Postdoktor i Beräkningsbiologi

Vill du bidra till medicinsk forskning av toppkvalitet?

Ratz-labbet arbetar i skärningspunkten mellan systemneurovetenskap, syntetisk biologi och rumslig transkriptomik. Vårt mål är att avslöja ledningsreglerna för neuronala nätverksmontering i däggdjurshjärnor och att utnyttja sådana insikter för neurala nätverksteknik och terapi. Ratz-labbet använder och utvecklar banbrytande tillvägagångssätt, inklusive viral streckkodning, CRISPR-störningar in vivo, encellig och rumslig transkriptomik och beräkningsmetoder för dataanalys.

Din roll

Projektet kombinerar grundforskning inom molekylär neurovetenskap med beräknings- och experimentell metodutveckling. Du kommer att skapa en beräkningsram för att undersöka in situ RNA-seq-datauppsättningar insamlade från streckkodade mushjärnor (se: Ratz et al., Nature Neuroscience, 2022; Shi et al., Nature, 2023). Din huvudsakliga roll kommer att vara att utveckla de beräkningsmetoder som är involverade i detta datadrivna projekt (t.ex. bildbehandling, differentiellt genuttryck, klustring) och att använda dessa metoder för att identifiera ledningsreglerna för däggdjurs neurala kretsar. Du kommer att arbeta nära med experimentella såväl som beräkningsforskare inne i labbet.

Vem är du?

För att anställas som postdoktor krävs avlagd doktorsexamen eller en utländsk examen som bedöms motsvara en svensk doktorsexamen. Detta behörighetskrav ska vara uppfyllt senast vid tidpunkten då anställningsbeslutet fattas. Det är meriterande om du har avlagt din doktorsexamen inom de tre senaste åren, om det finns särskilda skäl kan din examen ha avlagts tidigare.

Kvalifikationer:

Bakgrund inom bioinformatik, beräkningsbiologi, datavetenskap etc. med doktorsexamen inom relevant område.
Erfarenhet av programmering med Python (eller liknande språk) för att ta itu med biologiska frågor.
Erfarenhet av genomisk och/eller transkriptomisk dataanalys.
Intresse för hjärnans utveckling, neurala kretsar och musmodeller av hjärnsjukdomar.
Flytande engelska i tal och skrift.

Merit:

Erfarenhet av encellig och/eller rumslig transkriptomik.
Erfarenhet av bildbehandling med MATLAB.

Vad erbjuder vi?

En kreativ, internationell inspirerande miljö fylld av kompetens och nyfikenhet. Karolinska Institutet är ett av världens ledande medicinska universitet. Här bedriver vi framgångsrik medicinsk forskning och har det största utbudet av medicinska utbildningar i Sverige. På KI får du träffa forskare med olika forskningsinriktningar som jobbar tillsammans. Det är det gränsöverskridande samarbetet som bidrar till KI:s världsledande position inom forskning. Flera av de personer du möter inom vården är utbildade på KI. En nära relationen till hälso- och sjukvården är viktig för att skapa utbildning och forskning av högsta kvalitet. Som universitet är Karolinska Institutet också en statlig myndighet. Det gör att du som anställd får goda förmåner genom vårt kollektivavtal.

Placering: Solna

Ratz lab: https://www.ratzlab.org

Institutionen för cell- och molekylärbiologi: https://ki.se/en/cmb/department-of-cell-and-molecular-biology

--[Video om Karolinska Institutet, hur vi alla bidrar till "en bättre hälsa för alla"] ---

Ansökan

Ansökan ska bestå av följande handlingar, skrivna på engelska eller svenska:

En komplett CV inkluderande disputationsdatum, avhandlingens titel, tidigare akademiska befattningar, akademisk titel, nuvarande befattning, akademiska utmärkelser samt kommittéarbete
En komplett publikationslista
En sammanfattning av nuvarande arbete (maximalt en sida)

Varmt välkommen med din ansökan!

Ansökan ska göras via rekryteringssystemet Varbi.

Vill du göra skillnad – och bidra till en bättre hälsa för alla? Sök jobb hos oss