Bioinformatiker

Vill du bidra till att förbättra människors hälsa?

Centrum för translationell mikrobiomforskning (CTMR) expanderar och etablerar nu ett team dedikerat till utveckling av mjukvara och systemstöd till vår forskningsverksamhet. Vi söker därför en senior utvecklare för att stärka vårt IT team. Tjänsten är en unik och spännande möjlighet för dig som vill jobba med avancerad forskning inom mikrobiomfältet. Det finns visst utrymme att utforma tjänsten utifrån dina kompetenser och intresseområden.

Vi erbjuder en omväxlande labbnära miljö där du arbetar i nära samarbete med både andra bioinformatiker, forskare, systemutvecklare, och labbpersonal. CTMR:s mål är att bidra till stor framtida samhällsnytta genom mikrobiomforskning och ett robust team med bioinformatiker är en förutsättning för att hantera de datamängder som produceras, för att genom bioinformatisk och statistisk analys nå forskningscentrets mål.

Din roll

Ditt mål är att bidra till utredningen vilken roll det mänskliga mikrobiomet spelar i olika sammanhang. Du kommer leda avancerade dataanalyser av mänskliga mikrobiom och multi-omics dataset i flertalet projekt, ofta i nära samarbete med labbpersonal, kliniska samarbetspartners, och gruppledare. Dina dagliga arbetsuppgifter inkluderar “data cleaning”, dataintegrering, visualisering, och statistisk analys. Annotering av data och kvalitetskontroll är en integral del av ditt arbete. Du förväntas hålla dig ajour med relevant vetenskaplig litteratur och skriva forskningsartiklar både som första- och medförfattare.

Vem är du?

Vi söker en ansvarskännande och driftig person som är positiv, flexibel och pedagogisk. Arbetet ställer höga krav på noggrannhet, planeringsförmåga, självständighet, servicevilja och ett strukturerat arbetssätt. Du arbetar på ett mycket dynamiskt sätt och har lätt att anpassa dig till omprioriteringar. Vi förväntar oss att du arbetar både självständigt och i grupp. [Textbrytning]Det är väldigt viktigt att kunna kommunicera väl med andra forskare, kliniska samarbetspartners, och kollegor om arbetet. En oerhört viktig komponent är visualisering av komplexa data för att kunna förmedla forskningsfynd till berörda parter. Du behöver ha en god samarbetsförmåga och kunna arbeta parallellt med olika projekt.

Krav:

Doktorsexamen i bioinformatik eller bioteknologi
Minst tre års erfarenhet av bioinformatiskt forskningsarbete med mänsklig mikrobiomdata på postdoktoral nivå
Dokumenterad erfarenhet av programmering i språk som R eller Python
Erfarenhet av att arbeta med bioinformatiska verktyg via Docker och Singularity eller liknande
Dokumenterad erfarenhet av arbete inom mikrobiomforskning med både 16S och shotgunmetagenomik
Erfarenhet av metodutveckling och workflowutveckling för bioinformatik
Engelska på professionell nivå

För att effektivt kunna utföra dina arbetsuppgifter är det dessutom bra om du har:

Erfarenhet av våtlabb
Erfarenhet av handledning av kandidat- och masterstudenter
Erfarenhet av assemblering och analys av virussekvenser, inkl. SARS-CoV-2

Vi kommer lägga stor vikt vid personlig lämplighet.

Vad erbjuder vi?

En kreativ och inspirerande miljö fylld av kompetens och nyfikenhet. Karolinska Institutet är ett av världens ledande medicinska universitet. Vår vision är att driva utvecklingen av kunskap om livet och verka för en bättre hälsa för alla. Här bedriver vi framgångsrik medicinsk forskning och har det största utbudet av medicinska utbildningar i Sverige. Som universitet är Karolinska Institutet även en statlig myndighet. Det innebär att du får goda förmåner genom vårt kollektivavtal, generös semester och en bra tjänstepension. Du får träna fritt i våra moderna friskvårdsanläggningar och får ersättning för läkarvård.

Placering: Solna

https://ki.se/en/research/centre-for-translational-microbiome-research-ctmr

Ansökan

Varmt välkommen med din ansökan senast den 29/8 2021.

Ansökan ska göras via rekryteringssystemet Varbi. I denna rekrytering söker med du med ditt CV utan personligt brev. I ansökningsformuläret kommer du istället att få svara på några frågor om varför du söker jobbet.

Vid tillsvidareanställning tillämpar Karolinska Institutet 6 månaders provanställning.

Vill du göra skillnad – och bidra till en bättre hälsa för alla? Sök jobb hos oss