Forskningsspecialist inom encellig genomik och malaria

Vill du bidra till att förbättra människors hälsa?

Institutionen för mikrobiologi, tumör- och cellbiologi (MTC) vid Karolinska Institutet bedriver forskning och undervisning inom immunologi, infektionsbiologi, cellbiologi och cancer. Våra nyckelord är multidisciplinära, överbryggande, nationella och internationella samarbeten.

Som Forskningsspecialist hos oss får du möjlighet att utveckla och tillämpa enkelcells-omik för att definiera värdens immunrespons under malariainfektion i longitudinella kohortprover.

Ämnesbeskrivning

Utveckling och tillämpning av transkriptomik (-omik) på enskilda celler för att förstå värdens immunrespons vid malariainfektion.

Din roll

Du kommer att bli en del av ett mycket engagerat och internationellt team som fokuserar på innovativ forskning inom encellsteknik (-omik) för malaria, med det övergripande målet att använda en integrerad strategi för att utrota sjukdomen i endemiska länder.

De huvudsakliga arbetsuppgifterna är:

• Utföra avancerade enkelcellssekvenseringsexperiment på olika plattformar (t.ex. 10X Chromium, Parse Biosciences, Smart-seq, etc).
• Analysera nästa generations sekvenseringsdata, helst WGS/WES-data från fältprover.
• Bearbeta rå sekvenseringsdata för att generera genuttrycksprofiler, utföra klustring av cellpopulationer och analysera bana/härstamning, ofta med hjälp av R, Python eller specialiserade bioinformatikverktyg.
• Hantera, administrera och bearbeta fältprover.
• Tillhandahålla expertis och rådgivning till forskare och studenter om enkelcellsteknik och analys.
• Skriva manuskript och ansöka om bidrag.

Utveckling och implementering av nya metoder för NGS-baserade enkelcells- och rumsliga vävnadsanalyser.

Behörighetskrav

För anställning som forskningsspecialist vid Karolinska Institutet tillämpas de behörighetskrav som anges i Riktlinjer för andra anställningar än läraranställningar vid Karolinska Institutet i förhållande till fastställd anställningsprofil.

Behörig att anställas som forskningsspecialist är den som har uppvisat vetenskaplig skicklighet och har avlagt doktorsexamen eller har utländsk examen som bedöms motsvara svensk doktorsexamen samt har dokumenterat forskningsarbete efter disputation.

Övriga krav för tjänsten:

• Doktorsexamen i beräkningsbiologi/genomik/bioinformatik eller motsvarande.
• Dokumenterad erfarenhet av att analysera nästa generations sekvenseringsdata, helst WGS/WES-data från fältprover. Bearbetning av rå sekvenseringsdata för att generera genuttrycksprofiler, utföra klustring av cellpopulationer och analysera bana/härstamning, ofta med hjälp av R, Python eller specialiserade bioinformatikverktyg.
• Fördjupad förståelse för, och arbete med enkelcellssekvenseringsdata från olika molekylära modaliteter.
• Fördjupad förståelse för och intresse av malariaforskning.
• Minst tre publikationer där du har haft en ledande eller viktig roll i analysen av sekvenseringsdata.
• Tidigare erfarenhet av arbete i samhällen som lever i malariaendemiska regioner och upprättande av longitudinella kohorter, provinsamling och bearbetning.
• En stark förmåga att samarbeta samt förmåga att trivas i mångkulturella miljöer och möjlighet att resa utomlands för fältbaserad forskning.
• Förmåga att självständigt organisera din egen arbetsrutin och flexibelt anpassa ditt veckoschema efter nya förfrågningar.
• Flytande engelska i tal och skrift.

Det är utifrån en sammantagen helhetsbedömning av de sökandes meriter och skicklighet som Karolinska Institutet bedömer vilken av de sökande som har de bästa förutsättningarna att bidra till en positiv utveckling av verksamheten.

Vad erbjuder vi?

En kreativ och inspirerande miljö fylld av kompetens och nyfikenhet. Karolinska Institutet är ett av världens ledande medicinska universitet. Här bedriver vi framgångsrik medicinsk forskning och har det största utbudet av medicinska utbildningar i Sverige. På KI träffar du forskare med olika forskningsinriktningar som jobbar tillsammans. Det är det gränsöverskridande samarbetet som bidrar till KI:s världsledande position inom forskning. Flera av de personer du möter inom vården är utbildade på KI. En nära relationen till hälso- och sjukvården är viktig för att skapa utbildning och forskning av högsta kvalitet. Som universitet är Karolinska Institutet också en statlig myndighet. Det gör att du som anställd får goda förmåner genom vårt kollektivavtal. 

Placering: Solna

Tio skäl att välja Karolinska Institutet

https://ki.se/personer/akira-kaneko#about-me

Ansökan

Vi ser gärna att din ansökan är skriven på engelska, men det går också bra att ansöka på svenska. Ansökan ska innehålla följande handlingar: Intyg om doktorsexamen, CV, meriter och beskrivning av planerad forskning som presenteras i enlighet med Karolinska Institutets meritportfölj.

Ansökan ska göras via rekryteringssystemet Varbi.

Vid tillsvidareanställning tillämpar Karolinska Institutet 6 månaders provanställning.

Vill du göra skillnad – och bidra till en bättre hälsa för alla? Sök jobb hos oss!