Forskningsingenjör

Har du en bakgrund i matematik eller fysik och vill tillämpa dina förmågor och kunskaper genom att modellera hur det mänskliga genomet är organiserat i cellkärnan?

En position som Forskningsingenjör i tredimensionell genommodellering är tillgänglig i Bienko-Crosetto-laboratoriet för kvantitativ genombiologi vid Science for Life Laboratory (SciLifeLab) i Stockholm.

Bienko-Crosetto-laboratoriet är fokuserat på att utveckla och tillämpa de allra senaste genomiska teknologierna för att kartlägga den spatiella organisationen hos kromatin i cellkärnan hos däggdjursceller, med det långsiktiga målet att förstå hur interaktioner mellan DNA, RNA och proteiner formar och styr kromatinstrukturen, både i normalfallet och vid patalogiska tillstånd.

Som Forskningsingenjör, med en stark bakgrund i matematik, kommer du att bidra till våra pågående ansträngningar i att generera precisa rekonstruktioner av genomets 3D-struktur i enskilda celler genom att kombinera stora mängder data från olika källor.

Du kommer att få verka i en dynamisk forskningsmiljö (https://bienkocrosettolabs.org/) där du kommer att arbeta tillsammans med experimentalister och analytiker och få en unik möjlighet att fördjupa dig i genomets tredimensionella biologi samtidigt vi kommer värdesätta din kreativitet.

Din roll

Dina huvudsakliga uppgifter kommer att vara:

Tillämpa metoder från Topologiska Dataanalys (TDA) för att identifiera nya mönster i komplexa omiska dataset, så som genereras med Hi-C och RADICL-seq.
Utveckla mjukvaran Chromflock, som vi har tagit fram i labbet, för att skapa 3D-strukturer för enskilda celler genom att integrera Hi-C data med genomomfattande radiella mätningar utförda med GPSeq-metoden, som vi också har utvecklat (Girelli m.fl., Nat Biotechnol 2020).

Vem är du?

Du har:

En magisterexamen i fysik eller matematik.
Dokumenterad erfarenhet av Topologisk Dataanalys (TDA).
Mycket goda kunskaper i åtminstone ett av följande programmeringsspråk: Python/C++/MATLAB/R och är bekväm med Linux och shellscript.
Förmåga att självständigt organisera ditt arbete och kan flexibelt anpassa ditt schema efter de behov som uppstår.
En problemlösande och framåtsträvande personlighet, det vill säga att du är motiverad att lösa de hinder som ligger i vägen för att uppnå dina mål, du tycker om att felsöka, är inte rädd för att be om hjälp, och du är beredd att omvärdera ditt angreppssätt även om det betyder att du måste revidera dina ursprungliga mål och planer (utan att för den skull tumma på den vetenskapliga rigorositeten eller kvalitén).
En förmåga att se till allas bästa, dvs du är en stark lagspelare.
Flytande i Engelska, både i tal och skrift

Vad erbjuder vi?

En kreativ, internationell och inspirerande miljö fylld av kompetens och nyfikenhet. Karolinska Institutet är ett av världens ledande medicinska universitet. Vår vision är att driva utvecklingen av kunskap om livet och verka för en bättre hälsa för alla. Här bedriver vi framgångsrik medicinsk forskning och har det största utbudet av medicinska utbildningar i Sverige. Som universitet är Karolinska Institutet en statlig myndighet. Det gör att du får goda förmåner genom vårt kollektivavtal. Medarbetare på KI erbjuds också möjlighet till ett flexibelt arbetssätt. Det innebär att om den verksamhet du jobbar i tillåter, så kan du arbeta en del av din arbetstid på distans. Du får även träna fritt i våra moderna friskvårdsanläggningar där utbildad personal finns på plats.

Placering: Solna

Ansökan

Ansökan ska göras via rekryteringssystemet Varbi. I denna rekrytering söker du med ditt CV utan personligt brev. I ansökningsformuläret kommer du istället att få svara på några frågor om varför du söker jobbet.

Vill du göra skillnad – och bidra till en bättre hälsa för alla? Sök jobb hos oss