Postdoktor i bioinformatik av selektion DNA Nanostrukturer

Vill du bidra till medicinsk forskning av toppkvalitet?

Institutionen för mikrobiologi, tumör- och cellbiologi (MTC) vid Karolinska Institutet bedriver forskning och undervisning inom immunologi, infektionsbiologi, cellbiologi och cancer. MTC har cirka 40 forskargrupper och våra nyckelord är multidisciplinära, överbryggande, nationella och internationella samarbeten.

Benson-gruppen fokuserar på att kombinera DNA-nanoteknologi med selektion och sekvensering för att upptäcka DNA-strukturer som kan fungera som patogenbindare eller leverera läkemedel till specifika celler. Vi använder högkapacitetssekvensering för att övervaka selektionsprocessen och identifiera individuella kandidater som fungerar väl. Vårt laboratorium är baserat på Scilifelab, en tvärvetenskaplig forskningsmiljö som delas av Karolinska Institutet, KTH och Stockholms universitet.

Din roll

Vi söker en mycket motiverad Postdoktor som vill ansluta sig till vårt team för att utveckla nya verktyg för att analysera sekvensdata från urvalsexperiment och hjälpa oss förstå vilka DNA-nanostrukturer som gynnas av selektion.

För närvarande har vi flera dataset med upprepad sekvensering av DNA-nanostrukturernas ”genomer” från selektionsexperiment där både Oxford Nanopore och Illumina-sekvensering har använts. Dessa dataset innehåller både ”genom”-information och unika molekylära identifieringsbarcodes, vilket möjliggör släktspårning av individuella strukturer. Ditt mål är att integrera denna sekvensdata och kombinera den med referensdata från negativa selektionsexperiment för att avkoda selektionsprocessen och driva kandidatval. Detta ger dig möjlighet att utveckla helt nya verktyg för en ny typ av DNA-sekvenseringsdata.

Projektet kan även inkludera arbete med högkapacitetsstrukturprediktion för att ytterligare identifiera distinkta DNA-nanostrukturer med lovande egenskaper. Projektet kan kombineras med experimentellt arbete om detta passar den sökande.

Vem är du?

För att anställas som postdoktor krävs avlagd doktorsexamen eller en utländsk examen som bedöms motsvara en svensk doktorsexamen. Detta behörighetskrav ska vara uppfyllt senast vid tidpunkten då anställningsbeslutet fattas. Det är meriterande om du har avlagt din doktorsexamen inom de tre senaste åren, om det finns särskilda skäl kan din examen ha avlagts tidigare.

Den ideala kandidaten har nyligen tagit en doktorsexamen inom biofysik, beräkningsbiologi, bioinformatik, nanoteknologi eller ett närliggande område, med dokumenterad erfarenhet av att utveckla verktyg för att hantera sekvensdata.

Utöver ovan nämnda krav för rollen:

• Starka programmeringskunskaper (till exempel Python).
• Tidigare erfarenhet av att analysera sekvensdata.
• Utmärkta kommunikationsförmågor och en samarbetsinriktad inställning.

Meriterande för rollen:

• Dokumenterad erfarenhet av att utveckla nya datahanteringsflöden för sekvensdata.
• Erfarenhet av in vitro-selektionsdata.
• Erfarenhet av unika molekylära identifierare (UMI:s).

Vad erbjuder vi?

En kreativ, internationell inspirerande miljö fylld av kompetens och nyfikenhet. Karolinska Institutet är ett av världens ledande medicinska universitet. Här bedriver vi framgångsrik medicinsk forskning och har det största utbudet av medicinska utbildningar i Sverige. På KI får du träffa forskare med olika forskningsinriktningar som jobbar tillsammans. Det är det gränsöverskridande samarbetet som bidrar till KI:s världsledande position inom forskning. Flera av de personer du möter inom vården är utbildade på KI. En nära relationen till hälso- och sjukvården är viktig för att skapa utbildning och forskning av högsta kvalitet. Som universitet är Karolinska Institutet också en statlig myndighet. Det gör att du som anställd får goda förmåner genom vårt kollektivavtal.

Placering: Solna

Mer information: https://bensonlab.se/

Ansökan

Ansökan ska bestå av följande handlingar, skrivna på engelska eller svenska:

• Bevis om doktorsexamen
• Ett komplett CV inkluderande disputationsdatum, avhandlingens titel, tidigare akademiska befattningar, akademisk titel, nuvarande befattning, akademiska utmärkelser samt kommittéarbete
• En komplett publikationslista
• En sammanfattning av nuvarande arbete (maximalt en sida)

Varmt välkommen med din ansökan senast 2026-01-04

Ansökan ska göras via rekryteringssystemet Varbi.  

Vill du göra skillnad – och bidra till en bättre hälsa för alla? Sök jobb hos oss!