Postdoktor i regulatorisk genomik inom neurovetenskap

Vill du bidra till medicinsk forskning av toppkvalitet?

Institutionen för cell -och molekylärbiologi (CMB) är en institution med fokus på grundforskning. CMB bedriver forskning och utbildning inom cellbiologi, molekylärbiologi, utvecklingsbiologi, stamcellsbiologi, cancer och infektionsbiologi. CMB ligger i Biomedicum, ett nytt interdisciplinärt forskningscenter utformat för att samla den experimentella forskningen som bedrivs på Karolinska Institutet Campus Solna under ett tak för att främja och uppmuntra samarbete. Biomedicum inhyser ca 1200 forskare och möjliggör att dyrare utrustning kan delas mellan grupperna och användas så effektivt som möjligt.

Forskargruppen

Llorens-laboratoriet erbjuder en levande, stimulerande och internationell miljö. Vi är en del av institutionen för cell- och molekylärbiologi vid Karolinska Institutet i Stockholm, Sverige, ett av världens ledande medicinska universitet. Labbet ligger i Biomedicum, ett av Europas största laboratorier med toppmoderna faciliteter och rika möjligheter till samarbete och karriärutveckling.

Vårt labb är intresserade av att stimulera regenerering i däggdjurens centrala nervsystem (CNS). Vi strävar efter att avslöja principerna för reglering av genuttryck under utveckling och återanvända dem för regenerering. Vi använder ett multidisciplinärt tillvägagångssätt som involverar stamcellsbiologi, systembiologi, beräkningsbiologi, molekylär ingenjörskonst och djurmodeller av sjukdomar.

I nyligen genomförda arbeten upptäckte vi en latent regenerativ potential i vuxna ryggmärgsstamceller med hjälp av enkelcellsmultiomik och designade en riktad intervention för att framkalla sådan potential (Llorens-Bobadilla et al. Science 2020). Parallellt utvecklar vi också nya teknologier för rumsligt upplöst multiomik (Llorens-Bobadilla et al. Nature Biotech 2023).

De aktuella projekten syftar till att använda beräkningsmodellering av multiomiska encells- och rumsgenomiska datauppsättningar, för att avslöja principer för genuttrycksreglering under CNS-skada och återanvända dem för regenerering med hjälp av syntetisk genomik.

Länk till labbets hemsida: https://ki.se/en/cmb/enric-llorens-group

Din roll

Vi söker en mycket motiverad och entusiastisk postdoktoral forskare som kan tillämpa avancerade metoder inom enkelcells- och spatial genomik i kombination med beräkningsmässiga angreppssätt för att förstå mekanismer bakom reparation och regeneration av nervkretsar. Kandidaten kommer att integrera storskaliga transkriptomiska och epigenomiska dataset med moderna djupinlärningsmodeller för att koppla sekvens till funktion och därigenom bidra till utvecklingen av regenerativa terapier i nervsystemet.

Tjänsten kombinerar praktiska neurovetenskapliga experimentella metoder med data-drivna analyser.

Vem är du?

Vi söker en mycket motiverad och självgående neuroforskare med en stark meritlista och relevant erfarenhet från doktorandstudier och/eller tidigare postdoktoralt arbete. En stark publikationslista samt en nyligen avlagd doktorsexamen kommer att betraktas som meriterande. Den framgångsrika sökanden förväntas ha en bakgrund och ett starkt intresse inom ett eller flera av följande områden: enkelcells- och/eller spatial genomik, beräkningsbiologi, maskininlärning, bioinformatik och systemneurovetenskap. Tidigare erfarenhet av djupinlärning tillämpad på biologiska data är en fördel. Praktisk erfarenhet av neurovetenskapliga experimentella metoder (t.ex. kirurgiska ingrepp, viral eller genetisk manipulation, kretskartläggning eller liknande tekniker) kommer att betraktas som en stark merit. Goda kommunikativa färdigheter i talad och skriven engelska är ett krav.

• Avlagd doktorsexamen i neurovetenskap, bioinformatik, artificiell intelligens, datavetenskap, bioingenjörsvetenskap eller motsvarande ämnesområde.
• Erfarenhet av högpresterande beräkningar.
• Erfarenhet av maskininlärning (t.ex. TensorFlow/Keras/PyTorch) är meriterande.
• Erfarenhet av enkelcells- eller spatial genomik är meriterande.
• Praktisk laboratorieerfarenhet inom neurovetenskap är meriterande.

För att anställas som postdoktor krävs avlagd doktorsexamen eller en utländsk examen som bedöms motsvara en svensk doktorsexamen. Detta behörighetskrav ska vara uppfyllt senast vid tidpunkten då anställningsbeslutet fattas. Det är meriterande om du har avlagt din doktorsexamen inom de tre senaste åren, om det finns särskilda skäl kan din examen ha avlagts tidigare.

Vad erbjuder vi?

En kreativ, internationell inspirerande miljö fylld av kompetens och nyfikenhet. Karolinska Institutet är ett av världens ledande medicinska universitet. Här bedriver vi framgångsrik medicinsk forskning och har det största utbudet av medicinska utbildningar i Sverige. På KI får du träffa forskare med olika forskningsinriktningar som jobbar tillsammans. Det är det gränsöverskridande samarbetet som bidrar till KI:s världsledande position inom forskning. Flera av de personer du möter inom vården är utbildade på KI. En nära relationen till hälso- och sjukvården är viktig för att skapa utbildning och forskning av högsta kvalitet. Som universitet är Karolinska Institutet också en statlig myndighet. Det gör att du som anställd får goda förmåner genom vårt kollektivavtal.

Placering: Stockholm

[Video om Karolinska Institutet, hur vi alla bidrar till "en bättre hälsa för alla"] 

Ansökan

Ansökan ska bestå av följande handlingar, skrivna på engelska eller svenska:

• Bevis om doktorsexamen
• Ett komplett CV inkluderande disputationsdatum, avhandlingens titel, tidigare akademiska befattningar, akademisk titel, nuvarande befattning, akademiska utmärkelser samt kommittéarbete
• En komplett publikationslista
• En sammanfattning av nuvarande arbete (maximalt en sida)

Ansökan ska göras via rekryteringssystemet Varbi.  

Vill du göra skillnad – och bidra till en bättre hälsa för alla? Sök jobb hos oss!