Bioinformatiker

Vill du bidra till medicinsk forskning av toppkvalitet?

Bioinformatikertjänsten är placerad i professor Richard Rosenquist Brandells forskargrupp vid MMK. Forskningen fokuserar på att tillämpa massiv parallell sekvensering och andra omikteknologier för att påvisa viktiga molekylära avvikelser vid hematologiska maligniteter och CNS-tumörer. Gruppen är placerad vid BioClinicum och består av doktorander, postdoktorala forskare, seniora forskare och bioinformatiker. Gruppen arbetar nära de medicinska enheterna Klinisk Genetik och Genomik och Hematologi vid Karolinska Universitetssjukhuset samt Science for Life Laboratory.

Din roll

Forskningsprojekten fokuserar på att analysera betydelsen av molekylära avvikelser för utvecklingen av hematologiska maligniteter, särskilt kronisk lymfatisk leukemi (KLL), den vanligaste vuxna leukemin, samt andra lymfom. Genom djupgående karaktärisering av specifika undergrupper av KLL/lymfom syftar vi till att kartlägga viktiga molekylära händelser som bidrar till sjukdomens patogenes på genom-, transkriptom-, metylom- och proteomnivå. Vid CNS-tumörer kommer fokus att vara på att utveckla multiomik-analyser på cellfritt DNA för att förbättra diagnostik och uppföljning genom att kombinera gensekvensering, low coverage whole-genome sequencing och metyleringsanalyser med fragmentomics.

Våra projekt fokuserar således på att analys av data från storskalig sekvensering med korta respektive långa läsningar, singelcellsanalys och multiomik samt att testa och implementera nya teknologier. Vi söker en självständig och motiverad person som kan sätta upp och underhålla arbetsflöden genom att implementera eller anpassa befintliga verktyg.

Slutligen syftar våra projekt till att driva utvecklingen av precisionsmedicin inom cancer. Den utsedda personen kommer att arbeta med molekylärbiologer, läkare och bioinformatiker, samt aktivt delta i nationella och internationella forskningsprojekt.

Vem är du?

Sökande bör ha en doktorsexamen inom ett relevant område, såsom bioinformatik, bioteknik, ingenjörsvetenskap, fysik eller biomedicin. Ytterligare krav är:
• Dokumenterad erfarenhet av programmering och analys av massiv parallell sekvenseringsdata och andra omikdata vid humana sjukdomar med R och Python.
• Omfattande kunskap om bästa praxis vid generering av reproducerbara dataanalysarbetsflöden.
• Erfarenhet av att hantera Linux-baserade servrar och kännedom om HPC.
• Erfarenhet av paket-/miljöhanteringssystem, exempelvis Docker, Singularity och Conda.
• Erfarenhet av att designa databaser är meriterande.
• Utmärkta kommunikationsfärdigheter och förmåga att arbeta både i samarbete med kollegor från olika områden och självständigt.
• Erfarenhet av att hantera biologiska data, helst human data.

I denna rekrytering kommer stor vikt att läggas vi personlig lämplighet. 

Vad erbjuder vi?

En kreativ, internationell och inspirerande miljö fylld av kompetens och nyfikenhet. Karolinska Institutet är ett av världens ledande medicinska universitet. Vår vision är att driva utvecklingen av kunskap om livet och verka för en bättre hälsa för alla. Här bedriver vi framgångsrik medicinsk forskning och har det största utbudet av medicinska utbildningar i Sverige. Som universitet är Karolinska Institutet en statlig myndighet. Det gör att du får goda förmåner genom vårt kollektivavtal. Medarbetare på KI erbjuds också möjlighet till ett flexibelt arbetssätt. Det innebär att om den verksamhet du jobbar i tillåter, så kan du arbeta en del av din arbetstid på distans. Du får även träna fritt i våra moderna friskvårdsanläggningar där utbildad personal finns på plats.  

Placering: Solna

Tio skäl att välja Karolinska Institutet

Klinisk genetik – Richard Rosenquist Brandells forskargrupp | Karolinska Institutet

Ansökan

Varmt välkommen med din ansökan senast den 2025-04-20.

Ansökan ska göras via rekryteringssystemet Varbi. I denna rekrytering söker du med ditt CV utan personligt brev. I ansökningsformuläret kommer du istället att få svara på några frågor om varför du söker jobbet. 

Vid tillsvidareanställning tillämpar Karolinska Institutet 6 månaders provanställning.

Vill du göra skillnad – och bidra till en bättre hälsa för alla? Sök jobb hos oss