Vill du bidra till medicinsk forskning av toppkvalitet?

Vi söker en forskningsassistent som kommer att arbeta på KI Psychiatric Genomics Institute (KI-PGI), som leds av Professor Patrick Sullivan. KI-PGI är ett forskningsprogram på Institutionen för medicinsk epidemiologi och biostatistik (MEB), som tilldelats ett 10-årigt forskningsanslag från Vetenskapsrådet. KI-PGI utgår från grundläggande forskningsresultat inom genomik och kartlägger sedan dess implikationer för patienter, läkare och hjärnforskare. Prof Sullivan leder det internationella samarbetet inom Psychiatric Genomics Consortium (https://www.med.unc.edu/pgc/), som är en av de mest innovativa och produktiva forskningsinitiativen hittills inom det psykiatriska fältet. Vi har omfattande samarbeten och förutom de ca 150 institutioner som är involverade i PGC, har vi starka och aktiva samarbeten med ett 10-tal framstående forskargrupper inom genetik, psykiatri, neurovetenskap och funktionell genomik. Vi har etablerat långsiktiga samarbeten såväl inom KI som med forskningsinstitut i Europa, USA och Australien. Vi har flera stora nya dataset. Dessa nyligen publicerade artiklar beskriver våra insatser inom psykiatrisk genomik, funktionell genomik, identifiering av specifika celltyper i hjärnan som är associerade med schizofreni (initial studie och replikation) (Nat. Genet. https://www.nature.com/articles/s41588-018-0129-5, https://www.nature.com/articles/s41588-020-0610-9), PGC:s arbete och en genomgång av forskningområdet (https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0092867419300480?via=ihub). Dessa är bara en del av de forskningsprojekt som pågår.

De övergripande målen för KI-PGI är: att på populationsnivå, förstå hur gener och miljö agerar och samverkar för att påverka risken för allvarliga psykiatriska störningar (t.ex. schizofreni och svår depression). Med vilka molekylära och cellulära mekanismer verkar dessa gener? Vi har data från stora fall-kontrollstudier om schizofreni, där alla deltagare har utvärderats med omfattande genomvid SNParray-analys, analys av kopienummervarianter (CNVs), helexom- och helgenomsekvensering, samt omfattande information från nationella hälsoregister. Större studier pågår som inbegriper bl.a. en utvidgning av den svenska schizofrenistudien (S3), Genomic Aggregation Project in Sweden (GAPS) och TRYGGVE2 (en satsning på att samordna psykiatrisk genomik och nationella registerdata i Danmark, Norge och Sverige). Dessa studier är finansierade av forskningsanslag från Vetenskapsrådet, NIH/NIMH och EU Horizon 2020.

Din roll

Vi söker en exceptionell och innovativ person till vårt team. Vi har en stor mängd data och behöver en data scientist på professionell nivå för att maximera vår förståelse för den data vi har samlat in och för att identifiera nya data som vi behöver skapa. Du bör ha ett starkt intresse och vilja bidra till ökad kunskap om allvarliga psykiatriska sjukdomar och hur vi kan förbättra människors liv. Du kommer att vara en del av KI-PGI-teamet och bedriva forskning inom genomik och funktionsgenomik inom ramen för allvarliga psykiatriska sjukdomar, genom att dra nytta av "multi-omic"-metoder och/eller maskininlärning vid analys av högdimensionella och komplexa registerdata.

Detta är en position på tre månader med möjlighet till förlängning. För mer information vänligen
kontakta Lu Yi. Se e-postadress nedan.

Vem är du?

• Sökande ska ha en masterexamen i datavetenskap, fysik, matematik, ingenjörsvetenskap/teknik,
biostatistik eller genetik. Vi kommer även att överväga de med motsvarande examen inom andra
områden men som har avancerade och relevanta datavetenskapliga färdigheter (t.ex.
maskininlärning).
• Sökande bör ha betydande tidigare erfarenhet av professionell analys av flera typer av moderna
genomiska och funktionell genomiska dataset. Dessa kan inkludera: GWAS, exom-sekvensering,
helgenomsekvensering, RNA-sekvensering.
• Modern genomik kräver avancerade färdigheter i programmering (t.ex. R, python, SAS), användning av standardprogram (t.ex. PLINK, GATK), flexibelt kunna hantera stora dataset, bioinformatisk integration och pathway-analys.
• Kunskap om genomik för komplexa tillstånd/sjukdomar är mycket viktigt. Kunskap om psykiatrisk
genomik är meriterande men inte ett krav.
• Sökande ska vara kollegial och erfaren i att arbeta effektivt i ”team science” -sammanhang såväl som självständigt.
• För att vara en framgångsrik medlem i Sullivan-teamet behöver du ha mycket goda organisatoriska färdigheter och vara bra på att göra många saker samtidigt och ha god problemlösningsförmåga.
• Utmärkt muntlig och skriftlig kommunikationsförmåga på engelska krävs samt god erfarenhet av
vetenskapligt skrivande. Ansökan på engelska är önskvärd men inget krav.

Vad erbjuder vi?

En kreativ och inspirerande miljö fylld av kompetens och nyfikenhet. Karolinska Institutet är ett av världens ledande medicinska universitet. Vår vision är att driva utvecklingen av kunskap om livet och verka för en bättre hälsa för alla. Här bedriver vi framgångsrik medicinsk forskning och har det största utbudet av medicinska utbildningar i Sverige. Som universitet är Karolinska Institutet även en statlig myndighet. Det innebär att du får goda förmåner genom vårt kollektivavtal, generös semester och en bra tjänstepension. Du får träna fritt i våra moderna friskvårdsanläggningar och får ersättning för läkarvård.

Placering: Solna

Ansökan

Varmt välkommen med din ansökan!

Ansökan ska göras via rekryteringssystemet Varbi. 

Vid tillsvidareanställning tillämpar Karolinska Institutet 6 månaders provanställning.

Vill du göra skillnad – och bidra till en bättre hälsa för alla? Sök jobb hos oss

Anställningsform Visstidsanställning 3-6 månader
Anställningen avslutas
Anställningens omfattning Heltid
Tillträde Enligt överenskommelse
Löneform Månadslön
Antal lediga befattningar 1
Sysselsättningsgrad 100%
Ort Stockholm
Län Stockholms län
Land Sverige
Referensnummer STÖD 2-1650/2021
Kontakt
  • Lu Yi, lu.yi@ki.se
  • Carina Olofsson Moreno, carina.olofsson.moreno@ki.se
Facklig företrädare
  • Henry Wölling, SEKO, henry.wolling@ki.se
  • Ann Almqvist, SACO, ann.almqvist@ki.se
  • Niklas Andersson, OFR, niklas.andersson@ki.se
Publicerat 2021-04-01
Sista ansökningsdag 2021-04-17

Tillbaka till lediga jobb