Systemutvecklare inom cancergenomik

Vill du bidra till medicinsk forskning av toppkvalitet?

Institutionen för medicinsk epidemiologi och biostatistik bedriver forskning inom epidemiologi och biostatistik inom ett brett spektrum av områden inom biomedicinsk vetenskap. Institutionen är bland de största inom sitt område i Europa och har särskilt starka forskningsprofiler inom psykiatrisk, cancer-, reproduktiv, pediatrisk, farmakologisk, genetisk och geriatrisk epidemiologi, ätstörningar, precisionsmedicin, och biostatistik.

En del av framgången för institutionen beror på vår samarbetsanda, där en stor bidragande faktor är att forskare vid institutionen delar och samfinansierar gemensamma resurser (som t.ex. IT och en tillämpad biostatistikgrupp). Institutionen ligger på campus Solna. Mer information finns på http://ki.se/meb.

På Institutionen pågår flertalet prospektiva kliniska studier. I dessa studier används bred sekvenserings-baserad analys av cancergenomet hos patienter med bl.a. spridd bröst- och prostatacancer. Målet med dessa analyser är att hitta somatiska förändringar (mutationer) i cancercellernas DNA samt utvärdera om dessa kan användas för att göra bättre behandlingsval.

För att kunna utföra analyser av cancercellernas DNA har forskare på MEB etablerat en informatik-infrastruktur som omfattar system för att hålla koll på prover, utföra själva analysstegen, samt utföra beräkningarna strukturerat i en molnbaserad servermiljö med virtuella servrar.

Vem är du?

Vi söker en programmerare med en ingenjörsexamen inom programmering och datavetenskap för att arbeta med vår informatik-infrastruktur. Kandidten kommer arbeta med back-end samt front-end utveckling, våra applikationer, våra databaser samt den molnbaserade servermiljön.

Kvalifikationer

Ingenjörsexamen inom programmering och datavetenskap.
Minst 5 års erfarenhet av utveckling i Linux-baserade miljöer med SLURM.
Dokumenterad erfarenhet av fullstack-utveckling (DevOps) med fokus på frontend-utveckling och wireframe-teknik.
Kunskaper i relevanta programmeringsspråk (ReactJS, PHP, SQL, Python, .Net).
Erfarenhet av virtualisering och/eller containerteknik, företrädesvis K8s och Docker.
Erfarenhet av cloud-ops (S3, VM, SDB, SDN).
Erfarenhet av versionshanteringssystem, t.ex. Git.
Erfarenhet av CI-CD pipelines, CRF, EDC, system för hantering av kliniska prövningar.
Goda kommunikationsfärdigheter på engelska.

Meriterande

Erfarenhet av NoSQL-databaser som MongoDB, helst med GenAI-funktioner.
Erfarenhet av HPC (utveckling, driftsättning, sandboxing, administration).
Kunskap om teknik och principer som rör hantering, lagring och arkivering av känsliga hälsodata.
Erfarenhet av att utveckla programvara och appar för bioinformatik.
Erfarenhet av att utveckla REST och RESTful API:er.
Kunskap om biomedicinsk forskning och bioinformatiska infrastrukturer. (redigerad)

För att lyckas i miljön måste kandidaten ha förmågan att arbeta självständigt, att samarbeta, vara strukturerad och ta initiativ. Vi lägger stor vikt vid personliga egenskaper.

Vad erbjuder vi?

En kreativ, internationell och inspirerande miljö fylld av kompetens och nyfikenhet. Karolinska Institutet är ett av världens ledande medicinska universitet. Vår vision är att driva utvecklingen av kunskap om livet och verka för en bättre hälsa för alla. Här bedriver vi framgångsrik medicinsk forskning och har det största utbudet av medicinska utbildningar i Sverige. Som universitet är Karolinska Institutet en statlig myndighet. Det gör att du får goda förmåner genom vårt kollektivavtal. Medarbetare på KI erbjuds också möjlighet till ett flexibelt arbetssätt. Det innebär att om den verksamhet du jobbar i tillåter, så kan du arbeta en del av din arbetstid på distans. Du får även träna fritt i våra moderna friskvårdsanläggningar där utbildad personal finns på plats.

Placering: Solna

Tio skäl att välja Karolinska Institutet

Ansökan

Varmt välkommen med din ansökan senast den 26 juni 2024.

Ansökan ska göras via rekryteringssystemet Varbi. I denna rekrytering söker du med ditt CV utan personligt brev. I ansökningsformuläret kommer du istället att få svara på några frågor om varför du söker jobbet.

Vid tillsvidareanställning tillämpar Karolinska Institutet 6 månaders provanställning.

Vill du göra skillnad – och bidra till en bättre hälsa för alla? Sök jobb hos oss