Postdoc in Single Cell Genomics, Jens Hjerling-Leffler group, Karolinska Institutet

Vill du bidra till medicinsk forskning av toppkvalitet?

Tjänsten är placerad inom avdelningen för molekylär neurobiologi i professor Jens Hjerling-Lefflers labb vid institutionen för medicinsk biokemi och biofysik (MBB), Karolinska Institutet.

Hjerling-Lefflers grupp strävar efter att förstå hur nervsystemets utveckling under tonåren, på en celltypspecifik nivå, påverkar etiologin för psykiatriska sjukdomar. Vi arbetar med flera olika metoder, inklusive analyser av post-mortem prover och musmodeller av genetisk risk för att förstå biologisk konvergens. Vi kombinerar också transkriptomiska data med storskalig humangenetik för att undersöka de cellulära konsekvenserna av polygen ärftlighet vid schizofreni (SCZ).

Vårt labb främjar en kreativ, vänlig och inkluderande arbetsmiljö med målet att alla labbmedlemmar ska svara på spännande vetenskapliga frågor samtidigt som de uppfyller sina personliga karriärambitioner

Din roll

Vi söker en skicklig bioinformatiker med erfarenhet av databehandling, analys och visualisering av nästa generations (RNA-sekvensering, ATAC-sekvensering, encellsdata, nätverk och/eller liknande). Den ideala kandidaten brinner för att besvara biologiska frågor relaterade till hur den genetiska risken för psykiatriska sjukdomar påverkar biologin. Den framgångsrika kandidaten kommer att leda projekt som involverar analys av stora funktionella genomiska datamängder och integration med genetiska och kliniska utfallsdata. Kandidaten kommer att ha ett nära samarbete med experimentella forskare och teknisk personal i teamet och leda samarbeten i internationella konsortium. Han/hon kommer att ansvara för dataanalys, visualisering och utveckling av nya beräkningsmetoder för bearbetning och analys av högdimensionella storskaliga omics-data.

Vem är du?

För att anställas som postdoktor krävs avlagd doktorsexamen eller en utländsk examen som bedöms motsvara en svensk doktorsexamen. Detta behörighetskrav ska vara uppfyllt senast vid tidpunkten då anställningsbeslutet fattas. Det är meriterande om du har avlagt din doktorsexamen inom de tre senaste åren, om det finns särskilda skäl kan din examen ha avlagts tidigare.

Vi välkomnar ansökningar från kandidater med bakgrund som enbart är inriktad på dataanalys samt från dem som önskar kombinera experimentella och teoretiska metoder.

Kvalifikationer

Doktorsexamen inom relevanta områden (bioinformatik, genetik, neurovetenskap, matematik och/eller statistik).
Starka programmeringskunskaper i R och/eller Python
Dokumenterad stark förmåga att analysera högdimensionella data.
Dokumenterad förmåga att presentera och analysera resultat muntligt och skriftligt
Dokumenterade vetenskapliga publikationer inom relevanta områden
Nyfikenhet att lösa grundläggande biologiska frågor och entusiasm att leda nya självständiga projekt.
Förmåga att formalisera en biologisk fråga till en beräkningsmodell.
Goda kunskaper i skriftlig och muntlig engelska

Det är meriterande att sökanden har

Tidigare erfarenhet av tvärvetenskapliga projekt som kombinerar beräkningsvetenskap och biologisk vetenskap.
Kunskap om LINUX/UNIX kommandorad och terminal
Stark förståelse för statistik för högdimensionella data (starkt meriterande)
Erfarenhet av att analysera epigenetiska data (t.ex. multiomdata) och NGS (10x-plattform, Smart-Seq) och andra högkapacitets-/dimensionalitetsmetoder.
Offentligt tillgänglig kod (t.ex. GitHub)

Vad erbjuder vi?

En kreativ, internationell inspirerande miljö fylld av kompetens och nyfikenhet. Karolinska Institutet är ett av världens ledande medicinska universitet. Här bedriver vi framgångsrik medicinsk forskning och har det största utbudet av medicinska utbildningar i Sverige. På KI får du träffa forskare med olika forskningsinriktningar som jobbar tillsammans. Det är det gränsöverskridande samarbetet som bidrar till KI:s världsledande position inom forskning. Flera av de personer du möter inom vården är utbildade på KI. En nära relationen till hälso- och sjukvården är viktig för att skapa utbildning och forskning av högsta kvalitet. Som universitet är Karolinska Institutet också en statlig myndighet. Det gör att du som anställd får goda förmåner genom vårt kollektivavtal.

Placering: Solna

Ansökan

Ansökan ska bestå av följande handlingar, skrivna på engelska eller svenska:

Bevis om doktorsexamen
Ett komplett CV inkluderande disputationsdatum, avhandlingens titel, tidigare akademiska befattningar, akademisk titel, nuvarande befattning, akademiska utmärkelser samt kommittéarbete
En komplett publikationslista
En sammanfattning av nuvarande arbete (maximalt en sida)

Ansökan ska göras via rekryteringssystemet Varbi.

Vill du göra skillnad – och bidra till en bättre hälsa för alla? Sök jobb hos oss!