Forskningsassistent

Vill du bidra till medicinsk forskning av toppkvalitet?

Vi letar nu efter en forskningsassistent i Computational Genome Biology till Bienko-Crosetto Lab for Quantitative Genome Biology vid Science for Life Laboratory (SciLifeLab) i Stockholm.

Bienko-Crosetto Lab är fokuserat på att utveckla och tillämpa banbrytande genomisk teknik för att kartlägga den rumsliga organisationen av kromatin i kärnan av däggdjursceller, med det långsiktiga målet att förstå hur DNA-RNA-proteininteraktioner formar högre ordningens kromatinarkitektur och orkestrera den under fysiologiska och patologiska förhållanden.

Som forskningsassistent kommer du att bidra till att analysera olika omics-dataset som vi kontinuerligt genererar i vårt labb och tillämpa avancerade beräkningsverktyg för att modellera 3D-genomarkitekturen för enstaka celler. Du kommer att vara inbäddad i en dynamisk forskningsmiljö (https://bienkocrosettolabs.org/) där du kommer att arbeta tillsammans med seniora forskare, postdoktorer och doktorander från olika fält och bakgrunder samt få möjligheten att utöka dina kunskaper och datorkunskaper och främja din kreativitet.

Din roll

Dina huvudsakliga arbetsuppgifter kommer att vara:

Tillämpa tillgängliga pipelines för bearbetning av Hi-C- och GPSeq-datauppsättningar genererade i vårt labb
Integrering av GPSeq- och Hi-C-data som genererats i vårt labb med olika typer av allmänt tillgängliga omics-dataset (t.ex. ChIP-seq, RNA-seq, ATAC-seq)
Samarbeta med matematiker och teoretiska fysiker i vårt labb för att utveckla matematiska modeller av 3D-genomorganisation och dess dynamik i fysiologiska och patologiska tillstånd.

Vem är du?

Du har:

En kandidat- eller masterexamen i fysik/matematik/bioteknik/bioteknik eller motsvarande.
Dokumenterad tidigare praktisk erfarenhet av att analysera olika typer av NGS-data.
Flytande i minst ett av följande programmeringsspråk: Unix/Bash/Python/C++/ Matlab/R.
Förmåga att självständigt organisera din egen arbetsrutin och flexibelt anpassa ditt veckoschema till nya önskemål.
En problemlösande och framåtblickande personlighet, det vill säga att du är motiverad att lösa hinder som kan finnas på vägen till att nå ett mål, du tycker om att felsöka, du är inte rädd för att söka hjälp och du kan hitta lösningar även om detta innebär att man reviderar det ursprungliga målet/planen (att aldrig kompromissa med vetenskaplig stringens och kvalitet).
En stark samarbetsinställning, det vill säga att du är en stark lagspelare och vill bidra till hela lagets framgång.
Flytande i muntlig och skriftlig engelska.

Vad erbjuder vi?

En kreativ, internationell och inspirerande miljö fylld av kompetens och nyfikenhet. Karolinska Institutet är ett av världens ledande medicinska universitet. Vår vision är att driva utvecklingen av kunskap om livet och verka för en bättre hälsa för alla. Här bedriver vi framgångsrik medicinsk forskning och har det största utbudet av medicinska utbildningar i Sverige. Som universitet är Karolinska Institutet en statlig myndighet. Det gör att du får goda förmåner genom vårt kollektivavtal. Medarbetare på KI erbjuds också möjlighet till ett flexibelt arbetssätt. Det innebär att om den verksamhet du jobbar i tillåter, så kan du arbeta en del av din arbetstid på distans. Du får även träna fritt i våra moderna friskvårdsanläggningar där utbildad personal finns på plats.

Placering: Solna, SciLifeLab

Våra labb finns på Science for Life Laboratory (SciLifeLab) beläget på Karolinska Institutets campus i Stockholm. SciLifeLab är ett tvärvetenskapligt centrum för molekylär biovetenskap med fokus på hälso- och miljöforskning och samlar under samma tak grupper från fyra universitet: Karolinska Institutet, Kungliga Tekniska Högskolan, Stockholms universitet och Uppsala universitet. Centret har toppmoderna teknologiplattformar, inklusive nästa generations sekvensering, histologi med hög genomströmning, superupplösningsmikroskopi, proteomik, bildanalys och bioinformatik.

Ansökan

Ansökan ska göras via rekryteringssystemet Varbi. I denna rekrytering söker du med ditt CV utan personligt brev. I ansökningsformuläret kommer du istället att få svara på några frågor om varför du söker jobbet.

Vill du göra skillnad – och bidra till en bättre hälsa för alla? Sök jobb hos oss