Postdoktor inom precisionsmedicin till Karolinska Institutet

Vill du bidra till medicinsk forskning av toppkvalitet?

Avdelningen för onkologi-patologi vid SciLifeLab

Är du en högt ambitiös och motiverad individ med en passion för bioinformatik/datadriven vetenskap och precisionsmedicin? Vi söker en talangfull och entusiastisk postdoktorand med passion för bioinformatik att ansluta sig till vårt dynamiska team. Du kommer att vara en del av Kallioniemi forskargrupp. Kallioniemi-gruppen är en kreativ och inspirerande miljö full av expertis och nyfikenhet där varje forskare har möjligheter att utvecklas individuellt såväl som i team. Vår grupp fokuserar på att optimera behandlingar för enskilda cancerpatienter baserat på molekylär profilering och funktionell läkemedelstestning. Vårt mål är att utveckla ett biologi-ramsystem för att matcha riktade terapier och läkemedelskombinationer med användning av omik-profiling och läkemedelstestning. Denna position erbjuder en spännande möjlighet att bidra till spjutspetsforskning inom medicinsk vetenskap.

Ditt arbete kommer att utföras vid Science for Life Laboratory (SciLifeLab), som är en ledande nationell infrastruktur för forskning inom life science i Sverige. SciLifeLab drivs gemensamt av de fyra värduniversiteten: Karolinska Institutet, KTH (Kungliga Tekniska Högskolan), Stockholms universitet och Uppsala universitet, och det har faciliteter vid fyra andra universitet över hela Sverige. Över 1000 personer arbetar på SciLifeLab, antingen i forskargrupper eller i infrastrukturfaciliteter, de flesta av dem på KI Solna campus och i Uppsala. Denna position är belägen på Solna campus.

Din roll

Din uppgift är att vara en del av och bidra till en ledande forskningsmiljö inom funktionell precisionsmedicin. Arbetet kommer att fokusera på att använda dataset i laboratoriet och bioinformatiska metoder för att identifiera nya behandlingsmöjligheter för patienter med cancer. Du kommer även att generera och analysera data på enskilda cellnivå. Mer specifikt kommer du att:

Analysera och tolka komplexa biologiska dataset, särskilt inom ramen för precisionsmedicin. Implementera avancerade bioinformatikpipeliner för att analysera data på enskild cellnivå och fler omiks-nivå.
Utveckla innovativa metoder för kvalitetskontroll, harmonisering och integration av dataset för att härleda meningsfulla insikter från olika dataset.
Designa ex vivo- och in silico-experiment, guida laboratoriestudier, erbjuda stöd för dataanalys och bidra med meningsfull analys till forskningspublikationer.
Hålla dig uppdaterad om de senaste framstegen inom bioinformatik och medicinsk vetenskap för att införa nya metoder i teamet.
Sprida resultaten i vetenskapliga publikationer och genom offentligt tillgängliga visualiseringsverktyg för data.
Presentera arbetet vid gruppmöten, internt på KI, och på vetenskapliga konferenser.

Vem är du?

För att anställas som postdoktor krävs avlagd doktorsexamen eller en utländsk examen som bedöms motsvara doktorsexamen. Detta behörighetskrav ska vara uppfyllt senast vid tidpunkten då anställningsbeslutet fattas. Det är meriterande om du har avlagt din doktorsexamen inom de tre senaste åren, om det finns särskilda skäl kan din examen ha avlagts tidigare.

Krav:

En doktorsexamen inom ett relevant område som farmaceutiska vetenskaper, medicinska vetenskaper, biologiska vetenskaper eller datavetenskap. Din doktorsexamen bör inte vara äldre än 3 år från startdatumet för positionen.
Demonstrerad expertis inom bioinformatik, med särskild tonvikt på analys av enskilda cell- och fler omiks-datauppsättningar.
Färdighet i programmeringsspråk som vanligtvis används inom bioinformatik, såsom R, Python eller MatLab.
God förståelse för statistiska metoder och deras tillämpning på biologisk data.
Kännedom om tekniker för dataharmonisering, särskilt i sammanhanget att integrera olika datauppsättningar från olika källor.
Utmärkta kommunikationsfärdigheter och förmåga att samarbeta effektivt med tvärvetenskapliga team.
Ett bevisat framgångsrikt meritlista av högt anseende vetenskapliga publikationer.

Ytterligare färdigheter (önskvärda):

Bakgrund inom cancer-genomik, immunologi eller andra medicin relaterade områden.
Kunskap om maskininlärning och dess tillämpningar inom biologisk dataanalys.
Erfarenhet av bioinformatikverktyg och databaser som vanligtvis används inom medicinsk forskning.
Starka färdigheter inom datavisualisering för effektiv kommunikation av forskningsresultat.

Vad erbjuder vi?

En kreativ, internationell inspirerande miljö fylld av kompetens och nyfikenhet. Karolinska Institutet är ett av världens ledande medicinska universitet. Här bedriver vi framgångsrik medicinsk forskning och har det största utbudet av medicinska utbildningar i Sverige. På KI får du träffa forskare med olika forskningsinriktningar som jobbar tillsammans. Det är det gränsöverskridande samarbetet som bidrar till KI:s världsledande position inom forskning. Flera av de personer du möter inom vården är utbildade på KI. En nära relationen till hälso- och sjukvården är viktig för att skapa utbildning och forskning av högsta kvalitet. Som universitet är Karolinska Institutet också en statlig myndighet. Det gör att du som anställd får goda förmåner genom vårt kollektivavtal.

Placering: SciLifeLab, Solna

www.scilifelab.se/researchers/olli-kallioniemi/

Tio skäl att välja Karolinska Institutet

Ansökan

Ansökan ska bestå av följande handlingar, skrivna på engelska eller svenska:

En komplett CV inkluderande disputationsdatum, avhandlingens titel, tidigare akademiska befattningar, akademisk titel, nuvarande befattning, akademiska utmärkelser samt kommittéarbete
En komplett publikationslista
En sammanfattning av nuvarande arbete (maximalt en sida)

Varmt välkommen med din ansökan senast den 30 november 2023.

Ansökan ska göras via rekryteringssystemet Varbi.

Anställningen är 2 år, med möjlighet till förlängning 1+1 år.

Vill du göra skillnad – och bidra till en bättre hälsa för alla? Sök jobb hos oss