Bioinformatiker inom sekvensanalys och design

Vill du bidra till medicinsk forskning av toppkvalitet?

Institutionen för mikrobiologi, tumör- och cellbiologi (MTC) vid Karolinska Institutet bedriver forskning och undervisning inom immunologi, infektionsbiologi, cellbiologi och cancer. MTC har cirka 40 forskargrupper och våra nyckelord är multidisciplinära, överbryggande, nationella och internationella samarbeten. 

Murrell-labbet, vid MTC, KI, är ett blandat beräknings- och experimentlabb som arbetar i skärningspunkten mellan beräkningsbiologi, virologi, immunologi och evolution. Se här för senaste arbete: https://scholar.google.com/citations?user=I80vy5cAAAAJ&sortby=pubdate

Pågående projekt involverar att bygga modeller för molekylär evolution och olika tillämpningar av djupinlärning.

Din roll

Arbetsuppgifterna i denna roll innefattar:

• Att bidra till, skapa och underhålla Julia kodbaser och paket
• Att genomföra beräkningsexperiment, jämföra metoder osv
• Att underhålla och administrera labbets datorinfrastruktur

Vem är du?

Krav för rollen:

• Påvisbar expertis inom programmering och metodutveckling inom beräkningsbiologi, speciellt relaterade till ämnen inom sekvensanpassning, proteinstrukturrepresentation och manipulation samt visualisering.
• Påvisbar expertis och produktivitet på hög nivå med programmeringsspråket Julia, specifikt i en beräkningsbiologimiljö, med flera offentligt tillgängliga Julia-paket som du har skapat och underhåller, med omfattande och aktiva bidrag under det senaste året.
• Erfarenhet av GPU-datorer i Julia, inklusive genom gränssnitt som Flux.jl, och att skriva anpassade CUDA-kärnor.
• Förtrogenhet med begrepp inom grundläggande sannolikhetsteori, geometri och linjär algebra.
• Minst viss arbetslivserfarenhet (ej samtidigt med utbildning) i en roll som bioinformatiker.
• Förmåga att kommunicera (i tal och skrift) tydligt på engelska

Expertis i Julia kommer att bedömas via ett tekniskt programmeringstest.

Vad erbjuder vi?

En kreativ, internationell och inspirerande miljö fylld av kompetens och nyfikenhet. Karolinska Institutet är ett av världens ledande medicinska universitet. Vår vision är att driva utvecklingen av kunskap om livet och verka för en bättre hälsa för alla. Här bedriver vi framgångsrik medicinsk forskning och har det största utbudet av medicinska utbildningar i Sverige. Som universitet är Karolinska Institutet en statlig myndighet. Det gör att du får goda förmåner genom vårt kollektivavtal. Medarbetare på KI erbjuds också möjlighet till ett flexibelt arbetssätt. Det innebär att om den verksamhet du jobbar i tillåter, så kan du arbeta en del av din arbetstid på distans. Du får även träna fritt i våra moderna friskvårdsanläggningar där utbildad personal finns på plats.  

Placering: Solna

Tio skäl att välja Karolinska Institutet

Ansökan

Varmt välkommen med din ansökan senast 2024-09-27.

Ansökan ska göras via rekryteringssystemet Varbi. I denna rekrytering söker du med ditt CV utan personligt brev. I ansökningsformuläret kommer du istället att få svara på några frågor om varför du söker jobbet. 

Vid tillsvidareanställning tillämpar Karolinska Institutet 6 månaders provanställning.

Vill du göra skillnad – och bidra till en bättre hälsa för alla? Sök jobb hos oss