Postdoktor i "single-cell spatial transcriptomics" - Under tillsättning eller tillsatt, ej sökbar

Vill du bidra till medicinsk forskning av toppkvalitet?

Ratz Lab- under ledning av Michael Ratz vid institutionen för cell- och molekylärbiologi söker en postdoktor. Labbet är beläget på KI:s campus Solna i Biomedicum, ett nytt och tvärvetenskapligt forskningscentrum med avancerade laboratorier och moderna faciliteter utformade för att främja forskning och samarbete. Ratz-labbet använder och skapar nya molekylära verktyg (t.ex. cellulär streckkodning och encellig rumslig transkriptomik) för att förstå utvecklingen av neurala kretsar i däggdjurshjärnan i hälsa och sjukdom.

Din roll

Projektet kombinerar grundforskning inom molekylär neurovetenskap med beräknings- och experimentell metodutveckling. Du kommer att skapa ett beräkningsramverk för design och analys av 3D in situ RNA-seq experiment och använda metoden för att undersöka stora datamängder som kommer att samlas in från streckkodade mushjärnor (se: Ratz et al., Nature Neuroscience, 2022; Shi et al. al., Nature, 2023). Din huvudsakliga roll kommer att vara att utveckla de beräkningsmetoder som är involverade i detta datadrivna projekt. Du kommer att arbeta nära med experimentella såväl som beräkningsforskare inne i labbet.

Vem är du?

För att anställas som postdoktor krävs avlagd doktorsexamen eller en utländsk examen som bedöms motsvara doktorsexamen. Detta behörighetskrav ska vara uppfyllt senast vid tidpunkten då anställningsbeslutet fattas. Det är meriterande om du har avlagt din doktorsexamen inom de tre senaste åren, om det finns särskilda skäl kan din examen ha avlagts tidigare.

Kvalifikationer:

• Stark grund inom beräkningsbiologi/datavetenskap och utvecklings/molekylär neurovetenskap med doktorsexamen inom ett relevant område.
• Kunskaper i programmering (t.ex. med R och Python).
• Expertis inom enkelcellig och/eller rumslig transkriptomisk dataanalys av mushjärnceller med vanliga paket i R (t.ex. Seurat) och/eller Python (t.ex. scanpy).
• Expertis inom design och implementering av skräddarsydda beräkningsarbetsflöden för analys av encelliga och/eller rumsliga transkriptomiska data.
• Utmärkt kommunikations- och presentationsförmåga samt en samarbetsstrategi för forskning och förmåga att leda detta mycket tvärvetenskapliga projekt.

Meriter:

• Erfarenhet av att analysera encellsdata från genetiskt streckkodade celler.
• Expertis inom versionskontrollsystem (t.ex. Git).

Vad erbjuder vi?

En kreativ, internationell inspirerande miljö fylld av kompetens och nyfikenhet. Karolinska Institutet är ett av världens ledande medicinska universitet. Här bedriver vi framgångsrik medicinsk forskning och har det största utbudet av medicinska utbildningar i Sverige. På KI får du träffa forskare med olika forskningsinriktningar som jobbar tillsammans. Det är det gränsöverskridande samarbetet som bidrar till KI:s världsledande position inom forskning. Flera av de personer du möter inom vården är utbildade på KI. En nära relationen till hälso- och sjukvården är viktig för att skapa utbildning och forskning av högsta kvalitet. Som universitet är Karolinska Institutet också en statlig myndighet. Det gör att du som anställd får goda förmåner genom vårt kollektivavtal.

Placering: Solna

Ratz lab: https://www.ratzlab.org

Department of Cell and Molecular Biology: https://ki.se/en/cmb/department-of-cell-and-molecular-biology

Tio skäl att välja Karolinska Institutet
--[Video om Karolinska Institutet, hur vi alla bidrar till "en bättre hälsa för alla"] ---

Ansökan

Ansökan ska bestå av följande handlingar, skrivna på engelska eller svenska:

• En komplett CV inkluderande disputationsdatum, avhandlingens titel, tidigare akademiska befattningar, akademisk titel, nuvarande befattning, akademiska utmärkelser samt kommittéarbete
• En komplett publikationslista
• En sammanfattning av nuvarande arbete (maximalt en sida)

Varmt välkommen med din ansökan!

Ansökan ska göras via rekryteringssystemet Varbi.

Vill du göra skillnad – och bidra till en bättre hälsa för alla? Sök jobb hos oss