Bioinformatiker med expertis inom precisionsmedicin

Vill du bidra till medicinsk forskning av toppkvalitet?

SciLifeLab är en unik nationell forskningsinfrastruktur som tillhandahåller tjänster och dataresurser för livsvetenskaplig forskning med målet att möjliggöra banbrytande, mångvetenskaplig forskning och främja att forskningen tillämpas till nytta för samhället.

SciLifeLab och Wallenbergs nationella program för datadriven livsvetenskap (DDLS) fokuserar på datadriven forskning, inom områden som är grundläggande för att förbättra människors liv, upptäcka och behandla sjukdomar, skydda biologisk mångfald och bidra till hållbar utveckling. Programmet avser att utbilda och rekrytera nästa generation av forskare inom datadriven livsvetenskap samt att skapa starka och internationellt konkurrenskraftiga beräknings- och datavetenskapliga forskningskapaciteter inom svensk livsvetenskap.

DDLS-programmet har etablerat en nationell nod inom precisionsmedicin och diagnostik, med ett nationellt ansvar för att utveckla datatjänster och tillhandahålla bioinformatikstöd. Nodens personal är anställda på Karolinska Institutet (KI), med placering vid Compliance & Data Office (CDO) på KIs campus i Solna, nära SciLifeLabs Stockholmsnod. CDO tillhandahåller brett stöd inom datahantering, hälsodata, kliniska studier, etik och juridisk rådgivning, och utvecklar nu inom DDLS-programmet mer specifikt stöd för precisionsmedicin och diagnostik. Placeringen möjliggör också nära interaktioner med regionala och lokala precisionsmedicinsinitiativ, t. ex. Precision Medicine Center Karolinska som är ett samarbete med Karolinska sjukhuset. Bioinformatiktjänsten är integrerad med SciLifeLabs bioinformatikplattform (NBIS), en unik nationell infrastruktur med över 100 medarbetare, som tillhandahåller avancerad support, infrastruktur och utbildning till svenska forskare. Vi söker nu en enastående kandidat, med kompetens inom datadriven precisionsmedicin och relaterade dataanalyser, för att tillhandahålla avancerat bioinformatikstöd till vetenskapligt framstående datadrivna svenska forskningsprojekt inom precisionsmedicin och diagnostik.

Din roll

De huvudsakliga arbetsuppgifterna är att:

Utföra avancerade dataanalyser inom datadrivna projekt.
Potentiellt utveckla verktyg och arbetsflöden för sådana analyser.
Lära ut bioinformatik till andra forskare genom att samarbeta inom projekt, undervisa på nationella kurser och delta i konsultationer.
Bidra till den löpande utvecklingen av DDLS-programmet och SciLifeLabs bioinformatikplattform på en nationell nivå.

Analysarbetet kan till exempel inbegripa klassificering av patienter utifrån molekylära profiler och journaldata för att utveckla metoder som möjliggör mer informerade beslut om behandling. Arbetet kan också inbegripa stöd till preklinisk forskning, exempelvis studier i modellsystem för att öka kunskapen om sjukdomsmekanismer genom analys av multiomikdata, mikroskopibilder och/eller dos-respons profiler.

Vem är du?

Kvalifikationer

Vi söker en driven bioinformatiker med gedigen erfarenhet av storskaliga dataanalyser inom medicinsk forskning. Den sökande behöver uppfylla följande krav:

Doktorsexamen inom bioinformatik, biomedicin, datavetenskap eller annat relaterat område som arbetsgivaren finner relevant för anställningen.
Stor erfarenhet (minst 3 år) av avancerade bioinformatikanalyser på storskaliga molekylära data (t. ex. genetisk variation, transkriptomik, proteomik eller metabolomik) i relation till hälsoutfall, som sjukdomsrisk, överlevnadstid och behandlingssvar, i människa eller modellsystem.
Erfarenhet av biostatistik eller maskininlärning, och kunskap om när det är lämpligt att använda sådana metoder och deras begränsningar.
God förmåga i ett eller flera programmeringsspråk, samt i att arbeta effektivt i Linux kommandoradsmiljö och på storskaliga datorkluster.
Flytande behärska talad och skriven engelska.
Skicklig på att samarbeta och kommunicera med andra, liksom förmåga att driva projekt självständigt.

Meriter

Postdoktorala studier är en stark merit men inte ett krav. Kunskaper om kliniska prövningar inom precisionsmedicin, translationell medicinsk forskning, hälsoinformatik och upptäckande av biomarkörer är starka meriter. Skicklighet inom integrativa analyser av multiomikdata, avancerad datavisualisering och medicinsk bildanalys är också starkt meriterande. Erfarenhet av att tillhandahålla stöd och undervisning inom bioinformatik är också meriterande. Stor vikt kommer läggas vid personlig lämplighet och kommunikationsförmåga för arbete inom multidisciplinära grupper.

Vad erbjuder vi?

En kreativ, internationell och inspirerande miljö fylld av kompetens och nyfikenhet. Karolinska Institutet är ett av världens ledande medicinska universitet. Vår vision är att driva utvecklingen av kunskap om livet och verka för en bättre hälsa för alla. Här bedriver vi framgångsrik medicinsk forskning och har det största utbudet av medicinska utbildningar i Sverige. Som universitet är Karolinska Institutet en statlig myndighet. Det gör att du får goda förmåner genom vårt kollektivavtal. Medarbetare på KI erbjuds också möjlighet till ett flexibelt arbetssätt. Det innebär att om den verksamhet du jobbar i tillåter, så kan du arbeta en del av din arbetstid på distans. Du får även träna fritt i våra moderna friskvårdsanläggningar där utbildad personal finns på plats.

Placering: Solna

Tio skäl att välja Karolinska Institutet

Ansökan

Varmt välkommen med din ansökan.

Ansökan ska göras via rekryteringssystemet Varbi. Ansökan ska innehålla ett personligt brev som beskriver varför du är intresserad av anställningen och på vilket sätt den matchar dina meriter, samt ett CV som inkluderar en lista över dina vetenskapliga publikationer. Du kan skriva ansökan på svenska eller engelska.

Vid tillsvidareanställning tillämpar Karolinska Institutet 6 månaders provanställning.

Vill du göra skillnad – och bidra till en bättre hälsa för alla? Sök jobb hos oss