IT-specialist inom mikrobiomforskning

Vill du bidra till att förbättra människors hälsa?

Institutionen för mikrobiologi, tumör- och cellbiologi (MTC) vid Karolinska Institutet bedriver forskning och undervisning inom immunologi, infektionsbiologi, cellbiologi och cancer. Våra nyckelord är multidisciplinära, överbryggande, nationella och internationella samarbeten.

Vi söker en IT-specialist med starkt intresse och lång erfarenhet av drift och utveckling av forskningsinfrastrukturlösningar för mikrobiomforskning, för nedskalning och avveckling av detsamma.

Din roll

I rollen som IT-specialist kommer du ta omfattande eget ansvar för att genomföra nedläggning, avveckling, och i vissa fall överlämning, av de legacy IT-system denna forskargrupp etablerat under det senaste decenniet över hundratals forskningsprojekt. Arbetet kommer ske på deltid.

Vem är du?

Du har god erfarenhet av mjukvaruutveckling, uppsättning och drift av bl.a.: komplexa Slurm-baserade high-performance computing-kluster, databassystem med diverse strukturerad forskningsdata (MongoDB, Postgresql, MariaDB, mm), flera LIMS-system, webtjänster (Flask, FastAPI, med flera), ett ekosystem av diverse Python-script som alla interagerar med de olika systemet på olika sätt, samt arkivering och gallring av omfattande mängder forsknings- och sekvenseringsdata.

Du har goda kommunikationsfärdigheter på svenska och engelska, i både tal och skrift.

Du skall ha starkt forskningsintresse och kan komma bidra till att granska och författa vetenskapliga artiklar och/eller förbereda data för dessa.

Krav för rollen:

• 5+ år dokumenterad erfarenhet av uppsättning och drift av Slurm-baserade HPC-kluster
• 5+ år dokumenterad erfarenhet av VMware vSphere/vCenter och att arbeta med virtuella maskiner
• 5+ år dokumenterad erfarenhet av utveckling och drift av säkra webbtjänster för att hantera forskningsdata (t.ex. Flask, FastAPI, etc)
• 5+ år dokumenterad erfarenhet av Ansible för konfiguration av virtuella servrar
• 10+ år erfarenhet av bioinformatiska verktyg i Python, R, Perl, bash, mm
• 10+ år erfarenhet av att driva fleranvändarsystem med Red Hat/Rocky Linux
• 10+ år erfarenhet av att utveckla och driftsätta databassystem (Postgresql, MariaDB, MongoDB, med flera)
• God social förmåga
• God förmåga till kreativt problemlösande och beslutsfattande under diffusa kravförhållanden

Meriterande för rollen:

• God insikt i systemarkitektur av integrerade virtualiserade system och arbete med Infrastructure as code (IaC) i av avveckling av omfattande IT-system
• God erfarenhet av att arbeta med känslig forskningsdata
• Erfarenhet av arkivering och gallring av forskningsdata
• God erfarenhet av mikrobiomforskning på Postdoc-nivå

Vad erbjuder vi?

En kreativ, internationell och inspirerande miljö fylld av kompetens och nyfikenhet. Karolinska Institutet är ett av världens ledande medicinska universitet. Vår vision är att driva utvecklingen av kunskap om livet och verka för en bättre hälsa för alla. Här bedriver vi framgångsrik medicinsk forskning och har det största utbudet av medicinska utbildningar i Sverige. Som universitet är Karolinska Institutet en statlig myndighet. Det gör att du får goda förmåner genom vårt kollektivavtal. Medarbetare på KI erbjuds också möjlighet till ett flexibelt arbetssätt. Det innebär att om den verksamhet du jobbar i tillåter, så kan du arbeta en del av din arbetstid på distans. Du får även träna fritt i våra moderna friskvårdsanläggningar där utbildad personal finns på plats.

Placering: Solna

Ansökan

Ansökan ska göras via rekryteringssystemet Varbi. I denna rekrytering söker du med ditt CV utan personligt brev. I ansökningsformuläret kommer du istället att få svara på några frågor om varför du söker jobbet.

Vill du göra skillnad – och bidra till en bättre hälsa för alla? Sök jobb hos oss