Karolinska Institutet, Institutionen för mikrobiologi, tumör- och cellbiologi, Albert

Vill du bidra till medicinsk forskning av toppkvalitet?

Institutionen för mikrobiologi, tumör-och cellbiologi (MTC) vid Karolinska Institutet i Solna bedriver forskning och undervisning inom immunologi, infektionsbiologi, cellbiologi och cancer. Våra nyckelord är tvärvetenskaplighet, kliniskt förankrad grundforskning samt nationellt och internationellt samarbete. Vi söker nu en ny medarbetare med kompetens inom områdena bioinformatik, mikrobiologi, genomik, och programmering för en roll som bioinformatiker till forskargruppen för Jan Albert.

Om forskargruppen

Jan Alberts forskargrupp är  placerad vid Klinisk Mikrobiologi på Karolinska Universitetssjukhuset och samarbetar mycket nära med enheten Clinical Genomics (https://www.scilifelab.se/facilities/clinical-genomics-stockholm). Clinical Genomics är en nationell infrastruktur vid SciLifeLab med uppdrag att i samverkan med svensk sjukvård utveckla och implementera avancerade tester baserad på next generation sekvensering (NGS) inom sjukvården.

Din roll

Arbetet som bioinformatiker kommer att innebära nära samarbete med andra bioinformatiker, läkare, molekylärbiologer och andra specialister i konstellationen. Vi kan erbjuda en spännande arbetsmiljö där målsättningen är att långsiktigt förbättra patientvården och även bedriva translationell forskning. Vi erbjuder även utmanande arbetsuppgifter och en gruppkänsla där alla arbetar mot samma mål. Tekniskt sätt ligger vårt arbete i absolut världsklass och vi jobbar aktivt med att testa gränser och vidareutveckla vår verksamhet.

I rollen ingår bland annat att:

  • Utveckla bioinformatiska analysflöden för mikrobiologisk diagnostik och forskning.
  • Utvärdera och implementera nya analysverktyg, speciellt för mikrobiologisk metagenomik och helgenomsekvensering av SARS-CoV-2
  • Delta i analys av patientprover i flera pågående forskningsprojekt och kliniska implementationsprojekt

Vem är du?

Vi söker dig som har examen inom life science och dokumenterad kompetens och erfarenhet av utveckling av bioinformatiska analysflöden inom området storskalig DNA sekvensering (NGS).

Stor vikt kommer att läggas vid personliga egenskaper som främjar internt och externt samarbete.

Krav för rollen:

  • Utmärkta kunskaper i bioinformatik inom genomik och storskalig DNA sekvensering (NGS)
  • Mycket goda programmeringskunskaper i Python
  • Erfarenhet av arbete i linux-miljö
  • Obehindrat behärska svenska och engelska i skrift och tal

Meriterande för rollen:

Vi ser gärna att du har några eller flera av nedanstående meriter:

  • Disputerad inom relevant life science ämnesområde
  • Erfarenhet av arbete i Nextflow
  • Erfarenhet av arbete med Docker/Singularity/Podman teknologier
  • Erfarenhet av att leverera strukturerad kod
  • Erfarenhet av arbete med system för versionskontroll (tex git)

Vad erbjuder vi?

En kreativ och inspirerande miljö fylld av kompetens och nyfikenhet. Karolinska Institutet är ett av världens ledande medicinska universitet. Vår vision är att driva utvecklingen av kunskap om livet och verka för en bättre hälsa för alla. Här bedriver vi framgångsrik medicinsk forskning och har det största utbudet av medicinska utbildningar i Sverige. Som universitet är Karolinska Institutet även en statlig myndighet. Det innebär att du får goda förmåner genom vårt kollektivavtal, generös semester och en bra tjänstepension. Du får träna fritt i våra moderna friskvårdsanläggningar och får ersättning för läkarvård.

Placering: Solna

Ansökan

Varmt välkommen med din ansökan senast 2021-06-16

Tjänsten är en visstidsanställning på 12 månader med eventuell möjlighet till förlängning.

Ansökan ska göras via rekryteringssystemet Varbi. I denna rekrytering söker med du med ditt CV utan personligt brev. I ansökningsformuläret kommer du istället att få svara på några frågor om varför du söker jobbet. 

Vill du göra skillnad – och bidra till en bättre hälsa för alla? Sök jobb hos oss

Anställningsform Visstidsanställning längre än 6 månader
Anställningens omfattning Heltid
Tillträde Enligt överenskommelse
Löneform Månadslön
Antal lediga befattningar 1
Sysselsättningsgrad 100 %
Ort Solna
Län Stockholms län
Land Sverige
Referensnummer STÖD 2-2801/2021
Kontakt
  • Jan Albert, jan.albert@ki.se
Facklig företrädare
  • Henry Wölling, SEKO, henry.wolling@ki.se
  • Carina Eklund, OFR, carina.eklund@ki.se
  • Taher Darreh-Shori, SACO, taher.darreh-shori@ki.se
Publicerat 2021-06-08
Sista ansökningsdag 2021-06-16

Tillbaka till lediga jobb