Postdoc inom biokemi och CETSA/MS-baserad target validering

Vill du bidra till medicinsk forskning av toppkvalitet?

Vi söker en postdoc med intresse för biokemi och target validering. Projektet leds av Michael Sundström på Centrum för molekylär medicin (CMM) vars forskargrupp tillhör Structural Genomics Consortium (SGC) i samarbete med Pelago Bioscience som en del i ett större samarbetsprojekt: EUbOPEN finansierat av Innovative Medicines Initiative (IMI). EUbOPEN är ett samarbetsprojekt med 22 partners inom akademi och läkemedelsindustri med målsättningen att utveckla kemogenomiska substanser för 1/3 av det humana genomet. Postdoc-projektet är fokuserat på att mäta specificitet/selektivitet hos specifika kemiska prober med CETSA MS och även analysera deras eventuella off-target effekter på proteom-nivå.

Din roll

Det dagliga arbetet kommer förläggas i Pelago Biosciences laboratorium i Solna. Pelago grundades 2013 med målsättningen att utveckla den patenterade Cellular Thermal Shift Assay (CETSA®)-tekniken för förbättra läkemedelsutveckling och diagnostik. Företaget erbjuder in situ ’target engagement’-studier för att optimera preklinisk och klinisk läkemedelsutveckling och diagnostik åt sina kunder. Genom att använda CETSA-data och applikationer kan läkemedelsbolag fatta bättre och mer genomtänkta beslut tidigt i läkemedelsutvecklingsprojekt. Forskningsavdelningen på Pelago innefattar experter inom både riktad och explorativ proteomik (mass spektrometri)/CETSA applikationer.

Tjänsten innebär avancerad analys av kemiska substanser och hur de interagerar med proteiner i olika kombinationer genom MS-baserad CETSA för att få en detaljerad SAR (Structure Activity Relationship) kartläggning av det specifika target-proteinet, dess proteinfamilj och en signifikant del av proteomet. Information om off-target-effekter kommer vara av största betydelse. Målsättningen är att identifiera vilka skillnader i probe-kemin som leder till skillnader i specificitet/selektivitet och hur detta påverkas i celler t.ex. med avseende på cell-upptag och metabolism. Ett mål är att optimera screeningsplattformar för olika proteinfamiljer, samt att upprätta robusta screeningsanalyser. Postdoc-kandidaten förväntas planera, genomföra och analysera experiment på ett oberoende sätt och bidra vetenskapligt till EUbOPEN projektet.

Vem är du?

Doktorsexamen inom biokemi med publikationer i internationellt välrenommerade peer-review tidskrifter. Vi söker en vetenskapligt driven person med god kommunikationsförmåga och förmåga att samverka och arbeta produktivt i ett team. Flytande engelska är ett krav. Kandidaten ska ha tidigare erfarenhet av tidig läkemedelsutveckling, proteinbaserad biokemi samt cell- och vävnads-odling. Personen ska på egen hand kunna sätta upp, utveckla och genomföra screening och validering av läkemedelslika substanser med hjälp av CETSA och MS baserad profilering. Mycket goda praktiska kunskaper inom cellodling, molekylärbiologiska tekniker, mikroskopi, proteinkemi och cellbiologi är ett krav. Den ideala kandidaten har erfarenhet av toxicitetstester, förmåga att utveckla nya testsystem och erfarenhet av att samarbeta med läkemedelsindustrin. Kunskaper inom bioinformatik såsom struktur och ligand-baserad virtuell screening är meriterande. Vid tillsättningen av tjänsten kommer vi att lägga särskild vikt vid laborativa färdigheter, visad kompetens inom forskning, ett starkt engagemang och utmärkt kommunikationsförmåga.

Behörig att anställas som postdoktor är den som har avlagt doktorsexamen eller har motsvarande vetenskaplig kompetens. Även sökande som inte avlagt doktorsexamen vid ansökningstidens utgång kan söka under förutsättning att alla krav för fullgjord examen uppfylls innan (avsett) anställningsdatum. Detta ska styrkas av sökandes huvudhandledare, studierektor eller motsvarande.

Vad erbjuder vi?

En kreativ och inspirerande miljö fylld av kompetens och nyfikenhet. Karolinska Institutet är ett av världens ledande medicinska universitet. Vår vision är att driva utvecklingen av kunskap om livet och verka för en bättre hälsa för alla. Här bedriver vi framgångsrik medicinsk forskning och har det största utbudet av medicinska utbildningar i Sverige. Som universitet är Karolinska Institutet även en statlig myndighet. Det innebär att du får goda förmåner genom vårt kollektivavtal, generös semester och en bra tjänstepension. Du får träna fritt i våra moderna friskvårdsanläggningar och får ersättning för läkarvård.

Placering: Tjänsten är placerad på institutionen för medicin, Solna, avdelningen för reumatologi i Per-Johan Jakobssons forskargrupp & Pelago Bioscience.

Ansökan

Ansökan ska bestå av följande handlingar, skrivna på engelska eller svenska:

Ett personligt brev som förklarar intresset för tjänsten
En komplett CV inkluderande disputationsdatum, avhandlingens titel, tidigare akademiska befattningar, akademisk titel, nuvarande befattning, akademiska utmärkelser samt kommittéarbete
En komplett publikationslista
Kontaktinformation till två referenspersoner

Ansökan ska göras via rekryteringssystemet Varbi.

Vill du göra skillnad – och bidra till en bättre hälsa för alla? Sök jobb hos oss