Bioinformatiker (vikariat) till Clinical Genomics Stockholm

Vill du bidra till framtidens precisionsmedicin i den molekylära diagnostikens frontlinje

Vi söker en bioinformatiker för ett vikariat. Du blir en viktig del i den pågående implementeringen av storskalig DNA-sekvensering inom den molekylära precisionsdiagnostiken i sjukvården. Rollen passar dig som har erfarenhet av att utveckla bioinformatiska flöden för analys av storskalig sekvenseringsdata och som vill arbeta i en dynamisk miljö nära både laboratorium och klinisk verksamhet.

Du blir en nyckelperson i ett multidisciplinärt team där du arbetar nära läkare, molekylärbiologer, bioinformatiker och mjukvaruutvecklare, både inom Clinical Genomics och i samarbete med sjukvården vid Karolinska Universitetssjukhuset samt forskargrupper vid Karolinska Institutet. Med hjälp av den senaste tekniken för storskalig DNA-sekvensering bidrar du till att ta fram träffsäkra molekylära diagnoser som gör verklig skillnad för patienterna.

Om oss

Clinical Genomics Stockholm är en nationell forskningsinfrastruktur vid Science for Life Laboratory (SciLifeLab). Vårt uppdrag är att möjliggöra implementeringen av precisionsdiagnostik och precisionsmedicin i Sverige.

Vi samarbetar med forskare och vårdgivare över hela landet för att utföra avancerade genom- och transkriptomanalyser baserade på storskalig DNA-sekvensering, samtidigt som vi vidareutvecklar metoder och analysflöden. Målet är att säkerställa världsledande forskning och diagnostik i internationell framkant.

Avdelningen har ca 50 medarbetare med kompetenser inom genomik, bioinformatik, mjukvaruutveckling, IT och kvalitetssäkring. Vi driver ett modernt, högautomatiserat laboratorium med stor sekvenseringskapacitet. Våra bioinformatiska analysflöden och mjukvara utvecklas som öppen källkod.

Läs mer: Clinical Genomics Stockholm

Din roll

Som bioinformatiker arbetar du med avancerade genomikanalyser och bidrar till att utveckla precisionsmedicin i Sverige.

Dina arbetsuppgifter omfattar bland annat:

• Vidareutveckling av bioinformatiska analysflöden för DNA- och RNA-data från storskalig sekvensering
• Validera analysflöden och säkerställa att de uppfyller klinska och regulatoriska krav
• Samarbeta tätt med kliniker och forskare för att förstå behov och säkerställa klinisk relevans
• - Analys av patientprover inom externa forskningsprojekt och kliniska implementationsprojekt

Vem är du?

Vi söker en kandidat med både teknisk kompetens och förståelse för klinisk relevans.

Krav för rollen:

• Magister-, civilingenjörs- eller motsvarande examen inom bioinformatik, datavetenskap eller liknande
• Erfarenhet av bioinformatik inom storskalig DNA-sekvensering (NGS) från Illumina, ONT eller PacBio
• Goda programmeringskunskaper i Python
• Vana att arbeta i Linuxmiljö
• Erfarenhet av containerteknologier (t.ex. Singularity, Docker)
• Erfarenhet av arbete i HPC-miljö, gärna med SLURM
• Kunskap i versionshantering (Git)
• Mycket god förmåga att uttrycka dig på engelska, både muntligt och skriftligt

Meriterande erfarenhet:

• Doktorsexamen inom bioinformatik, bioteknik, medicin eller liknande område
• Erfarenhet av automatiserad testning, CI och strukturerad kod
• Kunskaper i Nextflow eller liknande ramverk för automatisering av beräkningsanalyser
• Erfarenhet av utveckling i kvalitetssäkrade miljöer
• Fördjupade kunskaper inom human genomik

Vi söker dig som är ansvarstagande, drivande och har en positiv inställning. Du trivs med att arbeta i team och bidrar aktivt till samarbete både internt och externt. Stor vikt läggs vid personlig lämplighet.

Vad erbjuder vi?

En kreativ, internationell och inspirerande miljö fylld av kompetens och nyfikenhet. Karolinska Institutet är ett av världens ledande medicinska universitet. Vår vision är att driva utvecklingen av kunskap om livet och verka för en bättre hälsa för alla. Här bedriver vi framgångsrik medicinsk forskning och har det största utbudet av medicinska utbildningar i Sverige. Som universitet är Karolinska Institutet en statlig myndighet. Det gör att du får goda förmåner genom vårt kollektivavtal. Medarbetare på KI erbjuds också möjlighet till ett flexibelt arbetssätt. Det innebär att om den verksamhet du jobbar i tillåter, så kan du arbeta en del av din arbetstid på distans. Du får även träna fritt i våra moderna friskvårdsanläggningar där utbildad personal finns på plats.  

Placering: Solna

Tio skäl att välja Karolinska Institutet

Ansökan

Varmt välkommen med din ansökan senast 2025-10-19

Ansökan ska göras via rekryteringssystemet Varbi. I denna rekrytering söker du med ditt CV utan personligt brev. I ansökningsformuläret kommer du istället att få svara på några frågor om varför du söker jobbet. 

Vill du göra skillnad – och bidra till en bättre hälsa för alla? Sök jobb hos oss