Postdoktor i masscytometri och cellimmunologi i samarbete med WASP och DDLS

Vill du bidra till medicinsk forskning av toppkvalitet?

Petter Brodins forskargrupp vid Science for Life Laboratory-Stockholm är en del av avdelningen för klinisk pediatrik, som är en bred, multidisciplinär avdelning vid Institutionen för kvinnors och barns hälsa, Karolinska Institutet. Gruppen utvecklar och tillämpar experimentella och beräkningsmetoder för analyser av det mänskliga immunsystemet på systemnivå. Syftet med teamet är att förstå immunsystemets variation i hälsa och sjukdom och de reglerande mekanismer som ligger bakom sådan variation och anpassning till miljöpåverkan. Ett annat viktigt fokus är utvecklingen av immunförsvar tidigt i livet. Gruppen är till hälften experimentell och till hälften beräkningsbaserad, med en tvärvetenskaplig miljö.

I Brodin-labbet använder teamet toppmodern encellsteknologi för att studera immunologi i mänskliga system, varav masscytometri, som är en av de mest avancerade cytometriska plattformarna, används flitigt i många olika studier av labbet. Prover, mestadels från blod eller isolerade PBMC:er multiplexeras och färgas med en unik vätskehanteringsrobotplattform, som färgar celler med metallmärkta antikroppar och samlar in data med hjälp av automatiserade masscytometrar.

Brodinlabbet söker anställa en postdoc ansvarig för bearbetning av prover och insamling av data med masscytometri. Arbetet är praktiskt i laboratoriet och involverar provberedning, antikroppskoppling till sällsynta jordartsmetallsonder, reagensberedning och drift av vätskehanteringsrobotplattformen för provberedning och insamling av prover genom masscytometri. Tjänsten är en heltidsanställning, 40h vecka.

Denna position är en del av ett samarbete mellan de två största forskningsprogrammen i Sverige, Wallenberg AI, Autonomous Systems and Software Program, (WASP) samt SciLifeLabs och Wallenbergs nationella program för datadriven livsvetenskap (Data-Driven Life Science, DDLS). Målet är att lösa banbrytande tvärdisciplinära forskningsfrågor.

Wallenberg AI, Autonomous Systems and Software Program, WASP, är Sveriges största enskilda forskningsprogram i modern tid. Programmet skapar en plattform för akademisk forskning och utbildning i nära samarbete med ledande svensk teknikintensiv industri. Forskningen innefattar artificiell intelligens och autonoma system som verkar i samarbete med människor och som anpassar sig till sin omgivning med hjälp av sensorer, information och kunskap och skapar intelligenta system av system. WASPs vision är excellent forskning och kompetens inom artificiell intelligens, autonoma system och mjukvara till gagn för svensk industri. Läs mer: https://wasp-sweden.org/

SciLifeLabs och Wallenbergs nationella program för datadriven livsvetenskap (Data-Driven LifeScience, DDLS) är ett 12-årigt initiativ fokuserat på datadriven forskning inom områden som är nödvändiga för att förbättra människors liv, upptäcka och behandla sjukdomar, skydda biodiversitet och skapa hållbarhet. Programmet kommer att utbilda och stötta nästa generation av forskare inom livsvetenskap och skapa en stark datavetenskaplig bas. Programmet avser stärka nationella samarbeten mellan universitet, koppla samman forskare inom livs- och datavetenskap samt att skapa samarbeten med industri, sjukvården och andra nationella och internationella aktörer. Läs mer: https://www.scilifelab.se/data-driven

Din roll

Ansvaret för denna postdoc i labbet kommer huvudsakligen att innebära:

Masscytometrispecifika uppgifter:
• Konjugering av antikroppar mot metallisotoper som används som prober i masscytometri
• Testning och titrering av sonder med masscytometri (och validering med flödescytometri vid behov)
• Analysera masscytometridata med FlowJo, FCExpress eller anpassad scripting i r/python.
• Noggrant och felfritt underhåll av antikroppsdatabas/inventering i labbet på kontinuerlig basis
• Förstå tekniken och använda masscytometerinstrumenten genom att arbeta nära den person som ansvarar för masscytometri i gruppen
• Lära sig att använda de automatiserade robotplattformarna för olika steg i masscytometriexperiment och underhåll av robotuppsättningen för effektiv och felfri prestanda
• Insamling av prover, övervakning och skötsel av maskinen när så önskas
• Följa de rutiner som fastställts i labbet för underhåll av masscytometrarna
• Systematisk registrering av experiment och utförda uppgifter

Andra uppgifter i labbet: klinisk provmottagning, bearbetning och inspelning av prov/ämnesmetadata i databasen, utföra andra experimentella forskningsprojektrelaterade uppgifter som att sätta upp cellkulturer, stimulera celler, skörda celler och så vidare.

