Forskningsspecialist för att studera mRNA-translationens roll vid cancer

Vill du bidra till medicinsk forskning av toppkvalitet?

Institutionen för Onkologi-Patologi söker en forskningsspecialist som ska arbeta tillsammans med Dr Ola Larsson och medarbetare för att studera mRNA-translationens roll vid cancer. Störd mRNA-translation framträder som en central aspekt i cancerprogression som ännu inte är fullständigt förstådd. Larssons forskargrupp söker de uppströms signalerna samt de nedströms effektorer som ligger bakom transkript-selektiva förändringar av translation vid cancer. Det övergripande målet är att förstå hur mRNA-translation kan riktas in i framtida cancerbehandlingar.

Ämnesbeskrivning

Genuttryck regleras post-transkriptionellt på flera nivåer, inklusive mRNA-splitsning, transport, stabilitet och translation. Reglering av translation möjliggör snabba förändringar i genuttryck som svar på interna och externa signaler, samt en strikt kontrollerad uttryckning av gener med potentiellt skadliga funktioner (t.ex. onkogener). I många fall regleras mRNA-translation på initieringsnivå och innebär därför en förändring i antalet ribosomer som syntetiserar proteiner från varje mRNA. Dessutom har vi och andra forskargrupper visat att viktiga onkogena signalvägar modulerar translation genom att justera translationselongering. Detta har utökat repertoaren av mekanismer som styr mRNA-translation vid hälsa och sjukdom.

Translation kan regleras globalt, genom att påverka translationen av mRNA transkriberat från de flesta gener på ett liknande sätt, eller selektivt, genom att rikta in sig på specifika grupper av mRNA. Specificiteten för reglering beror på egenskaper i mRNA-molekylen, ofta i de icke-translaterade regionerna (UTR), men även i den kodande regionen när reglering sker på elongeringsnivå. Reglering av translation beror på interaktioner mellan dessa RNA-egenskaper och exempelvis translationsfaktorer och RNA-bindande proteiner. En bredare förståelse av hur mRNA-translation regleras och störs vid sjukdomar saknas.

Målet med vårt forskningsprogram är att generera kunskap om organisation, specificitet och mekanismer som styr translation på transkriptom-nivå, samt hur dessa mekanismer påverkas vid t.ex. bröstcancer. Specifikt vill vi förstå om translation definierar molekylära subtyper av cancer och identifiera mekanismer som är potentiella mål för behandling. Detta kan vägleda oss mot nya terapeutiska mål för behandling av bröstcancer med dålig prognos.

Din roll

Din roll är att analysera data som beskriver transkriptionsstartpunkter och att förstå hur dessa interagerar med translationsapparaten för att modulera translations­effektivitet. Det långsiktiga målet är att förstå hur dessa förändringar underlättar cancerutveckling.

Behörighetskrav

För anställning som forskningsspecialist vid Karolinska Institutet tillämpas de behörighetskrav som anges i Riktlinjer för andra anställningar än läraranställningar vid Karolinska Institutet i förhållande till fastställd anställningsprofil.

Behörig att anställas som forskningsspecialist är den som har uppvisat vetenskaplig skicklighet och har avlagt doktorsexamen eller har utländsk examen som bedöms motsvara svensk doktorsexamen samt har dokumenterat forskningsarbete efter disputation.

Bedömningsgrunder

Det är särskilt meriterande att den sökande har uppvisat

• Tidigare erfarenhet av forskning inom mRNA-translation
• Tidigare erfarenhet av analys av polysom-/ribosomprofileringdata
• Tidigare erfarenhet av analys av nanoCAGE-data
• Utmärkta kunskaper i programmeringsspråket R
• Utmärkta kommunikationsfärdigheter (tal och skrift) på engelska
• Erfarenhet som postdoktoral forskare
• Stor vikt läggs vid personliga egenskaper

Det är meriterande att den sökande har uppvisat

• Tidigare erfarenhet av cancerbiologi
• Tidigare erfarenhet av forskning inom RNA-biologi

Det är utifrån en sammantagen helhetsbedömning av de sökandes meriter och skicklighet som Karolinska Institutet bedömer vilken av de sökande som har de bästa förutsättningarna att bidra till en positiv utveckling av verksamheten.

Vad erbjuder vi?

En kreativ och inspirerande miljö fylld av kompetens och nyfikenhet. Karolinska Institutet är ett av världens ledande medicinska universitet. Här bedriver vi framgångsrik medicinsk forskning och har det största utbudet av medicinska utbildningar i Sverige. På KI träffar du forskare med olika forskningsinriktningar som jobbar tillsammans. Det är det gränsöverskridande samarbetet som bidrar till KI:s världsledande position inom forskning. Flera av de personer du möter inom vården är utbildade på KI. En nära relationen till hälso- och sjukvården är viktig för att skapa utbildning och forskning av högsta kvalitet. Som universitet är Karolinska Institutet också en statlig myndighet. Det gör att du som anställd får goda förmåner genom vårt kollektivavtal. 

Placering: Solna

Tio skäl att välja Karolinska Institutet

Ansökan

Vi ser gärna att din ansökan är skriven på engelska, men det går också bra att ansöka på svenska. Ansökan ska innehålla följande handlingar: Intyg om doktorsexamen, CV, meriter och beskrivning av planerad forskning som presenteras i enlighet med Karolinska Institutets meritportfölj.

Varmt välkommen med din ansökan senast den 16 december.

Ansökan ska göras via rekryteringssystemet Varbi.

Vid tillsvidareanställning tillämpar Karolinska Institutet 6 månaders provanställning.

Vill du göra skillnad – och bidra till en bättre hälsa för alla? Sök jobb hos oss!