Forskningsassistent

Vill du bidra till en bättre hälsa för alla?

Centrum för molekylär medicin (CMM) vid Karolinska Institutet (KI) består av mer än 500 medarbetare med klinisk erfarenhet från Karolinska Universitetssjukhuset och med forskningskompetens från KI för forskning om folksjukdomarna. Herlenius-gruppen består av forskare med ett brett spektrum av expertis och intresse, med ett gemensamt mål att förbättra människors hälsa. Det aktuella projektet handlar om inspiration som avslöjas genom encellstranskriptomik med hjälp av nya smart-seq3 och Smart-seq3xpress.

Din roll

Vi undersöker hjärnstammens cellulära och nätverkskomponenter av inspiration, ger värdefull insikt i förändringar i genaktivitet i hjärnstammen vid födseln och under progressiv perinatal utveckling, och avslöjar involveringen av inflammation i den centrala andningsresponsen på yttre stressorer.

Som forskningsassistent arbetar du i ett multidisciplinärt team och kommer att ansvara för att utföra avancerad beräknings- och statistisk analys av stora encellssekvenser (Smart-Seq3express), och andra omics-dataset genererade i syfte att undersöka andningens tillkomst. Några av huvuduppgifterna inkluderar, men är inte begränsade till, att revidera litteratur och utvärdera bioinformatikprogramvara/verktyg för integration i våra labbprocedurer, utföra kvalitetskontroller, datautforskning, statistik, visualisering och formulering av datadrivna slutsatser, samt som deltagande i regelbundna interna och externa diskussioner och presentationer.

Vem är du?

M.Sc. eller Ph.D. i bioinformatik med 1 års erfarenhet av singelcells transkriptomanalys (smart-seq3express).
Kunskaper i vanliga programmeringsspråk: R och python (kunskaper i bash är ett plus).
Kunskaper i versionskontrollsystem (Git / GitHub).
Önskad erfarenhet av molntjänster (Amazon AWS, Microsoft Azure, etc).
Erfarenhet av High Performance Computing (HPC) miljöer och parallellisering för lösning av bioinformatikproblem.
Positiv inställning och förmåga att arbeta i ett team.
Stark presentations- och kommunikationsförmåga.
Kunskaper inom containerplattformar som Docker och singularity.
Önskad erfarenhet av bioconda är ett plus.

Vad erbjuder vi?

En kreativ, internationell och inspirerande miljö fylld av kompetens och nyfikenhet. Karolinska Institutet är ett av världens ledande medicinska universitet. Vår vision är att driva utvecklingen av kunskap om livet och verka för en bättre hälsa för alla. Här bedriver vi framgångsrik medicinsk forskning och har det största utbudet av medicinska utbildningar i Sverige. Som universitet är Karolinska Institutet en statlig myndighet. Det gör att du får goda förmåner genom vårt kollektivavtal. Medarbetare på KI erbjuds också möjlighet till ett flexibelt arbetssätt. Det innebär att om den verksamhet du jobbar i tillåter, så kan du arbeta en del av din arbetstid på distans. Du får även träna fritt i våra moderna friskvårdsanläggningar där utbildad personal finns på plats.

Placering: Solna

https://ki.se/kbh/herlenius-research

Choose to work at KI – Ten reasons why

Ansökan

Varmt välkommen med din ansökan senast den 22 Augusti 2022.

Ansökan ska göras via rekryteringssystemet Varbi. I denna rekrytering söker du med ditt CV utan personligt brev. I ansökningsformuläret kommer du istället att få svara på några frågor om varför du söker jobbet.

Vill du göra skillnad – och bidra till en bättre hälsa för alla? Sök jobb hos oss