Karolinska Institutet, Institutionen för mikrobiologi, tumör- och cellbiologi

Avdelning
The Center for Translational Microbiome Research (CTMR) was started in January 2016 as a
collaboration between Karolinska Institutet, Science for Life Laboratory (SciLifeLab) and Ferring Pharmaceuticals. CTMR aims to better understand the contribution of the human microbiome to physiology and pathophysiology with the goal of opening opportunities for the development of novel therapies in the area of gastroenterology, reproductive health and neonatology. The Center aims at creating a scientific translational environment with a broad interdisciplinary approach to the interface between clinical epidemiology and the microbiological, immunological and genetic aspects of the human microbiome and its association to health and disease.

Arbetsuppgifter
Tjänstens innehavare är ansvarig för verksamheten inom bioinformatik, IT samt LIMS systemet vid CTMR. I arbetsuppgifterna ingår personalansvar för dessa personalgrupper. Tjänsteinnehavaren ingår i CTMRs ledningsgrupp. 

Kvalifikationer
Disputerad inom informatik/bioinformatik området.  Ingående kunskap av Linux och mångårig erfarenhet av serveradministration/nätverk/brandväggar/etc.

- Utveckling/implementation/automation av analysflöden för storskalig  sekvenseringsdata
- Lång erfarenhet av analys av metagenomdata med avseende på  antibiotikaresistens
- Erfarenhet av analys av tandem masspektrometridata av kliniska prover  och blandade bakteriekulturer
- Statistiska analyser av högdimensionell sekvenseringsdata
- Programmeringsspråk: Python, R, C, D, MATLAB, Julia, etc.
- Webbutveckling med Python/Flask
- Design, implementation och drift av databaser: PostgreSQL, SQLite3, MongoDB.

Personliga egenskaper och god förmåga att samarbeta är också avgörande för tjänsten och stor vikt kommer att läggas på lämplighet och vilja/förmåga att leda personal.

Ansökningsförfarande
Ansökan ska göras via rekryteringssystemet Varbi.

Vid tillsvidareanställning tillämpar Karolinska Institutet 6 månaders provanställning.

Anställningsform Tillsvidareanställning
Anställningens omfattning Heltid
Tillträde enl. ök
Löneform Månadslön
Ort Solna
Län Stockholms län
Land Sverige
Referensnummer 2-3615/2019
Kontakt
  • Lars Engstrand, lars.engstrand@ki.se
Facklig företrädare
  • Biborka Bereczky Veress, SACO, 46 70-173 85 75
  • Niklas Andersson, OFR, niklas.andersson@ki.se
  • Henry Wölling, SEKO, 08-524 840 80
Publicerat 2019-06-20
Sista ansökningsdag 2019-06-29

Tillbaka till lediga jobb