Senior forskningsinfrastrukturspecialist

Vill du bidra till medicinsk forskning av toppkvalitet?

Vi söker en Senior Forskningsinfrastrukturspecialist till professor Richard Rosenquist Brandells forskargrupp vid Institutionen för molekylär medicin och kirurgi, Karolinska Institutet. Vår forskargrupp studerar hematologiska maligniteter med särskilt fokus på kronisk lymfatisk leukemi, i en translationell forskningsmiljö. Våra övergripande mål är att bättre förstå underliggande sjukdomsmekanismer, tillämpa ny kunskap inom genetisk diagnostik, förbättra prognosbedömning samt utveckla nya behandlingsstrategier.

Din roll

Den sökande kommer i sin roll som senior forskningsinfrastrukturspecialist att:

• Ge strategisk vägledning för att hantera och optimera den infrastruktur som stödjer våra analytiska servrar och system för next-generation sequencing (NGS)-data
• Leda och övervaka forskargruppens dataanalysprojekt
• Utveckla och införa standardiserade arbetsflöden för effektiv och kvalitetssäkrad dataanalys, samt ge stöd till forskargruppens kvalitetsarbete
• Utforska och utvärdera nya metoder samt implementera dessa i forskningen
• Följa upp projektens framsteg, identifiera problem och hitta lösningar
• Vara en resurs för vägledning till forskargruppen i frågor om dataanalys
• Planera nya projekt i linje med forskargruppens strategiska mål
• Delta aktivt i nationella och internationella samarbete
• Handleda studenter

Behörighetskrav

Behörig att anställas som senior forskningsinfrastrukturspecialist är den som har uppvisat vetenskaplig skicklighet och avlagt doktorsexamen eller har utländsk examen som bedöms motsvara svensk doktorsexamen. Den sökande ska även ha uppvisat teknisk och metodologisk skicklighet samt en god teknisk och metodologisk självständighet där de egna insatserna har varit betydelsefulla. Sökande ska uppvisat dokumenterad bred och djup kompetens inom ett flertal tekniker/metoder med inriktning mot både service och utveckling.

Specifika krav är:

• Minst 7 års erfarenhet efter doktorsexamen av att analysera biologiska data
• Dokumenterad erfarenhet av programmering i Python, R och bash
• Erfarenhet av programmering i C++ är meriterande
• Dokumenterad erfarenhet av att analysera NGS-data från både short- och long read-sekvensering
• Dokumenterad erfarenhet av hantering av olika omikdata
• Kunskap om reproducerbara arbetsflöden för dataanalys
• Erfarenhet av att utveckla pipelines för analys med hjälp av workflow-språk som Snakemake eller Nextflow
• Erfarenhet av att hantera Linux-baserade servrar samt kännedom om HPC
• Erfarenhet av paket-/miljöhanteringssystem, exempelvis Docker, Singularity och Conda
• Erfarenhet av att hantera kliniska data
• Utmärkt kommunikationsförmåga samt förmåga att arbeta både självständigt och i samarbete med kollegor från olika områden
• Doktorsexamen eller utländsk examen som bedöms motsvara doktorsexamen inom Bioinformatik

Bedömningsgrunder

• erfarenhet av att tillhandahålla service samt ge rådgivning brett inom och utanför organisationen,
• mycket god medvetenhet om utvecklingen av teknik och metoder inom forskningsinfrastruktur samt framgångsrikt själv bedrivit teknik och metodutveckling inom området,
• erfarenhet av lokala samarbeten samt samarbete med företag och/eller andra universitet nationellt och internationellt för att driva teknisk och eller metodologisk service av högsta kvalitet,
• erfarenhet av att utbilda användare, studenter och medarbetare i avancerade tekniker och metoder,
• deltagande i, och presentationer vid, konferenser och seminarier av relevans för området,
• har erfarenhet av att ha deltagit i ansökningar som erhållit finansiering för att driva forskningsinfrastruktur,
• erfarenhet av multidisciplinära samarbeten.

Det är utifrån en sammantagen helhetsbedömning av de sökandes meriter och skicklighet som Karolinska Institutet bedömer vilken av de sökande som har de bästa förutsättningarna att bidra till en positiv utveckling av verksamheten.

Vad erbjuder vi?

En kreativ och inspirerande miljö fylld av kompetens och nyfikenhet. Karolinska Institutet är ett av världens ledande medicinska universitet. Här bedriver vi framgångsrik medicinsk forskning och har det största utbudet av medicinska utbildningar i Sverige. På KI träffar du forskare med olika forskningsinriktningar som jobbar tillsammans. Det är det gränsöverskridande samarbetet som bidrar till KI:s världsledande position inom forskning. Flera av de personer du möter inom vården är utbildade på KI. En nära relationen till hälso- och sjukvården är viktig för att skapa utbildning och forskning av högsta kvalitet. Som universitet är Karolinska Institutet också en statlig myndighet. Det gör att du som anställd får goda förmåner genom vårt kollektivavtal.

Placering: Solna

 Din karriär fortsätter här

Ansökan

Vi ser gärna att din ansökan är skriven på engelska, men det går också bra att ansöka på svenska. Ansökan ska innehålla följande handlingar: Bevis om doktorsexamen, CV, meriter som presenteras i enlighet med Karolinska Institutets meritportfölj för forskningsinfrastrukturspecialist/senior forskningsinfrastrukturspecialist.

Varmt välkommen med din ansökan senast 2025-04-24

Ansökan ska göras via rekryteringssystemet Varbi.

Vid tillsvidareanställning tillämpar Karolinska Institutet 6 månaders provanställning.

Vill du göra skillnad – och bidra till en bättre hälsa för alla? Sök jobb hos oss!