioClinicum i Solna och knuten till Barncancerforskningsenheten, institutionen för kvinnors och barns hälsa, Karolinska Institutet. Gruppen består av 3 Ph.D. studenter. Fokus för vår forskning ligger inom mikromiljön (nisch) av stamceller och cancer. Vi tillämpar grundläggande, translationella och kliniska tillvägagångssätt i vår forskning inklusive single cell teknologier, bioinformatik, immunologi och molekylärbiologi samt funktionell analys och utveckling av prekliniska djur- och in vitro-modeller. Den postdoktorala kandidaten kommer att bihandleds av Dr Baryawno inom det föreslagna projektet. Mer information om arbetet från Baryawno-labbet finns i nya publikationer (Baryawno et al., Cell 2019; Kfoury, Baryawno et al., Cancer Cell 2021; Verhoeven et al., Cell Reports Medicine 2022; Alchahin et al., Nature Communications et al., 2022, Olsen et al., JCI Insights 2022).

Projektet och din roll

Det aktuella projektet kommer att fokuseras på karaktärisering av humana endometrie-, fett- och muskelbiopsiprover från PCOS-patienter och friska försökspersoner med användning av single cell RNA-sekvensering. Ansvaret för postdoktorn kommer vara att designa och utföra single cell RNA-sekvenseringsexperiment, inklusive vävnadsbearbetning och biblioteksförberedelser, med 10X Chromium Single Cell Solution, och vidare och analysera de data som genereras. Syftet är att undersöka det cellulära och molekylära landskapet för PCOS för att söka efter sjukdomsmekanismer.

Vidare innebär rollen även att skriva vetenskapliga artiklar och presentera data vid internationella kongresser samt delta i möten gällande forskargruppens/avdelningens allmänna verksamhet.

Vem är du?

För att anställas som postdoktor krävs avlagd doktorsexamen eller en utländsk examen som bedöms motsvara doktorsexamen. Detta behörighetskrav ska vara uppfyllt senast vid tidpunkten då anställningsbeslutet fattas. Det är meriterande om du har avlagt din doktorsexamen inom de tre senaste åren, om det finns särskilda skäl kan din examen ha avlagts tidigare.

Sökande till denna position bör ha en doktorsexamen i molekylärbiologi, biokemi, genetik eller relaterade områden. En stark bakgrund inom genomik, bioinformatik och statistik samt erfarenhet av molekylärbiologiska metoder, särskilt encellig RNA-sekvensering och genuttrycksdataanalystekniker är väsentliga för tjänsten såväl som med molekylärbiologiska metoder för våtlabb såsom vävnadshantering och in vitro-odling. Utmärkta färdigheter i programmering, kunskap om biologiska databaser och dataintegration samt datavisualisering är fördelar. En hög nivå av organisatorisk och kommunikativ förmåga, samt förmåga att självständigt utföra experiment och implementera tolkning av data är ett krav. Goda kunskaper i engelska i tal och skrift krävs.

Vad erbjuder vi?

En kreativ, internationell inspirerande miljö fylld av kompetens och nyfikenhet. Karolinska Institutet är ett av världens ledande medicinska universitet. Här bedriver vi framgångsrik medicinsk forskning och har det största utbudet av medicinska utbildningar i Sverige. På KI får du träffa forskare med olika forskningsinriktningar som jobbar tillsammans. Det är det gränsöverskridande samarbetet som bidrar till KI:s världsledande position inom forskning. Flera av de personer du möter inom vården är utbildade på KI. En nära relationen till hälso- och sjukvården är viktig för att skapa utbildning och forskning av högsta kvalitet. Som universitet är Karolinska Institutet också en statlig myndighet. Det gör att du som anställd får goda förmåner genom vårt kollektivavtal.

Placering: Solna

Läs mer om institutionen för kvinnors och barns hälsa här

Ansökan

Ansökan ska bestå av följande handlingar, skrivna på engelska eller svenska:

En komplett CV inkluderande disputationsdatum, avhandlingens titel, tidigare akademiska befattningar, akademisk titel, nuvarande befattning, akademiska utmärkelser samt kommittéarbete
En komplett publikationslista
En sammanfattning av nuvarande arbete (maximalt en sida)

Varmt välkommen med din ansökan!

Ansökan ska göras via rekryteringssystemet Varbi.

Vill du göra skillnad – och bidra till en bättre hälsa för alla? Sök jobb hos oss