Postdoktor i eukaryot RNA-genomik

Vill du bidra till medicinsk forskning av toppkvalitet?

Institutionen för mikrobiologi, tumör- och cellbiologi (MTC) vid Karolinska Institutet bedriver forskning och undervisning inom immunologi, infektionsbiologi, cellbiologi och cancer. MTC har cirka 40 forskargrupper och våra nyckelord är multidisciplinära, överbryggande, nationella och internationella samarbeten. Vicente Pelechanos forskargrupp ligger på Science for Life Laboratory på Karolinska Institutets campus i Solna. SciLifeLab är utrustat med toppmodern instrumentering och kärnfaciliteter, och är hem för ett av de största sekvenseringsklustren i Europa. Läs mer om SciLifeLab här. 

Vicente Pelechanos forskargrupp kombinerar experimentellt arbete och beräkningsarbete och syftar till att utveckla och tillämpa nya genomomfattande tekniker för att ta itu med grundläggande biologiska frågor med medicinska implikationer. Vi är specifikt intresserade av hur subtila variationer i genuttryck kan leda till differentiella cellulära fenotyper och brinner för RNA-biologi. Läs mer om vår forskargrupp här. Som del av vår grupp får du möjlighet att arbeta i en tvärvetenskaplig och internationell miljö och kombinera utvecklingen av state-of-the-art genomomfattande tillvägagångssätt med molekylär dissektion av grundläggande biologiska problem.

Är du intresserad av att reda ut den eukaryota post-transkriptionella regleringskoden? Vill du kombinera användningen av banbrytande genomomfattande teknologier med syntetisk biologi och maskininlärning för att studera RNA-liv? Kom och häng med oss på SciLifeLab.

Din roll

Tjänsten som Postdoc syftar till att utveckla och tillämpa nya genomiska metoder för att studera eukaryota genuttryck genom att kombinera experimentella och beräkningsmetoder. Som Postdoc hos oss kommer du att arbeta inom ramen för ett nyligen tilldelat ERC-synergiprojekt (EPIC - Unravelling the eukaryotic post-transcriptional regulatory code) i samarbete med professor Kevin Verstrepen (Leuven) och prof. Julien Gagneur (München).

EPIC kommer att kombinera användningen av genomisk, syntetisk biologi, maskininlärning och evolutionära tillvägagångssätt med målet att förstå den fullständiga regleringskoden för genuttryck för S. cerevisiae och andra eukaryoter. Som Postdoc kommer du att fokusera på kartläggning och förutsägelse av mRNA-gränser. I rollen kommer du också att använda den genererade informationen för att kvantifiera och förutsäga hur mRNA-variationer leder till divergerande mRNA-öden. Som Postdoc kommer du att integrera olika experimentella och beräkningsmetoder för att slutföra projektet, inklusive genomik, jästgenetik, högkapacitetsbiologiska tillvägagångssätt och bioinformatik.

I rollen ingår också att utföra original forskning inom transkriptomik och beräkningsbiologi, och skaffa de nödvändiga experimentella och beräkningsfärdigheter som krävs för att slutföra projektet. Du förväntas kommunicera de vetenskapliga resultaten genom att skriva vetenskapliga artiklar och delta i vetenskapliga möten. Den idealiska kandidaten kommer att delta i teamets allmänna uppgifter och effektivt kommunicera med forskare med mycket olika bakgrund i en mycket tvärvetenskaplig och internationell miljö. Arbetsspråket är engelska

Vem är du?

För att anställas som postdoktor krävs avlagd doktorsexamen eller en utländsk examen som bedöms motsvara en svensk doktorsexamen. Detta behörighetskrav ska vara uppfyllt senast vid tidpunkten då anställningsbeslutet fattas. Det är meriterande om du har avlagt din doktorsexamen inom de tre senaste åren, om det finns särskilda skäl kan din examen ha avlagts tidigare.

Sökande till denna tjänst bör ha en doktorsexamen i molekylärbiologi, bioteknik, genetik eller liknande område. Du som söker bör ha erfarenhet av att tolka biologiska data och experimentellt testa sina hypoteser.

Krav för tjänsten:

• Ett starkt intresse för tvärvetenskaplig teknikutveckling, samt förmåga till nytt och kreativt tänkande.
• Erfarenhet av att utveckla nya NGS-strategier.
• Kännedom om molekylärbiologiska metoder som RNA-Seq, SLAM-Seq eller ATAC-Seq.
• Forskningserfarenhet av storskaliga analyser och bioinformatik (NGS, batch- och/eller R/Python-skriptspråk)
• Erfarenhet av DNA/RNA-extraktion.
• Goda interpersonella färdigheter och förmåga att arbeta i team.

Meriterande för tjänsten:

• Erfarenhet av transkription och posttranskriptionell mRNA-reglering.
• Erfarenhet av identifiering av transkriptgränser (TSS och PAS)
• Erfarenhet av genetik över evolutionärt relaterade organismer.
• Vid anställningen kommer särskild vikt att läggas vid vetenskaplig skicklighet av relevans för projektet och tidigare forskningserfarenhet
  
  

Vad erbjuder vi?

En kreativ, internationell inspirerande miljö fylld av kompetens och nyfikenhet. Karolinska Institutet är ett av världens ledande medicinska universitet. Här bedriver vi framgångsrik medicinsk forskning och har det största utbudet av medicinska utbildningar i Sverige. På KI får du träffa forskare med olika forskningsinriktningar som jobbar tillsammans. Det är det gränsöverskridande samarbetet som bidrar till KI:s världsledande position inom forskning. Flera av de personer du möter inom vården är utbildade på KI. En nära relationen till hälso- och sjukvården är viktig för att skapa utbildning och forskning av högsta kvalitet. Som universitet är Karolinska Institutet också en statlig myndighet. Det gör att du som anställd får goda förmåner genom vårt kollektivavtal.

Placering: Solna

Mer information: http://pelechanolab.com/

Ansökan

Ansökan ska bestå av följande handlingar, skrivna på engelska eller svenska:

• Bevis om doktorsexamen
• Ett komplett CV inkluderande disputationsdatum, avhandlingens titel, tidigare akademiska befattningar, akademisk titel, nuvarande befattning, akademiska utmärkelser samt kommittéarbete
• En komplett publikationslista
• En sammanfattning av nuvarande arbete (maximalt en sida)

Varmt välkommen med din ansökan senast 2025-09-02

Ansökan ska göras via rekryteringssystemet Varbi.  

Vill du göra skillnad – och bidra till en bättre hälsa för alla? Sök jobb hos oss!