1-2 Postdoctoral positions in computational splicing analysis

Vill du bidra till medicinsk forskning av toppkvalitet?

Ziegenhain-labbet arbetar med att belysa centrala molekylära processer i mänskliga celler, särskilt när det gäller kontrollen av alternativ splitsning av transkriberade mRNAs. För detta utvecklar och använder labbet toppmoderna metoder för enkelcellssekvensering och datavetenskapliga metoder. Forskningsgruppen är en del av enheten för medicinska systems bioteknik vid institutionen för medicinsk biokemi och biofysik (MBB).

Din roll

Vi söker en mycket motiverad och entusiastisk postdoktor för att använda olika typer av toppmoderna data inom single-cell genomik för att identifiera sjukdomsrelaterade mönster av alternativ splitsning av mRNA molekyler. Inom ditt projekt kommer du att fokusera på att identifiera förändringar i mRNA-splitsning som är specifika för olika celltyper i schizofreni. RNA-bindande proteiner kan vara en särskilt påverkande faktor, som vi ämnar undersöka funktionellt med hjälp av en CRISPRi-screening. Ytterligare projekt för att klarlägga sjukdomsrelaterade förändringar i splitsning är av intresse för vår labb, särskilt med avseende på cancer som glioblastom eller cancer i det hematopoetiska systemet.

Vem är du?

För att anställas som postdoktor krävs avlagd doktorsexamen eller en utländsk examen som bedöms motsvara doktorsexamen. Detta behörighetskrav ska vara uppfyllt senast vid tidpunkten då anställningsbeslutet fattas. Det är meriterande om du har avlagt din doktorsexamen inom de tre senaste åren, om det finns särskilda skäl kan din examen ha avlagts tidigare.

Vi letar efter en mycket motiverad och självgående kandidat med en stark meritlista och relevant erfarenhet under doktorandtiden. Den framgångsrika sökande förväntas ha en bakgrund och ett starkt intresse för ett eller flera av följande områden: beräkningsbiologi, statistik, bioinformatik eller single-cell genomik. God kommunikation och förmåga att samarbeta i team, samt bra engelska i tal och skrift, är nödvändiga.

Du har en doktorsexamen inom beräkningsbiologi, statistik, datavetenskap eller liknande.
Kompetens inom datorbaserad analys med användning av R/Python/Rust eller liknande.
Framgångsrik publiceringshistorik.
Erfarenhet inom high performance computing kommer att betraktas som en fördel.
Erfarenhet av analyser av alternativ splitsning kommer att betraktas som en fördel.
Erfarenhet inom single-cell genomik eller spatial genomik kommer att betraktas som en fördel.

Vad erbjuder vi?

En kreativ, internationell inspirerande miljö fylld av kompetens och nyfikenhet. Karolinska Institutet är ett av världens ledande medicinska universitet. Här bedriver vi framgångsrik medicinsk forskning och har det största utbudet av medicinska utbildningar i Sverige. På KI får du träffa forskare med olika forskningsinriktningar som jobbar tillsammans. Det är det gränsöverskridande samarbetet som bidrar till KI:s världsledande position inom forskning. Flera av de personer du möter inom vården är utbildade på KI. En nära relationen till hälso- och sjukvården är viktig för att skapa utbildning och forskning av högsta kvalitet. Som universitet är Karolinska Institutet också en statlig myndighet. Det gör att du som anställd får goda förmåner genom vårt kollektivavtal.

Placering: Biomedicum, Solna

Link to the lab website: https://ki.se/en/mbb/ziegenhain-lab

Link to the department website: https://ki.se/en/mbb/department-of-medical-biochemistry-and-biophysics

Ansökan

Ansökan ska bestå av följande handlingar, skrivna på engelska eller svenska:

En komplett CV inkluderande disputationsdatum, avhandlingens titel, tidigare akademiska befattningar, akademisk titel, nuvarande befattning, akademiska utmärkelser samt kommittéarbete
En komplett publikationslista
En sammanfattning av nuvarande arbete (maximalt en sida)
Personligt brev

Varmt välkommen med din ansökan senast den 3e december 2023.

Ansökan ska göras via rekryteringssystemet Varbi.

Vill du göra skillnad – och bidra till en bättre hälsa för alla? Sök jobb hos oss