Forskningsassistent inom bioinformatik med fokus på cancerimmunologi - Under tillsättning eller tillsatt, ej sökbar

Vill du bidra till medicinsk forskning av toppkvalitet?

Kom och anslut dig till Engblom-labbet! En forskningsassistentstjänst är tillgänglig inom immunologi, cancer och spatial transkriptomik, med det övergripande målet att förstå tumörassocierade immunresponser och utnyttja dessa för terapi. Engblom-labbet har nyligen utvecklat en ny metod för att studera B-celler och B-cellsreceptorer inom deras vävnadsmikromiljö med hjälp av spatial transkriptomik. Kandidaten kommer att bidra till banbrytande forskning för att lokalisera immunresponser under tumörprogression och anti-cancerterapi.

Din roll

Vi söker en forskningsassistent inom bioinformatik för ett 6 månaders projekt med möjlighet till förlängning. De huvudsakliga arbetsuppgifterna inkluderar:

• effektivisera labbets beräknings-/bioinformatikpipelines
• utföra dataanalys för pågående projekt i labbet, speciellt relaterat till anpassning av Spatial VDJ till musvävnad
• underhålla och organisera labbets kodbas (inklusive datalagring och anteckningsböcker för datadelning).
• hjälpa till med allmänna sysslor i labbet

Vem är du?

Den sökande kommer att ha ett nära samarbeta med andra studenter, doktorander, postdoktorer och forskare. Den sökande förväntas att aktivt utföra forskning inom bioinformatik, med hjälp av djurmodeller och mänskliga prover, och presentera resultat för allmän och specialiserad publik. Den sökande förväntas vara mycket engagerad, nyfiken och en bra samarbetspartner

Vårt labb har en öppning för en mycket kreativ och motiverad forskningsassistent med intresse att utföra doktorandstudier i framtiden. Vi söker en kandidat med skicklighet och dokumenterad forskningserfarenhet särskilt inom immunolog, bioinformatik, spatial transcriptomik, single-cell transkriptomik, samt Python och R programmeringsspråk (kritiskt). Vi ser gärna att kandidaten har dokumenterad erfarenhet av att utveckla neural networks. Forskningserfarenhet inom analys av ’spatial vdj/transkriptomik, long-read sekvensering, och singel-cell transkriptomik kommer betraktas som starkt meriterande. Erfarenhet av att utföra "wet lab"-experiment för att generera föregående data kommer även det att betraktas som meriterande. Kandidaten förväntas arbeta med prekliniska och kliniska data.

Tjänsten kommer att kräva självständigt arbete samt omfattande samarbete med andra experimentella grupper. Flytande i både muntlig och skriftlig engelska är ett krav. Dokumenterad förmåga att analysera och presentera resultat muntligt och skriftligt är viktigt.

Vad erbjuder vi?

En kreativ, internationell och inspirerande miljö fylld av kompetens och nyfikenhet. Karolinska Institutet är ett av världens ledande medicinska universitet. Vår vision är att driva utvecklingen av kunskap om livet och verka för en bättre hälsa för alla. Här bedriver vi framgångsrik medicinsk forskning och har det största utbudet av medicinska utbildningar i Sverige. Som universitet är Karolinska Institutet en statlig myndighet. Det gör att du får goda förmåner genom vårt kollektivavtal. Medarbetare på KI erbjuds också möjlighet till ett flexibelt arbetssätt. Det innebär att om den verksamhet du jobbar i tillåter, så kan du arbeta en del av din arbetstid på distans. Du får även träna fritt i våra moderna friskvårdsanläggningar där utbildad personal finns på plats.  

Placering

Tjänsten är placerad inom Institutionen för medicin, Solna. Institutionen består av elva avdelningar och varje avdelning består av flertalet forskargrupper. Den aktuella tjänsten är placerad inom avdelningen för immunologi och allergi i labbet lett av Dr. Camilla Engblom (SciLifeLab Fellow), inom Dr. Eduardo Villablanca’s forskargrupp. Det övergripande målet för labbet är att förstå B-cellsrelaterade mekanismer i cancer för att identifiera nya sätt att behandla tumörer. För att göra detta undersöker vi de spatiella relationerna mellan B-cellkloner och deras omkringliggande nischer inom cancervävnader med hjälp av vår egenutvecklade teknologi (Spatial VDJ). Med hjälp av etablerade och nyutvecklade algoritmer kartlägger vi B-cellsutveckling inom tumörer och identifierar potentiella tumörreglerande antikroppar för funktionella tester. Utöver labbets fokusområde har vår forskargrupp nationella och internationella samarbetsprojekt inom interaktioner mellan människa och mikrober, vaccinforskning och teknologisk utveckling. Vårt labb ämnar främja en kreativ, mångsidig och inkluderande arbetsmiljö med målet att alla labbmedlemmar undersöker och ger svar på ambitiösa och spännande vetenskapliga frågor. Labbet är beläget inom en dynamisk forskningsmiljö med ett flertal grupper som forskar på olika aspekter av allergi och autoimmuna sjukdomar (Allergi- och immunologiavdelningen vid Medicinska institutionen, Solna).

--[Video om Karolinska Institutet, hur vi alla bidrar till en bättre hälsa för alla] ---

Ansökan

Ansökan ska göras via rekryteringssystemet Varbi. I denna rekrytering söker du med ditt CV utan personligt brev. I ansökningsformuläret kommer du istället att få svara på några frågor om varför du söker jobbet. 

Vill du göra skillnad – och bidra till en bättre hälsa för alla? Sök jobb hos oss