Bioinformatiker med expertis inom precisionsmedicin - Under tillsättning eller tillsatt, ej sökbar

Vill du bidra till en bättre hälsa för alla?

SciLifeLab, Science for Life Laboratory, är ett nationellt center för molekylära biovetenskaper i Sverige, som utvecklar och underhåller unik forskningsinfrastruktur, tjänster och dataresurser för livsvetenskaplig forskning. SciLifeLabs främsta mål är att möjliggöra banbrytande, mångvetenskaplig forskning och främja att forskningen tillämpas till nytta för samhället. Cirka 200 forskargrupper, 1 500 forskare och 40 nationella infrastrukturenheter är kopplade till SciLifeLab. De två huvudnoderna är placerade i Stockholm och Uppsala, och SciLifeLab har även nationella faciliteter vid alla större svenska lärosäten.

SciLifeLab och Wallenbergs nationella program för datadriven livsvetenskap (DDLS) är ett 12-årigt initiativ som fokuserar på datadriven forskning, inom områden som är grundläggande för att förbättra människors liv, upptäcka och behandla sjukdomar, skydda biologisk mångfald och bidra till hållbar utveckling. Programmet avser att utbilda och rekrytera nästa generation av forskare inom datadriven livsvetenskap samt att skapa starka och internationellt konkurrenskraftiga beräknings- och datavetenskapliga forskningskapaciteter inom svensk livsvetenskap.

DDLS-programmet har etablerat en nationell nod inom precisionsmedicin och diagnostik, med ett nationellt ansvar för att utveckla datatjänster och tillhandahålla bioinformatikstöd. Nodens personal är anställda på Karolinska Institutet (KI), med placering vid Compliance & Data Office (CDO), en del av avdelningen för forskarstöd, på KIs campus i Solna där även SciLifeLabs Stockholmsnod är placerad. CDO tillhandahåller brett stöd inom datahantering, hälsodata, kliniska studier, etik och rådgivning kring lagar och regler, och utvecklar nu inom DDLS-programmet mer specifikt stöd för precisionsmedicin och diagnostik. Placeringen vid KI möjliggör också nära interaktioner med regionala och lokala initiativ relaterade till precisionsmedicin, t. ex. Precision Medicine Center Karolinska (PMCK), som är ett samarbete med Karolinska sjukhuset, och det universitetsövergripande initiativet Datadriven forskning på KI (DDKI). Bioinformatiken är integrerad med SciLifeLab bioinformatikplattform (NBIS), en unik nationell infrastruktur med över 100 medarbetare, som tillhandahåller avancerad support, infrastruktur och utbildning till svenska forskare inom livsvetenskap. Vi söker nu en enastående kandidat med kompetens inom datadriven precisionsmedicin och relaterade dataanalyser, för att tillhandahålla avancerat bioinformatikstöd till vetenskapligt framstående datadrivna svenska forskningsprojekt inom precisionsmedicin och diagnostik. Tjänsten utgör en unik möjlighet att delta i multidiscplinärt lagarbete för att bidra till förbättrade behandlingar och ökad livskvalitet, vilket i framtiden kommer att rädda liv.

Din roll

De huvudsakliga arbetsuppgifterna är att:

• Utföra avancerade dataanalyser inom nationellt prioriterade datadrivna projekt.
• Potentiellt utveckla verktyg och arbetsflöden för sådana analyser, och tillgängliggöra dessa för användning av andra forskare.
• Lära ut bioinformatik till andra forskare genom att samarbeta inom projekt, undervisa på nationella kurser och delta i konsultationer.
• Bidra till den löpande utvecklingen av DDLS-programmet och SciLifeLabs bioinformatikplattform på en nationell nivå.

Analysarbetet kan till exempel inbegripa klassificering av patienter utifrån molekylära profiler och journaldata, för att utveckla tillvägagångssätt som möjliggör mer informerade beslut om behandling. Arbetet kan också inbegripa stöd till preklinisk forskning, exempelvis studier i modellsystem för att öka kunskapen om sjukdomsmekanismer genom analys av s.k. multi-omics data, bilder och/eller dos-respons profiler.

Vem är du?

Kvalifikationer

Vi söker en driven bioinformatiker med gedigen erfarenhet av storskaliga dataanalyser inom medicinsk forskning. Den sökande behöver uppfylla följande krav:

• Doktorsexamen inom bioinformatik, biomedicin, datavetenskap eller annat relaterat område som arbetsgivaren finner relevant för anställningen.
• Stor erfarenhet (minst 3 år) av avancerade bioinformatikanalyser på storskaliga molekylära data (t. ex. genetisk variation, transkriptomik, proteomik eller metabolomik) i relation till hälsoutfall, som sjukdomsrisk, överlevnadstid och behandlingssvar, i människa eller modellsystem.
• Erfarenhet av biostatistik eller maskininlärning, och kunskap om när det är lämpligt att använda sådana metoder och deras begränsningar.
• God förmåga i ett eller flera programmeringsspråk, samt i att arbeta effektivt i Linux kommandoradsmiljö och på storskaliga datorkluster.
• Flytande behärska talad och skriven engelska.
• Skicklig på att samarbeta och kommunicera med andra, liksom förmåga att driva projekt självständigt.

Meriter

Postdoktorala studier är en stark merit men inte ett krav. Kunskaper om kliniska prövningar inom precisionsmedicin, translationell medicinsk forskning, hälsoinformatik och upptäckande av biomarkörer är starka meriter. Skicklighet inom integrativa analyser av s.k. multi-omics data, avancerad datavisualisering och medicinsk bildanalys är också starkt meriterande. Stor vikt kommer läggas vid personlig lämplighet och kommunikationsförmåga för arbete inom multidisciplinära grupper.

Tio skäl att välja Karolinska Institutet

Ansökan

Varmt välkommen med din ansökan.

Ansökan ska göras via rekryteringssystemet Varbi. I denna rekrytering söker du med ditt CV utan personligt brev. I ansökningsformuläret kommer du istället att få svara på några frågor om varför du söker jobbet. 

Vid tillsvidareanställning tillämpar Karolinska Institutet 6 månaders provanställning.

Vill du göra skillnad – och bidra till en bättre hälsa för alla? Sök jobb hos oss