Vill du bidra till medicinsk forskning av toppkvalitet?

Center for Translational Microbiome Research (CTMR) vid MTC startade 2016 som ett samarbete mellan Karolinska Institutet, Sclilifelab och Ferring Pharmacueticals centret har en bred teknisk, biologisk , klinisk och epidemiologisk plattform för att studera komplexa mikrobiologiska miljöer i humana provmaterial. Centret är även med i ”Horizon 2020” initiativet om mikrobiologisk forskning där ONCOBIOME projektet för samman 17 universitet från 10 länder för att forska på fyra olika cancerformer; tarm, bröst och prostatacancer samt melanom. Fokus här för vår del är screening av en stor kohort (30 000 individer) som screenats för kolorektalcancer.

Din roll

Arbetsuppgifterna innefattar planering, genomförande och uppföljning av DNA-extraktion och sekvensering av den stora kohorten för ONCOBIOME projektet med väldigt stor tonvikt på metodoptimering. Därför krävs en gedigen kunskap och expertis i optimering vad gäller DNA extraktion och sekvensering. Tjänsten kommer att vara mycket självständig vilket ger höga krav på vetenskapligt tänkande och gott omdöme.

Dokumentation av allt arbete kommer hanteras i olika databaser, ELN (electronical lab notes), excelblad och i LIMS, vilket är en stor och viktig del av arbetet. Arbetet kommer att behöva analyseras och presenteras och jämförelser bör göras i R. Analyserna och resultaten behöver bearbetas inom korta tidsramar och kommuniceras till olika personer. Rollen kräver därför vana av protokolldesign och komma snabbt komma till utförande, analys och rapportering.

Forskningsingenjören förväntas ta omfattande ansvar för projektet med avseende på DNA-extraktion och sekvensering. Arbetet planeras och prioriteras i samarbete med Senior Lab Manager liksom inköp av labmaterial och rapportering sker till Senior Lab Manager samt till projektets koordinator. I arbetet ingår även genomförande av riskanalyser samt utformning av protokoll (SOP).

Vem är du?

Som lägst ska du ha en doktorsexamen inom det mikrobiologiska fältet med lång arbetslivserfarenhet inom fältet.

Krav

  • Kunskap iDNA-preparation
  • Erfarenhet av sekvensering, (16S på MiSeq och shotgun på DNBseq G400)
  • Erfarenhet av mikrobiologiskt arbete
  • Arbete med Office, LIMS, ELN och R (eller andra programmeringsspråk)
  • Erfarenhet av tekniker att studera DNA/RNA (primer design,PCR, qPCR, metylation profiling)
  • Kunskap i RNAseq för möjlig implementering senare

Meriterande erfarenheter

  • Erfarenhet av metodutveckling inom DNA-preparation
  • Robotarbete (TECAN Evo, Fluent och MGISP)
  • God kunskap i biostatistik

Personliga egenskaper

Du är i hög grad självständig, initiativtagande, flexibel, strukturerad och noggrann. Du har gedigen förmåga att dokumentera (på engelska) och kritiskt kontrollera ditt arbete på ett spårbart sätt. Du har lätt för samarbete med andra och kommunicerar tydligt med kolleger. Att vara mycket analytisk och felsökande i labbet är väsentligt för tjänsten.

Vi kommer att lägga stor vikt vid personlig lämplighet.

Vad erbjuder vi?

En kreativ och inspirerande miljö fylld av kompetens och nyfikenhet. Karolinska Institutet är ett av världens ledande medicinska universitet. Vår vision är att driva utvecklingen av kunskap om livet och verka för en bättre hälsa för alla. Här bedriver vi framgångsrik medicinsk forskning och har det största utbudet av medicinska utbildningar i Sverige. Som universitet är Karolinska Institutet även en statlig myndighet. Det innebär att du får goda förmåner genom vårt kollektivavtal, generös semester och en bra tjänstepension. Du får träna fritt i våra moderna friskvårdsanläggningar och får ersättning för läkarvård.

Placering: Solna

Ansökan

Varmt välkommen med din ansökan senast den 12 oktober 2019.

Ansökan ska göras via rekryteringssystemet Varbi. 

Vid tillsvidareanställning tillämpar Karolinska Institutet 6 månaders provanställning.


Vill du göra skillnad – och bidra till en bättre hälsa för alla? Sök jobb hos oss

Anställningsform Visstidsanställning längre än 6 månader
Anställningens omfattning Heltid
Tillträde omg
Löneform Månadslön
Antal lediga befattningar 1
Sysselsättningsgrad 100 %
Ort Stockholm
Län Stockholms län
Land Sverige
Referensnummer 2-4951/2019
Kontakt
  • Marica Hamsten, Enhetschef, marica.hamsten@ki.se
Facklig företrädare
  • Biborka Bereczky Veress, SACO, 46 70-173 85 75
  • Niklas Andersson, OFR, niklas.andersson@ki.se
  • Henry Wölling, SEKO, 08-524 840 80
Publicerat 2019-10-02
Sista ansökningsdag 2019-10-12

Tillbaka till lediga jobb