Postdoktor i modellering av cancermetabolism

Vill du bidra till att förbättra människors hälsa?

Vårt labb bidrar till utvecklingen av precisionsmedicin genom djupinlärningsmodeller av cancerceller. Modellerna tränas på högkapacitetsscreeningsdata (high-throuput datasets), inklusive metabolomik, proteomik och transkriptomik, och är villkorade för att överensstämma med de molekylära nätverken inom celler. Detta gör att vi kan identifiera mekanismer på systemnivå i cancer för förbättrad behandlingseffektivitet, genom nya läkemedelsmål, biomarkörer och resistensmekanismer. Vi är särskilt intresserade av interaktioner mellan cancer och stroma vid pankreascancer. Vårt långsiktiga mål är att etablera datorstödd design av precisionsmedicin mot cancer. Labbet är beläget i Science for Life Laboratory (SciLifeLab) och anställningen finansieras av Data Driven Life Science-programmet (DDLS).

Din roll

Vår målsättning är att reda ut de komplexa mekanismer som driver dysreglerad energimetabolism i cancer. I denna roll kommer du att:

Utveckla en djupinlärnings model av metabolism och celltillväxt i cancer. Den kommer baseras på metabola nätverket och ta genetiska förändringar och metabolitnivåer som input för att förutsäga reaktionshastigheter och metabolitnivåer, kvantifierade genom metabolomik.
Integrera ramverket med vår modell av signalering och genreglering för att förutsäga effekterna av mutationer och läkemedel på metabolismen. Prediktionerna kommer att valideras in vitro i samarbete med experimentellalister.

Om du är redo att göra en insats i kampen mot cancer och bidra till banbrytande forskning i skärningspunkten mellan djupinlärning och cellbiologi uppmanar vi dig att söka tjänsten!

Vem är du?

För att anställas som postdoktor krävs avlagd doktorsexamen eller en utländsk examen som bedöms motsvara en svensk doktorsexamen. Detta behörighetskrav ska vara uppfyllt senast vid tidpunkten då anställningsbeslutet fattas. Det är meriterande om du har avlagt din doktorsexamen inom de tre senaste åren, om det finns särskilda skäl kan din examen ha avlagts tidigare.

Andra kvalifikationer

Starka programmeringskunskaper i språk så som Python.
Bevisad förmåga att bedriva självständig forskning och effektivt kommunicera resultat.
Högmotiverad med förmåga att arbeta både självständigt och i team.
Goda kunskaper i engelska, både skriftlig och muntlig.

Andra önskvärda kvalifikationer:

Erfarenhet av vilkorsbaserad modellering av metabolism, t.ex. flödesbalansanalys (FBA).
God kännedom om cancerbiologi, särskilt relaterat till energimetabolismen.
Erfarenhet av analys av hög genomströmningsbiologiska data.
Erfarenhet av djupinlärningsmodeller och automatisk differentiering.
Erfarenhet av GitHub eller andra versionskontrollsystem.

Vårt labb värderar mångfald och inkludering, och vi är engagerade i att främja en miljö där alla individer känner sig bemyndigade att bidra med sina unika perspektiv och färdigheter i strävan mot vårt gemensamma mål, att främja precisionsmedicin mot cancer.

Vad erbjuder vi?

En kreativ, internationell inspirerande miljö fylld av kompetens och nyfikenhet. Karolinska Institutet är ett av världens ledande medicinska universitet. Här bedriver vi framgångsrik medicinsk forskning och har det största utbudet av medicinska utbildningar i Sverige. På KI får du träffa forskare med olika forskningsinriktningar som jobbar tillsammans. Det är det gränsöverskridande samarbetet som bidrar till KI:s världsledande position inom forskning. Flera av de personer du möter inom vården är utbildade på KI. En nära relationen till hälso- och sjukvården är viktig för att skapa utbildning och forskning av högsta kvalitet. Som universitet är Karolinska Institutet också en statlig myndighet. Det gör att du som anställd får goda förmåner genom vårt kollektivavtal.

Placering: Stockholm

[Video om Karolinska Institutet, hur vi alla bidrar till "en bättre hälsa för alla"]

Ansökan

Ansökan ska bestå av följande handlingar, skrivna på engelska eller svenska:

En komplett CV inkluderande disputationsdatum, avhandlingens titel, tidigare akademiska befattningar, akademisk titel, nuvarande befattning, akademiska utmärkelser samt kommittéarbete
En komplett publikationslista
En sammanfattning av nuvarande arbete (maximalt en sida)

Varmt välkommen med din ansökan senast den 10:e oktober.

Ansökan ska göras via rekryteringssystemet Varbi.

Vill du göra skillnad – och bidra till en bättre hälsa för alla? Sök jobb hos oss