Forskningassistent inom avancerad bildbehandling

Vill du bidra till medicinsk forskning av toppkvalitet?

Vår forskargrupp utvecklar, validerar och tillämpar avancerade bildtekniker i klinisk vardag. Vi arbetar för att skapa kvantitativa bildbiomarkörer som leder till bättre behandling samt bildmetoder som ger oss en djupare patofysiologisk förståelse. Vi arbetar med särskilt fokus på neuroinflammatoriska och neurodegenerativa sjukdomar såsom multipel skleros (MS), Parkinsonismer, demens, amyotrofisk lateralskleros (ALS) samt Covid-19 i både hjärnan och lungorna. Vi har tillgång till de senaste bildteknikerna, inklusive klinisk 7 Tesla MR och klinisk fotonräknande DT. Vi har också många internationella samarbeten och stödjer flera storskaliga forskningsprojekt. Som forskarassistent kommer du ha en central roll i vår grupp som ständigt strävar efter att implementera de senaste bildtekniska framstegen för patienternas bästa.

Din roll

Din huvudsakliga roll i teamet kommer att vara att optimera verktyg för bildanalys i så kallade pipelines med särskilt fokus på kvantitativ MR och data från fotonräknande DT. Detta inkluderar koordinering av datalagring, pseudonymisering och avancerade bildanalystekniker.

Du kommer att vara ansvarig för att sätta upp automatiserade bildanalysverktyg för radiologiska forskningsstudier på vår beräkningsserver med Docker. Ditt arbete ska vara strukturerat och väl dokumenterat, vilket ger grunden för vetenskapliga publikationer av hög kvalitet.

Vårt arbetsflöde medger att en del av arbetet kan göras på distans. Dessutom finns det möjligheter till utveckling och avancemang inom forskargruppen. Du kommer att utgå från Huddinge men kommer även att arbeta i Solna vid behov. 

Dina bidrag kommer att främja den bildtekniska forskningen och i förlängningen förbättra våra patientutfall. 

Vem är du?

Krav:

• Kandidatexamen i medicinsk teknik, datavetenskap, informatik, teknik, fysik, matematik eller ett relaterat område.
• Erfarenhet av att arbeta nära forskare/klinisk personal/industri för att automatisera bildbehandlings- och analysflöden; med särskild hänsyn till: FreeSurfer, QSM, MATLAB.
• Dokumenterad erfarenhet av att bedriva forskning inom biomedicinsk avbildning vid högt ansedda institutioner, helst genom granskade abstrakt/publikationer.
• Erfarenhet av att hantera stora avbildningsdatamängder; särskild hänsyn ges till bearbetning av MR-data från hjärna, ryggmärg, lungor eller kärlsystem.
• Utmärkta programmeringskunskaper i språk/verktyg såsom: Python, MATLAB, Bash, Linux CLI, Git, C++ och maskininlärningsalgoritmer.
• Praktisk erfarenhet av att arbeta med virtualisering och containeriserade miljöer såsom Docker eller Kubernetes med optimering för storskaliga dataanalyser.
• Bekantskap med grundläggande principer för mjukvaruutveckling: dokumentation, versionskontroll, kontinuerlig integration och testning.
• Stark analytisk och problemlösningsförmåga.
• Förmåga att samarbeta med medicinska experter och forskare för att utveckla lösningar som möter deras behov.
• Praktisk erfarenhet av att arbeta i internationella multicenter-samarbeten.
• Flytande i skriftlig och talad engelska.

Kvalifikationer/meriter:

• Magisterexamen i teknik, medicinsk teknik, maskininlärning, datavetenskap, informatik, fysik, matematik eller ett relaterat område.
• Expertis inom implementering av maskin-/djupinlärningsalgoritmer för bildsegmentering/-klassificering och rendering av volymetrisk 3D- och 4D-dicom-bilddata.
• Erfarenhet av att arbeta med DICOM-servrar (såsom ORTHANC) och webbaserade PACS-lösningar (såsom OHIF viewer).
• Dokumenterad erfarenhet av vetenskapligt skrivande. 

Vad erbjuder vi?

En kreativ, internationell och inspirerande miljö fylld av kompetens och nyfikenhet. Karolinska Institutet är ett av världens ledande medicinska universitet. Vår vision är att driva utvecklingen av kunskap om livet och verka för en bättre hälsa för alla. Här bedriver vi framgångsrik medicinsk forskning och har det största utbudet av medicinska utbildningar i Sverige. Som universitet är Karolinska Institutet en statlig myndighet. Det gör att du får goda förmåner genom vårt kollektivavtal. Medarbetare på KI erbjuds också möjlighet till ett flexibelt arbetssätt. Det innebär att om den verksamhet du jobbar i tillåter, så kan du arbeta en del av din arbetstid på distans. Du får även träna fritt i våra moderna friskvårdsanläggningar där utbildad personal finns på plats.  

Placering: Flemingsberg

Läs mer om Institutionen för klinisk neurovetenskap
Läs mer om forskargruppen du kommer att ingå i

Ansökan

Varmt välkommen med din ansökan senast den 11 december 2024.

Ansökan ska göras via rekryteringssystemet Varbi. I denna rekrytering söker du med ditt CV utan personligt brev. I ansökningsformuläret kommer du istället att få svara på några frågor om varför du söker jobbet. 

Vid tillsvidareanställning tillämpar Karolinska Institutet 6 månaders provanställning.

Vill du göra skillnad – och bidra till en bättre hälsa för alla? Sök jobb hos oss!