Postdoktor i beräkningsbiologi för encelliga RNA

Vill du bidra till medicinsk forskning av toppkvalitet?

Institutionen för mikrobiologi, tumör- och cellbiologi (MTC) vid Karolinska Institutet bedriver forskning och undervisning inom immunologi, infektionsbiologi, cellbiologi och cancer. MTC har cirka 40 forskargrupper och våra nyckelord är multidisciplinära, överbryggande, nationella och internationella samarbeten.

Vår grupp kombinerar experimentellt och beräkningsmässigt arbete och syftar till att utveckla och tillämpa nya genomomfattande tekniker för att ta itu med grundläggande biologiska frågor med medicinska implikationer. Vi är särskilt intresserade av hur subtila variationer i genuttryck kan leda till differentiella cellulära fenotyper och brinner för RNA-biologi (http://pelechanolab.com/). Du kommer att ha möjlighet att arbeta i en mycket tvärvetenskaplig och internationell miljö och kombinera utvecklingen av toppmoderna genomomfattande metoder med molekylär dissektion av grundläggande biologiska problem.

Är du intresserad av mRNA:s öde och lokalisering? Vill du utveckla banbrytande beräkningsverktyg för att studera RNA-lokalisering och öka vår förståelse av RNA-liv? Följ med oss ​​på SciLifeLab!

Division

Vårt laboratorium ligger på Science for Life Laboratory-avdelningen vid MTC (SciLifeLab, http://www.scilifelab.se/) på Karolinska Institutets campus. SciLifeLab är utrustat med toppmoderna instrument och centrala faciliteter. Vår avdelning är engagerad i att främja vetenskaplig kunskap och utveckla banbrytande teknologier inom områdena molekylärbiologi, genomik och bioinformatik.

Din roll

Den lediga postdoktorala tjänsten avser utveckling och tillämpning av nya beräkningsmetoder för att studera genuttryck och RNA-lokalisering. Kandidaten kommer att fokusera på utveckling av nya RNA-metoder för att förstå mRNA-isoformers roll i diversifieringen av mRNA:s subcellulära lokalisering. Kandidaten kommer att integrera olika beräkningsmetoder för att slutföra projektet, inklusive långläsningssekvensering, spatial transkriptomik och olika NGS-metoder och pipelines i olika mänskliga cellmodeller. Detta kommer att inkludera studier av lokaliserad translationsreglering och andra relaterade processer som svar på miljö- och läkemedelsstörningar med hjälp av nya verktyg som vårt laboratorium nyligen har utvecklat. Kandidaten kommer att utföra originalforskning inom transkriptomik och beräkningsbiologi och förvärva de experimentella och beräkningsmässiga färdigheter som krävs för att slutföra projektet.

Kandidaten förväntas kommunicera de vetenskapliga resultaten genom att skriva vetenskapliga artiklar och delta i vetenskapliga möten. Den ideala kandidaten kommer att delta i teamets allmänna arbetsuppgifter och effektivt kommunicera med forskare med mycket varierande bakgrund i en mycket tvärvetenskaplig och internationell miljö. Arbetsspråket är engelska.

Vem är du?

För att anställas som postdoktor krävs avlagd doktorsexamen eller en utländsk examen som bedöms motsvara en svensk doktorsexamen. Detta behörighetskrav ska vara uppfyllt senast vid tidpunkten då anställningsbeslutet fattas. Det är meriterande om du har avlagt din doktorsexamen inom de tre senaste åren, om det finns särskilda skäl kan din examen ha avlagts tidigare.

De framgångsrika sökanden bör ha erfarenhet av att tolka biologiska data med ett starkt intresse för tvärvetenskaplig teknikutveckling. Lämpliga kandidater bör ha omfattande erfarenhet av beräkningsmetoder och NGS-analys. Forskningserfarenhet av storskaliga analyser och bioinformatik (NGS, RNA-variantanalys, Python, batch- och/eller R-skriptspråk) är också nödvändigt. Kandidater bör ha en högkvalitativ publikationslista, goda kunskaper i engelska (muntligt och skriftligt) och motivation att studera underliggande mekanismer för genreglering hos eukaryoter. Vid anställningen kommer särskild vikt att läggas vid vetenskaplig skicklighet av relevans för projektet och vid tidigare forskningserfarenhet.

• Den framgångsrika sökanden bör ha erfarenhet av att tolka biologiska data och experimentellt testa sina hypoteser med ett starkt intresse för tvärvetenskaplig teknikutveckling.
• Lämpliga kandidater bör ha omfattande erfarenhet av långläsningssekvensering och spatial transkriptomik.
• Forskningserfarenhet av storskaliga analyser och bioinformatik (NGS, RNA-variantanalys, Python, batch- och/eller R-skriptspråk) är också nödvändigt.
• Vid anställningen kommer särskild vikt att läggas vid vetenskaplig skicklighet av relevans för projektet och vid tidigare forskningserfarenhet.
• Goda sociala färdigheter och förmåga att arbeta i team är avgörande.

Utöver ovanstående krav för tjänsten:

• Erfarenhet av RNA-biologi, med fokus på alternativ splicing och UTR-användning.
• Ett starkt intresse för tvärvetenskaplig teknikutveckling, samt nya och kreativa tänkande förmågor är avgörande.

Meriterande för tjänsten:

• Tidigare erfarenhet av neurobiologi och/eller cellspårning.

Vad erbjuder vi?

En kreativ, internationell inspirerande miljö fylld av kompetens och nyfikenhet. Karolinska Institutet är ett av världens ledande medicinska universitet. Här bedriver vi framgångsrik medicinsk forskning och har det största utbudet av medicinska utbildningar i Sverige. På KI får du träffa forskare med olika forskningsinriktningar som jobbar tillsammans. Det är det gränsöverskridande samarbetet som bidrar till KI:s världsledande position inom forskning. Flera av de personer du möter inom vården är utbildade på KI. En nära relationen till hälso- och sjukvården är viktig för att skapa utbildning och forskning av högsta kvalitet. Som universitet är Karolinska Institutet också en statlig myndighet. Det gör att du som anställd får goda förmåner genom vårt kollektivavtal.

Placering: Solna

 Tio skäl att välja Karolinska Institutet

http://pelechanolab.com/

Ansökan

Ansökan ska bestå av följande handlingar, skrivna på engelska eller svenska:

• Bevis om doktorsexamen
• Ett komplett CV inkluderande disputationsdatum, avhandlingens titel, tidigare akademiska befattningar, akademisk titel, nuvarande befattning, akademiska utmärkelser samt kommittéarbete
• En komplett publikationslista
• En sammanfattning av nuvarande arbete (maximalt en sida)

Ansökan ska göras via rekryteringssystemet Varbi.  

Vill du göra skillnad – och bidra till en bättre hälsa för alla? Sök jobb hos oss!