Postdoktor i RNA-biologi och genomik

Vill du bidra till medicinsk forskning av toppkvalitet?

Institutionen för mikrobiologi, tumör- och cellbiologi (MTC) vid Karolinska Institutet bedriver forskning och undervisning inom immunologi, infektionsbiologi, cellbiologi och cancer. MTC har cirka 40 forskargrupper och våra nyckelord är multidisciplinära, överbryggande, nationella och internationella samarbeten.

Dr Claudia Kutters forskargrupp söker ansökningar om en postdoktorandtjänst (experimentell eller beräknings-/experimentell) inom området RNA-biologi, funktionell genomik och regulatorisk transkriptomik. Kutter-labbet ligger i framkant när det gäller att dechiffrera molekylära mekanismer genom vilka RNA (dvs långa icke-kodande, överföring och små RNA) reglerar gener och genomstruktur i både hälsa och sjukdomar (Sommerauer MSB 2024, Geng et al. LSA 2024, Geng et al. Genome Research 2022, Søndergaard et al. Gut, 2022, Gao et al. Genome Research 2022). Den framgångsrika kandidaten kommer att ingå i ett multidisciplinärt och samarbetande forskarteam verksamt inom områdena kromatin- och RNA-biologi, genomik och transkriptomik och CRISPR-teknologier.

Din roll

Som en nyckelmedlem i vårt labb kommer tjänsteinnehavaren att tillämpa, optimera och integrera nya transkriptomomfattande och epigenomprofileringstekniker (baserade på bulk- och encellssekvensering) tillsammans med CRISPR-baserad genteknik, biokemiska, molekylära och cellbiologiska metoder. Forskningen kommer att fokusera på hur RNA-bindande proteiner (RBP) koordinerar regulatoriska RNA under celldifferentiering och sjukdomsprogression och hur de samverkar med andra kofaktorer i däggdjurssystem genom att använda olika cellinjer, mus och mänskliga vävnader som modellsystem.

Befattningshavaren kommer att ta en stark ledning i projektdesign och förvaltning samt datagenerering, analyser och tolkning, delta i teamets allmänna uppgifter och samarbeta med andra grupper (nationella och internationella) och teammedlemmar (t. -handledare). Den sökande förväntas rapportera de vetenskapliga resultaten som leder till vetenskapliga manuskript, delta i och presentera vid vetenskapliga möten och effektivt kommunicera med kamrater. Förmågan att arbeta i en mycket tvärvetenskaplig och internationell miljö, och att engagera sig i kontinuerlig professionell utveckling är ett måste.

Befattningshavaren kommer att dra nytta av den expertis som etablerats i Kutter-labbet för att undersöka genom- och transkriptomomfattande reglering och funktionalitet. Vi använder en kombination av nästa generations sekvenseringsteknologier (både bulk och encelliga) och metoder för genetisk screening med hög genomströmning, utvecklar beräkningsmetoder och experimentella metoder. Befattningshavaren kommer att dra nytta av den samlade kunskapen om en stor gruppmiljö eftersom vi har ett nära samarbete med beräknings- och experimentella grupper vid KI, Science for Life Laboratory (SciLifeLab) och andra lokala och internationella forskargrupper. Frekventa kurser ges på campus för att ge utbildningsmöjligheter för vidareutveckling av befattningshavaren. Ytterligare professionell utbildning är tillgänglig genom sommarskolor och återkommande workshops.

Laboratoriet ligger vid SciLifeLab på Karolinska Institutets campus i Stockholm. SciLifeLab erbjuder en attraktiv forskningsmiljö, tillhandahåller toppmodern instrumentering och kärnfaciliteter, och är hem för det näst största sekvenseringsklustret i Europa. SciLifeLab är ett samarbete mellan Karolinska Institutet, Kungliga Tekniska Högskolan och Stockholms universitet. Den sammanför forskargrupper med olika bakgrunder och expertis, vilket skapar ett unikt gränssnitt mellan grundläggande biologi, genomik, bioteknik, läkemedelsupptäckt och translationell medicin.

Vem är du?

För att anställas som postdoktor krävs avlagd doktorsexamen eller en utländsk examen som bedöms motsvara en svensk doktorsexamen. Detta behörighetskrav ska vara uppfyllt senast vid tidpunkten då anställningsbeslutet fattas. Det är meriterande om du har avlagt din doktorsexamen inom de tre senaste åren, om det finns särskilda skäl kan din examen ha avlagts tidigare.

Utöver ovan nämnda krav för tjänsten:

• Vi söker en mycket motiverad forskare med en stark bakgrund inom genomik/transkriptomik, molekylärbiologi, genetik och/eller biokemi.
• Beprövade erfarenheter av eukaryot RNA-biologi, genreglering, transkriptomomfattande studier och tekniker för däggdjursvävnadsodling är viktiga.
• Den idealiska kandidaten bör vara samarbetsvillig, vetenskapligt äventyrlig, nyfikenhetsdriven och bör föra in oberoende och originella idéer i projektet.
• Alla sökande bör ha god kommunikationsförmåga och behärska engelska i tal och skrift.

Meriterande för tjänsten:

• Alla tidigare uppgifter om oberoende forskning samt produktiva interaktioner inom en multidisciplinär teammiljö (t.ex. första- och/eller medförfattarpublikationer) är fördelaktiga.
• Förkunskaper inom bioinformatik (Phyton- och/eller R-programmering för statistisk beräkning och grafik) är meriterande.

Vad erbjuder vi?

En kreativ, internationell inspirerande miljö fylld av kompetens och nyfikenhet. Karolinska Institutet är ett av världens ledande medicinska universitet. Här bedriver vi framgångsrik medicinsk forskning och har det största utbudet av medicinska utbildningar i Sverige. På KI får du träffa forskare med olika forskningsinriktningar som jobbar tillsammans. Det är det gränsöverskridande samarbetet som bidrar till KI:s världsledande position inom forskning. Flera av de personer du möter inom vården är utbildade på KI. En nära relationen till hälso- och sjukvården är viktig för att skapa utbildning och forskning av högsta kvalitet. Som universitet är Karolinska Institutet också en statlig myndighet. Det gör att du som anställd får goda förmåner genom vårt kollektivavtal.

Placering: Science for Life-laboratoriet på campus Solna

För mer information om laboratoriets arbete, besök gärna: https://www.scilifelab.se/researchers/claudia-kutter/ eller http://ki.se/en/mtc/claudia-kutter-group

Ansökan

Ansökan ska bestå av följande handlingar, skrivna på engelska eller svenska:

• Bevis om doktorsexamen
• Ett komplett CV inkluderande disputationsdatum, avhandlingens titel, tidigare akademiska befattningar, akademisk titel, nuvarande befattning, akademiska utmärkelser samt kommittéarbete
• En komplett publikationslista
• En sammanfattning av nuvarande arbete (maximalt en sida)
• Kontaktuppgifter till 2-3 referenser

Ansökan ska göras via rekryteringssystemet Varbi.

Varmt välkommen med din ansökan senast den 24 mars 2025.

Vill du göra skillnad – och bidra till en bättre hälsa för alla? Sök jobb hos oss!