Vi letar efter en bioinformatiker för att utveckla och introducera diagnostiska metoder baserade på storskalig DNA sekvensering i sjukvården samt att arbeta med virologisk forskning - Under tillsättning eller tillsatt, ej sökbar

Institutionen för mikrobiologi, tumör-och cellbiologi (MTC) vid Karolinska Institutet i Solna bedriver forskning och undervisning inom immunologi, infektionsbiologi, cellbiologi och cancer. MTC har drygt 430 verksamma medarbetare, varav 100 doktorander, 50 postdoktorer och 26 professorer. Våra nyckelord är tvärvetenskaplighet, kliniskt förankrad grundforskning samt nationellt och internationellt samarbete.

Avdelning
Enheten Clinical Genomics (Stockholm) (http://www.scilifelab.se/facilities/clinical-genomics/) är en nationell infrastruktur vid SciLifeLab med uppdrag att i samverkan med svensk sjukvård utveckla och implementera avancerade tester baserad på next generation sekvensering (NGS) inom sjukvården. Tillsammans med Karolinska universitetslaboratoriet har man nyligen inrättat Genomic Medicine Center Karolinska (GMCK) för att ytterligare stärka detta arbete.

Tjänsten kommer också innebära bioinformatiskt arbete inom virologisk forskning i Jan Alberts forskargrupp på Institutionen för Mikrobiologi, Tumör- och Cellbiologi (MTC) vid Karolinska Institutet. Denna forskning är nära länkad till Clinical Genomics / GMCK där sekvenseringen utförs.

Arbetsuppgifter
Arbetet kommer att innebära nära samarbete med läkare, mikrobiologer, molekylärbiologer, med flera, på SciLifeLab, MTC och Karolinska Universitetssjukhuset. Vi kan erbjuda en spännande arbetsmiljö där målsättningen är att långsiktigt förbättra patientvården och även bedriva translationell forskning. Vi erbjuder även utmanande arbetsuppgifter och en gruppkänsla där alla arbetar mot samma mål. Tekniskt sätt ligger vårt arbete i absolut världsklass och vi jobbar aktivt med att testa gränser och vidareutveckla vår verksamhet.

Exempel på specifika arbetsuppgifter:

• Utveckla analysstrategier för metagenomisk mikrobiologisk diagnostik
• Delta i forskning kring evolution och genetisk variation hos HIV och enterovirus D68
• Arbete inom Clinical Genomics och GMCKs bioinformatiska produktionsteam för analys, kvalitetssäkring och utleverans av data

Kvalifikationer
Vi letar efter en ny medarbetare med kompetens inom området bioinformatik, programmering, genomik och mikrobiologi med följande kvalifikationer:

• Magisterexamen inom data eller biovetenskaper, eller motsvarande dokumenterad erfarenhet
• Goda programmeringskunskaper (kunskaper i Python är starkt meriterande)
• Tidigare erfarenhet av bioinformatiskt och laborativt arbete med NGS inom genomik och mikrobiologi
• Obehindrat behärska svenska och engelska i skrift och tal
• Stor vikt kommer att läggas vid personliga egenskaper som främjar samarbete både internt och externt

Ansökningsförfarande
Ansökan ska göras via rekryteringssystemet Varbi.

Detta är en tidsbegränsad anställning på 2 år.

Anställningen är administrativt vid Jan Alberts grupp, MTC, Karolinska Institutet, men arbetet sker huvudsakligen på SciLifeLab.