Amanuens i bioinformatik på sekvensering av DNA nanostrukturer

Vill du bidra till medicinsk forskning av toppkvalitet?

Institutionen för mikrobiologi, tumör- och cellbiologi (MTC) vid Karolinska Institutet bedriver forskning och undervisning inom immunologi, infektionsbiologi, cellbiologi och cancer. MTC har cirka 40 forskargrupper och våra nyckelord är multidisciplinära, överbryggande, nationella och internationella samarbeten.

Vi letar nu efter Amanuens som ska arbeta i Erik Benson grupp på Scilifelab campus Solna. Gruppens fokus är att använda DNA nanoteknik för att utveckla bibliotek av strukturer med stor diversitet. Sedan utför vi selektions-experiment och sekvensering för att hitta den strukturen som har bäst egenskaper. Målet är att utveckla alternativa av till antikroppar som går snabbt att producera och är sekvenserar. Som medlem i gruppen blir du en del av Scilifelab samt en del av enheten för mikrobiologi-bakteriologi på Karolinska Institutet. 

Din roll

Antikroppar är essentiella för modern forskning, diagnostik och terapi men har problem med reproducerbarhet och utvecklingstid vid nya patogener. Vi har utvecklat ett system av DNA nanostrukturer som kan fungerar som alternativ. Strukturerna innehåller ett syntetiskt genom som kan sekvenseras med nanopore sekvensering. Vi letar nu efter en ammanuens som kan utveckla en pyton mjukvara för att processa nanopore data och identifiera DNA fragment i läsningarna.   

Vem är du?

Krav

• För att anställas som amanuens behöver du vara regisrerad student på ett svenskt universitet eller högskola. Vi söker dig som kan arbeta på projektet under sommaren 2024.
• Du bör ha en kandidatexamen i bioinformatik och ha erfarenhet med att arbeta med sekvenseringsdata i python i linux miljöer.
• Du bör ha kunskap i att dels kunna använda etablerade metoder för bioinformatik samt utveckla egna metoder för att processa speciell data. 

Vad erbjuder vi?

En kreativ, internationell och inspirerande miljö fylld av kompetens och nyfikenhet. Karolinska Institutet är ett av världens ledande medicinska universitet. Vår vision är att driva utvecklingen av kunskap om livet och verka för en bättre hälsa för alla. Här bedriver vi framgångsrik medicinsk forskning och har det största utbudet av medicinska utbildningar i Sverige. Som universitet är Karolinska Institutet en statlig myndighet. Det gör att du får goda förmåner genom vårt kollektivavtal. Medarbetare på KI erbjuds också möjlighet till ett flexibelt arbetssätt. Det innebär att om den verksamhet du jobbar i tillåter, så kan du arbeta en del av din arbetstid på distans. Du får även träna fritt i våra moderna friskvårdsanläggningar där utbildad personal finns på plats.  

Placering: Solna

Ansökan

Varmt välkommen med din ansökan senast 2024-05-06

Ansökan ska göras via rekryteringssystemet Varbi. I denna rekrytering söker du med ditt CV utan personligt brev. I ansökningsformuläret kommer du istället att få svara på några frågor om varför du söker jobbet. 

Vill du göra skillnad – och bidra till en bättre hälsa för alla? Sök jobb hos oss