Postdoktor i bioinformatik för proteom precisionsmedicin till Karolinska Institutet - Under tillsättning eller tillsatt, ej sökbar
Denna annons är inte tillgänglig!
Vill du bidra till medicinsk forskning av toppkvalitet?
Karolinska Institutet, Institutionen för onkologi-patologi, Lehtiö forskargrupp
Vid institutionen för onkologi-patologi bedrivs grundläggande, translationell och klinisk forskning och utbildningsverksamhet relaterad till cancer. Cirka 300 personer från över 40 länder arbetar för närvarande på avdelningen. Ett 30-tal forskargrupper med olika cancerforskningsprofiler är involverade och vi har cirka 110 doktorander. Institutionen för onkologi-patologi ansvarar för grundkurser i patologi, onkologi och rättsmedicin för läkarstudenter, samt för tumörbiologikurser för biomedicinstudenter och patologikurser för optiker.
Vill du bidra genom att koppla den senaste cancerproteomforskningen till patientnytta?
Precisionsmedicin syftar på att skräddarsy medicinsk behandling efter varje patients individuella egenskaper. Vi söker en passionerad bioinformatiker som är intresserad av konceptet precisionsmedicin för att arbeta med olika typer av omicsdata, med fokus på klinisk masspektrometribaserad proteomikdata. Arbetet kommer att omfatta att definiera och förstå biologin bakom olika brösttumörundergrupper, hur de relaterar till kliniskt utfall och hur denna information kan användas för att vägleda terapibeslut.
Tjänsten kommer att placeras i forskargruppen för cancerproteomik masspektrometri som leds av professor Janne Lehtiö vid Science for Life Laboratory (SciLifeLab). Lehtiö-gruppen är en translationell grupp som syftar till att förbättra cancerbehandlingen med hjälp av multi-omics tumördataanalys. Gruppmedlemmarna är från olika discipliner som arbetar som ett team för att studera gener och proteiner i samband med biologiska nätverk, förstå hur tumörmolekylära förändringar påverkar proteomet och upptäcka nya sjukdomsbiomarkörer som kan utnyttjas terapeutiskt. Forskare och ingenjörer i vår grupp arbetar nära tillsammans med en mängd olika teknologier för att generera ny kunskap om sjukdomens biologi och implementera verktyg för att stödja det kliniska beslutsfattandet i onkologisk miljö.
SciLifeLab är ett nationellt infrastruktur- och forskningscenter inom teknologidriven biovetenskap och Karolinska Institutet är ett av de fyra grundande universiteten för SciLifeLab. Vi erbjuder ett mycket stimulerande och mångsidigt arbete i ett team av mycket motiverade medarbetare med expertis inom spjutspetsteknik.
Din roll
Vi söker en mycket motiverad postdoc i bioinformatik, intresserad av canceromics dataanalys av kliniska kohorter som kännetecknas av masspektrometribaserad proteomik. Tjänsten kräver gedigen expertis inom genomik, transkriptomik och/eller proteomik dataanalys och kommunikationsförmåga och vilja att arbeta i en teammiljö. Den nuvarande positionen erbjuder stora möjligheter för innovativ forskning som kombinerar proteomik och genomikdata, tillsammans med en dedikerad grupp forskare. Postdoktorn kommer att arbeta med integrativ och translationell analys av flera nivåer av omics-data som härrör från bröstcancerkohorter. Fokus kommer att ligga på att utveckla och tillämpa 'omics'-metoder på biologiskt/kliniskt orienterade forskningsfrågor och att analysera inhämtad data samt att validera resultaten med hjälp av offentliga data. Detta inkluderar både att tillämpa etablerade dataanalyssteg samt att undersöka nya strategier och lösningar för analys av kvantitativa biologiska data.Vem är du?
