Postdoktor i axonpatologi vid ALS

Vill du bidra till att förstå patogenesen av den dödliga sjukdomen ALS?

Vi söker en mycket motiverad postdoktoral forskare för att delta i studier som syftar till att mekanistiskt dissekera de patologiska händelser som leder till motoraxonpatologi i den neurodegenerativa sjukdomen amyotrofisk lateral skleros (ALS). Postdoc-projektet kommer att genomföras i Dr. Eva Hedlunds forskargrupp med organisationsanknytning till Institutionen för cell- och molekylärbiologi.

Under det senaste decenniet har vi kombinerat pluripotenta stamceller, mänskliga vävnader och musmodeller med avancerade RNA-sekvenseringsmetoder för att belysa mekanismer för neuronal sårbarhet och motståndskraft vid motorneuronsjukdomar, med fokus på ALS och spinal muskelatrofi (SMA). Vi har identifierat flera mekanismer som gör vissa neuroner motståndskraftiga och som kan moduleras i sårbara neuroner för att göra dem mindre benägna att degenerera (Allodi et al, Scientific Reports, 2016, Nichterwitz et al, Nature Communications, 2016; Nijssen et al, Stem Cell Reports, 2018; Nizzardo et al, Acta Neuropathologica, 2020, Nichterwitz, Genome Research, 2020).

Med det aktuella projektet syftar vi till att mekanistiskt reda ut hur distinkta ALS-orsakande mutationer orsakar tidig motoraxonpatologi med hjälp av inducerade pluripotenta stamceller (iPSCs) och deras härledning till distinkta motorneuronsubpopulationer för att modellera sjukdom, CRISPR/Cas9-genomredigering och Axon-RNA-sekvensering (Axon-seq).

Projektet

Degeneration av motorneuroner i ALS följer ett distinkt mönster där den neuromuskulära synapsen och distala axonet är tidiga patologiska mål. Mekanismerna som styr denna process är i stort sett okända, men vår hypotes är att dessa delvis beror på en tidig dereglering i det axonala transkriptomet, vilket destabiliserar synapsen mellan motorneuron och muskel. I detta projekt vill vi studera hur det mänskliga motoraxontranskriptomet är dereglerat i ALS. Vi kommer också att funktionellt utvärdera identifierade transkript för deras roll(er) i axonalt underhåll och synaps-stabilitet. Mot detta mål har vi utvecklat en effektiv RNA-sekvenseringsmetod för axoner, Axon-seq, där motorneuroner odlas i mikrofluidikenheter för att isolera axoner, i kombination med Smart-seq RNA-sekvensering. Ytterligare experimentella system och tillvägagångssätt som förväntas användas i projektet inkluderar inducerade pluripotenta stamceller (iPSCs) och deras härledning till distinkta motorneuronsubpopulationer för att modellera sjukdom, CRISPR/Cas9-genomeditering, virala vektorer för att modulera genuttryck, single cell-RNA-sekvensering och bioinformatik och avancerada mikroskopitekniker. Kandidater med ett djupt intresse för ALS-neuropatologi och färdigheter inom molekylär- och cellbiologi uppmuntras starkt att ansöka.

I detta projekt strävar vi efter att adressera följande frågor:
(1) Visar iPSC-härledda motorneuroner som har ALS-orsakande mutationer unik RNA-dereglering i somas och axoner?
(2) Orsakar olika ALS-orsakande mutationer unik dereglering av transkriptomet eller leder de till samma felreglering?
(3) Kan axonpatologier i ALS funktionellt kopplas till dereglering av axonal RNA-sammansättning?

Arbetsuppgifterna förknippade med projektet kommer att utföras i en stimulerande miljö med en grupp motiverade medarbetare med både experimentell och beräkningskompetens.

Din profil

Behörig att anställas som postdoktor är den som har avlagt doktorsexamen eller har motsvarande vetenskaplig kompetens. Det är meriterande om du har avlagt din doktorsexamen inom de tre senaste åren, om det finns särskilda skäl kan din examen ha avlagts tidigare. Även sökande som inte avlagt doktorsexamen vid ansökningstidens utgång kan söka under förutsättning att alla krav för fullgjord examen uppfylls innan (avsett) anställningsdatum. Detta ska styrkas av sökandes huvudhandledare, studierektor eller motsvarande.

Vi söker en mycket motiverad kandidat med stark forskningsbakgrund och följande kompetenser:
• Goda meriter inom forskning på neurodegenerativa sjukdomar
• Goda meriter inom arbete med mänskliga stamcellsodlingssystem
• Erfarenhet av RNA-sekvensering är en styrka.
• God förmåga att arbeta självständigt men också mycket god samarbetsförmåga och vilja att jobba i ett stort team.
• Kunskaper om relevanta biologiska områden (ALS, motorneuroner, stamceller, RNA-sekvensering)
• Kunskaper i engelska i både tal och skrift samt god kommunikationsförmåga

Vad erbjuder vi?

En kreativ och inspirerande miljö fylld av kompetens och nyfikenhet. Karolinska Institutet är ett av världens ledande medicinska universitet. Vår vision är att driva utvecklingen av kunskap om livet och verka för en bättre hälsa för alla. Här bedriver vi framgångsrik medicinsk forskning och har det största utbudet av medicinska utbildningar i Sverige. Som universitet är Karolinska Institutet även en statlig myndighet. Det innebär att du får goda förmåner genom vårt kollektivavtal, generös semester och en bra tjänstepension. Du får träna fritt i våra moderna friskvårdsanläggningar och får ersättning för läkarvård.

Placering: Solna

Ansökan

Ansökan ska bestå av följande handlingar, skrivna på engelska eller svenska:

En komplett CV inkluderande disputationsdatum, avhandlingens titel, tidigare akademiska befattningar, akademisk titel, nuvarande befattning, akademiska utmärkelser samt kommittéarbete
En komplett publikationslista
En sammanfattning av nuvarande arbete (maximalt en sida)
Kontaktinformation till två referenser, rekommendationsbrev kan också bifogas

Ansökan ska göras via rekryteringssystemet Varbi.

Denna position avser 1 års anställning.

Vill du göra skillnad – och bidra till en bättre hälsa för alla? Sök jobb hos oss