Postdoktor inom utveckling av beräkningsmetoder för DNA-mikroskopi-baserad spatiell omik

Vill du bidra till medicinsk forskning av toppkvalitet?

Är du intresserad av att utveckla verktyg som överbryggar beräkningsvetenskap och nukleinsyrateknik? Oavsett om din passion ligger inom beräkningar eller kartläggning av enskilda molekyler i vävnader för biomedicinska tillämpningar, vill vi höra av dig. Bli en del av vår tvärvetenskapliga grupp som postdoktor vid Karolinska Institutet och hjälp oss att förvandla sekvenseringsinstrument till mikroskop!

Din roll

Du kommer att ingå i vårt team, en ledande grupp inom DNA-nanoteknik specialiserad på att skapa molekylära verktyg för livsvetenskaplig forskning (http://www.hogberglab.net/). Du kommer att bidra till ERC Advanced Grant-projektet qScope, där du ska skapa och förbättra befintliga bioinformatiska verktyg och nätverksalgoritmer för att hjälpa oss att kartlägga RNA- eller proteinmolekyler i vävnadsprover med hjälp av en metod som kallas DNA-mikroskopi.

Denna teknik syftar till att möjliggöra rekonstruktion av biomolekylers relativa rumsliga positioner genom att uteslutande använda DNA-sekvenseringsinformation baserad på artificiella molekylära nätverk (granne-granne-interaktionsmatriser) som skapats experimentellt i provet. Detta handlar i grunden om att förvandla sekvenseraren till ett mikroskop som använder DNA-sekvenser i stället för ljus som bärare av rumslig information.

Om du är intresserad av att hjälpa oss skapa den nya generationen av lösningar för spatiell omik, sök tjänsten.

Notera även: Även om rollen fokuserar på nukleinsyror drar vårt tvärvetenskapliga arbetssätt ofta nytta av en bred beräkningsverktygslåda; kandidater som är intresserade av att överbrygga dessa projekt med insikter från närliggande områden – såsom de novo-proteindesign – för att förbättra våra molekylära system uppmuntras starkt att söka.

Vem är du?

För att anställas som postdoktor krävs avlagd doktorsexamen eller en utländsk examen som bedöms motsvara doktorsexamen. Detta behörighetskrav ska vara uppfyllt senast vid tidpunkten då anställningsbeslutet fattas. Du kan söka denna tjänst om din disputation inte är genomförd men planerad inom en snar framtid. Det är meriterande om du har avlagt din doktorsexamen inom de tre senaste åren, om det finns särskilda skäl kan din examen ha avlagts tidigare.

Utöver detta uppmuntras du att söka om du uppfyller åtminstone ett par av följande kriterier. I fallande ordning av vikt bör du:

• Ha en doktorsexamen inom något område av nukleinsyraforskning, företrädesvis med bioinformatiskt eller beräkningsvetenskapligt fokus.
• Ha expertkunskaper i att arbeta med och utveckla bioinformatiska verktyg i Python, Julia, R eller C++.
• Ha omfattande erfarenhet av NGS-dataanalys.
• Ha erfarenhet av provberedning för och sekvensering med NGS-plattformar.

Vi värdesätter en mångsidig beräkningsbakgrund; erfarenhet av strukturmodellering eller verktyg för proteindesign ses också som en välkommen tillgång i vårt diversifierade team.

Vad erbjuder vi?

Högberglab är en del av avdelningen för Molekylär systembioteknik vid Institutionen för medicinsk biokemi och biofysik vid Karolinska Institutet (KI). Labbet är för närvarande ett diversifierat team bestående av fysiker, biologer, kemister och beräkningsbiologer. Vi erbjuder en stimulerande vetenskaplig miljö och forskningsinfrastruktur i toppklass, både lokalt, på avdelningsnivå och institutionsnivå. Tjänsten erbjuder en spännande forskningsprojekt med det tydliga målet att förbättra en teknik med verklig relevans och potential för karriärmöjligheter utanför akademin.

En kreativ, internationell inspirerande miljö fylld av kompetens och nyfikenhet. Karolinska Institutet är ett av världens ledande medicinska universitet. Här bedriver vi framgångsrik medicinsk forskning och har det största utbudet av medicinska utbildningar i Sverige. På KI får du träffa forskare med olika forskningsinriktningar som jobbar tillsammans. Det är det gränsöverskridande samarbetet som bidrar till KI:s världsledande position inom forskning. Flera av de personer du möter inom vården är utbildade på KI. En nära relationen till hälso- och sjukvården är viktig för att skapa utbildning och forskning av högsta kvalitet. Som universitet är Karolinska Institutet också en statlig myndighet. Det gör att du som anställd får goda förmåner genom vårt kollektivavtal.

Placering: Solna

Ansökan

Ansökan ska bestå av följande handlingar, skrivna på engelska eller svenska:

• En komplett CV inkluderande disputationsdatum, avhandlingens titel, tidigare akademiska befattningar, akademisk titel, nuvarande befattning, akademiska utmärkelser samt kommittéarbete
• En komplett publikationslista
• En sammanfattning av nuvarande arbete (maximalt en sida)

Varmt välkommen med din ansökan senast den 22:a Mars 2026.

Ansökan ska göras via rekryteringssystemet Varbi.  

Vill du göra skillnad – och bidra till en bättre hälsa för alla? Sök jobb hos oss!