För att anställas som postdoktor krävs avlagd doktorsexamen eller en utländsk examen som bedöms motsvara doktorsexamen. Detta behörighetskrav ska vara uppfyllt senast vid tidpunkten då anställningsbeslutet fattas. Det är meriterande om du har avlagt din doktorsexamen inom de tre senaste åren, om det finns särskilda skäl kan din examen ha avlagts tidigare.
Kvalifikationer
• Doktorsexamen i biologi, medicin, bioinformatik, datavetenskap, matematisk statistik eller annat relevant område. • Dokumenterad erfarenhet av bioinformatik, inklusive erfarenhet av t.ex. NGS, MS-baserad proteomik eller analys av data från andra genererande metoder med hög genomströmning/högdimensionalitet. • Dokumenterad erfarenhet av maskininlärningsmetoder såsom oövervakad klustring och övervakad klassificering av prover. • Arbetslivserfarenhet inom systembiologi/systemmedicin, storskalig dataanalys, integration och visualisering. • Programmeringserfarenhet i: Python och/eller R • Kunskaper i statistiska metoder • Förståelse för experimentella cell- och molekylära våtlabbmetoder. • Förmåga att tolka omicsdata i ett biologiskt sammanhang • Utmärkt kommunikationsförmåga • Behärskar engelska språket flytandeYtterligare meriter
• Kunskap och arbetslivserfarenhet inom MS-baserad proteomik • Kunskap och arbetslivserfarenhet av bröstcancer och trippelnegativ bröstcancerbiologi • Kunskaper om cancerbiologi och aktuell translationell cancerforskning • Erfarenhet av att bygga och hantera interaktiva användarvänliga webbaserade visualiseringsverktyg är ett plus. Då tjänsten innebär ett nära samspel med flera forskare läggs vikt vid personliga färdigheter som: • Mycket god samarbetsförmåga • Utmärkt kommunikationsförmåga och analytisk förmåga • Nyfiken och sugen på att lösa biologiska frågorVad erbjuder vi?
En kreativ, internationell inspirerande miljö fylld av kompetens och nyfikenhet. Karolinska Institutet är ett av världens ledande medicinska universitet. Här bedriver vi framgångsrik medicinsk forskning och har det största utbudet av medicinska utbildningar i Sverige. På KI får du träffa forskare med olika forskningsinriktningar som jobbar tillsammans. Det är det gränsöverskridande samarbetet som bidrar till KI:s världsledande position inom forskning. Flera av de personer du möter inom vården är utbildade på KI. En nära relationen till hälso- och sjukvården är viktig för att skapa utbildning och forskning av högsta kvalitet. Som universitet är Karolinska Institutet också en statlig myndighet. Det gör att du som anställd får goda förmåner genom vårt kollektivavtal.
Placering: Science for Life Laboratory i Solna
Tio skäl att välja Karolinska Institutet
Lehtiö Lab (lehtiolab.github.io)
Ansökan
Ansökan ska bestå av följande handlingar, skrivna på engelska eller svenska:
- En komplett CV inkluderande disputationsdatum, avhandlingens titel, tidigare akademiska befattningar, akademisk titel, nuvarande befattning, akademiska utmärkelser samt kommittéarbete
- En komplett publikationslista
- En sammanfattning av nuvarande arbete (maximalt en sida)
Varmt välkommen med din ansökan senast den 8 juni 2023.
Ansökan ska göras via rekryteringssystemet Varbi.
Anställningen är på 2 år med möjlighet till förlängning. 1+1 år.
Vill du göra skillnad – och bidra till en bättre hälsa för alla? Sök jobb hos oss
| Anställningsform | Tidsbegränsad anställning |
|---|---|
| Anställningens omfattning | Heltid |
| Antal lediga befattningar | 1 |
| Sysselsättningsgrad | 100 % |
| Ort | Solna |
| Län | Stockholms län |
| Land | Sverige |
| Referensnummer | STÖD 2-2183/2023 |
| Kontakt |
|
| Facklig företrädare |
|
| Publicerat | 2023-05-25 |
| Sista ansökningsdag | 2023-06-08 |