Vill du bidra till att förbättra människors hälsa?

Vi söker två bioinformatiker för att arbete med avancerad genomik i gränslandet mellan akademisk forskning och klinisk diagnostik inom cancerområdet.

Detta är en spännande möjlighet för dig som vill jobba med genomik inom avancerad forskning och precisionsdiagnostik. Vi erbjuder en spännande, interdisciplinär miljö nära akademi och sjukvård. Arbetet vi gör har en dramatisk patientnytta redan idag, och vårt uppdrag är att se till att vi fortsätter skapa omedelbar samhällsnytta även framöver.

Avdelning

Enheten Clinical Genomics (http://www.scilifelab.se/facilities/clinical-genomics-stockholm/) är en nationell forskningsinfrastruktur vid Science for Life Laboratory (SciLifeLab) med uppdrag att bidra till implementeringen av precisiondiagnostik och precisionmedicin i Sverige. Tillsammans med forskare och vårdgivare i Sverige utför vi avancerade genomiska analyser (storskalig DNA sekvensering) och jobbar för att utveckla och implementera de avancerade testerna inom sjukvården. Syftet är att säkerställa möjlighet till världsledande forskning och att diagnostiken i Sverige ligger i internationell framkant.

Vi jobbar i nära samarbete med genetiker, molekylärbiologer, läkare och andra vårdaktörer, både på SciLifeLab och hos olika vårdgivare i Sverige. Vårt team består av ca 25 medarbetare med bred kompetens inom genomik, bioinformatik, mjukvaruutveckling, IT och kvalitetssäkring. Vi har en top-notch teknisk infrastruktur för genomik, som vi löpande vidareutvecklar. Vi kan erbjuda en spännande arbetsmiljö, ett arbete där målsättningen är att långsiktigt förbättra den vård patienter erhåller, utmanande arbetsuppgifter och en gruppkänsla där alla arbetar mot samma mål. Tekniskt sett ligger vårt arbete i absolut världsklass och vi jobbar aktivt med att testa gränser och vidareutveckla vår verksamhet.

Din roll

Arbetsuppgifterna definieras utifrån kompetens och intresse och inkluderar en kombination av bland annat:

  • Utveckla bioinformatiska analysflöden för cancergenomik
  • Delta i forskningsprojekt med interna och externa (nationella och internationella) samarbetspartner
  • Delta i analys och tolkning av kliniska patientfall, tex inom kliniska prövningar och diagnostik
  • Förbereda bioinformatiska analyssvar och rapporter
  • Bidra till att öka den övriga personalens kunskaper inom bioinformatik

Vem är du?

Kravprofil

  • Examen inom molekylära livsvetenskaper med inriktning bioinformatik, datavetenskaper eller annan dokumenterad kunskap inom bioinformatik
  • Erfarenhet av NGS bioinformatik
  • Goda programmeringskunskaper i framförallt Python, alternativt i Java eller C/C++
  • Goda kunskaper inom datavisualiseringstekniker
  • Obehindrat utföra analyser i en linuxmiljö och beräkningskluster
  • Obehindrat behärska engelska i skrift och tal
  • Självständig och ambitiös, men uppskattar arbete i team
  • Personliga egenskaper som främjar samarbete både internt och externt, du har lätt för att bygga goda relationer med olika personalgrupper

Meriterande

  • Disputerad inom bioinformatik eller cancergenomik
  • Erfarenhet av arbete med system för versionskontroll (git)
  • Erfarenhet av arbete i molnmiljöer (tex Azure, AWS, GCP)
  • Erfarenhet av att leverera strukturerad kod, sätta upp automatiserade tester samt kontinuerlig integrationstestning med tex TravisCI
  • Erfarenhet av arbete med Docker/Singularity teknologier

Vad erbjuder vi?

En kreativ och inspirerande miljö fylld av kompetens och nyfikenhet. Karolinska Institutet är ett av världens ledande medicinska universitet. Vår vision är att driva utvecklingen av kunskap om livet och verka för en bättre hälsa för alla. Här bedriver vi framgångsrik medicinsk forskning och har det största utbudet av medicinska utbildningar i Sverige. Som universitet är Karolinska Institutet även en statlig myndighet. Det innebär att du får goda förmåner genom vårt kollektivavtal, generös semester och en bra tjänstepension. Du får träna fritt i våra moderna friskvårdsanläggningar och får ersättning för läkarvård och mediciner.

Tjänsten är en visstidsanställning på 2 år.

Varmt välkommen med din ansökan senast den 2020-03-03.

Ansökan ska göras via rekryteringssystemet Varbi.

Vill du göra skillnad – och bidra till en bättre hälsa för alla? Sök jobb hos oss

Anställningsform Visstidsanställning längre än 6 månader
Anställningens omfattning Heltid
Tillträde Enligt överenskommelse
Löneform Månadslön
Antal lediga befattningar 2
Sysselsättningsgrad 100%
Ort Stockholm
Län Stockholms län
Land Sverige
Referensnummer 2-808/2020
Kontakt
  • Valteri Wirta, enhetschef, valtteri.wirta@ki.se
Facklig företrädare
  • Biborka Bereczky Veress, SACO, 46 70-173 85 75
  • Niklas Andersson, OFR, niklas.andersson@ki.se
  • Henry Wölling, SEKO, 08-524 840 80
Publicerat 2020-02-13
Sista ansökningsdag 2020-03-14

Tillbaka till lediga jobb