1-2 Bioinformatiker inom cancergenomik

Institutionen för medicinsk epidemiologi och biostatistik bedriver forskning inom epidemiologi och biostatistik inom ett brett spektrum av områden inom biomedicinsk vetenskap. Institutionen är bland de största inom sitt område i Europa och har särskilt starka forskningsprofiler inom psykiatrisk, cancer-, reproduktiv, pediatrisk, farmakologisk, genetisk och geriatrisk epidemiologi, ätstörningar, precisionsmedicin, och biostatistik.

En del av framgången för institutionen beror på vår samarbetsanda, där en stor bidragande faktor är att forskare vid institutionen delar och samfinansierar gemensamma resurser (som t.ex. IT och en tillämpad biostatistikgrupp). Institutionen ligger på campus Solna. Mer information finns på http://ki.se/meb.

Vill du bidra till medicinsk forskning av toppkvalitet?

Vi letar efter 1-2 bioinformatiker som kommer att arbeta med cancergenomikdata i ProBio-studien (https://www.probiotrial.org). ProBio är en prospektiv klinisk prövning som undersöker om behandlingsval baserat på en biomarkörsignatur kan ge bättre behandling för patienter med metastaserad kastrationsresistent prostatacancer. Biomarkörsignaturen identifieras genom riktad sekvensering av DNA från döende cancerceller anrikade från plasma, så kallat cirkulerande tumör-DNA. ProBio inkluderar för närvarande patienter i Sverige och Belgien och kommer att expandera till andra europeiska länder under 2020. Cancer Genomics-teamet vid MEB, som är en del av Henrik Grönbergs forskargrupp, utför prospektiv genomisk profilering för ProBio och flera andra prospektiva kliniska studier inklusive ALASCCA-studien (https://ki.se/mmk/alascca-studien). Cancer Genomics-teamet leds av Johan Lindberg och består av en postdoc, tre bioinformatiker och tre labbingenjörer.

Din roll

Kandidaten kommer att komplettera den nuvarande informatikpersonalen och utföra varierade arbetsuppgifter, inklusive; utvärdera prospektivt genererade data innan de tillämpas i de kliniska prövningarna; arbeta med utveckling av algoritmer; implementera publicerad mjukvara från andra forskargrupper i den etablerade analysinfrastrukturen; deltar i vetenskapliga diskussioner. Detta är en anställning på 1 årmed möjlighet till förlängning. Vid frågor om tjänsten, se kontaktuppgifter nedan i annonsen till Johan Lindberg.

Vem är du?

Kvalificerad att är en person som har fått en magisterexamen i bioinformatik eller beräkningsbiologi.

Andra krav inkluderar:

1. Erfarenhet från att arbeta i en Linux / Unix-miljö.

2. Programmeringserfarenhet i Python och R.

3. Erfarenhet av att ha arbetat med sekvenseringsdata från Illuminainstrument.

För att lyckas i miljön måste kandidaten ha förmågan att arbeta självständigt, god samarbetsförmåga, ha ambitioner och ta initiativ. Vänligen inkludera två referenser i din ansökan.

Vad erbjuder vi?

En kreativ och inspirerande miljö fylld av kompetens och nyfikenhet. Karolinska Institutet är ett av världens ledande medicinska universitet. Vår vision är att driva utvecklingen av kunskap om livet och verka för en bättre hälsa för alla. Här bedriver vi framgångsrik medicinsk forskning och har det största utbudet av medicinska utbildningar i Sverige. Som universitet är Karolinska Institutet även en statlig myndighet. Det innebär att du får goda förmåner genom vårt kollektivavtal, generös semester och en bra tjänstepension. Du får träna fritt i våra moderna friskvårdsanläggningar och får ersättning för läkarvård.

Placering: Solna

Ansökan

Ansökan ska göras via rekryteringssystemet Varbi.

Vid tillsvidareanställning tillämpar Karolinska Institutet 6 månaders provanställning.

Vill du göra skillnad – och bidra till en bättre hälsa för alla? Sök jobb hos oss