Vem är du?

Behörig att anställas som postdoktor är den som har avlagt doktorsexamen eller har motsvarande vetenskaplig kompetens. Även sökande som inte avlagt doktorsexamen vid ansökningstidens utgång kan söka under förutsättning att alla krav för fullgjord examen uppfylls innan (avsett) anställningsdatum. Detta ska styrkas av sökandes huvudhandledare, studierektor eller motsvarande.

Den framgångsrika kandidaten måste ha tidigare erfarenhet av masscytometriexperimentering såsom cellfärgning och provbearbetning, provinsamling, erfarenhet av att analysera 'mascytometri'-data med FlowJo eller liknande (erfarenhet av andra verktyg för analys är ett plus), provstreckkodning och antikropp färgningsprocedurer för masscytometri, uppsättning av cellkulturer, blodprovshantering, erfarenhet av metodutveckling med iterativ testning av protokoll och noggrann dokumentation, noggrann och systematisk journalföring. Den framgångsrika kandidaten måste trivas i tvärvetenskapliga miljöer och bör vara dedikerad till att utföra de uppgifter som tilldelats i labbet felfritt och med stor omsorg. Kandidaten måste vara bekväm med att arbeta både självständigt och i samarbete med teamledaren för masscytometri/cellulär immunologi (genom att följa specifika instruktioner) och andra medlemmar i teamet (vid behov) och bidra till teamets samordnade ansträngningar. Kandidaten ska ha god kommunikationsförmåga på engelska då teamet är mångkulturellt och tvärvetenskapligt.

Ett urval kommer att göras bland kvalificerade sökande utifrån följande kriterier:
1) Strikt dokumenterad erfarenhet av några av de ovan nämnda kraven utan vilka vi inte uppmuntrar kandidaterna att ansöka
2) Beprövad erfarenhet av masscytometri och flödescytometri (förkunskaper om masscytometri är ett måste)
3) En bakgrund inom immunologi är värdefull.
4) Tidigare labberfarenhet genom dokumenterade publikationer och kunskaper inom biologi och flödescytometri. Publikationer inom masscytometri kommer att vara ett plus.
5) Motivationsbrev som visar specifikt intresse för projektet och arbetsbeskrivningen ovan enligt de strikta kraven

De sökandes kvalifikationer kommer att utvärderas på en övergripande basis.

Vad erbjuder vi?

En kreativ och inspirerande miljö fylld av kompetens och nyfikenhet. Karolinska Institutet är ett av världens ledande medicinska universitet. Vår vision är att driva utvecklingen av kunskap om livet och verka för en bättre hälsa för alla. Här bedriver vi framgångsrik medicinsk forskning och har det största utbudet av medicinska utbildningar i Sverige. Som universitet är Karolinska Institutet även en statlig myndighet. Det innebär att du får goda förmåner genom vårt kollektivavtal, generös semester och en bra tjänstepension. Du får träna fritt i våra moderna friskvårdsanläggningar och får ersättning för läkarvård.

Placering: Solna, SciLifeLab

Ansökan

Ansökan ska bestå av följande handlingar, skrivna på engelska eller svenska:

En komplett CV inkluderande disputationsdatum, avhandlingens titel, tidigare akademiska befattningar, akademisk titel, nuvarande befattning, akademiska utmärkelser samt kommittéarbete
En komplett publikationslista
En sammanfattning av nuvarande arbete (maximalt en sida)

Varmt välkommen med din ansökan senast den 23 December 2021.

Ansökan ska göras via rekryteringssystemet Varbi.

Vill du göra skillnad – och bidra till en bättre hälsa för alla? Sök jobb hos oss