Bioinformatiker / Systemutvecklare

Vill du bidra till medicinsk forskning av toppkvalitet?

Vi söker en Bioinformatiker / Systemutvecklare till vårt produktionsteam på National Genomics Infrastructure (NGI), en av Europas största sekvenseringsanläggningar. NGI- Stockholm tillhandahåller storskalig sekvensering, samt kunskap om denna, till svenska forskargrupper. Verksamhetens mål är att främja svensk forskning inom genomik, samt att hålla Sverige konkurrenskraftigt inom fältet. Detta uppnås genom att arbeta mot hög kvalitet på både data, analyser och service. Läs mer om NGIs verksamhet på: https://ngisweden.scilifelab.se/about

Din roll

Den sökande kommer att arbeta med kvalitetskontroll, analys och leverans av sekvensdata. Arbetet kommer även att innefatta utveckling, förbättring och underhåll av informatiklösningar för hantering av produktionens interna dataflöden. Fördelningen mellan de olika arbetsuppgifterna kommer att bero på den sökandes erfarenhet.

Arbetsuppgifterna kommer bl a innefatta följande

Kvalitetskontroll och leverans av sekvensdata
Analys av sekvensdata enligt “best-practice” protokoll samt tolka och bedöma analysresultat
Systemadministration av centrala IT-system
Koordinering av programvaruinstallationer och underhåll av analysservrar
Automatisering av data- och analysflöden
Underhåll och utveckling av interna informationsdatabaser
Besvara supportärenden och kommunicera med externa beställare
Visualisering av processförlopp och resultat

Vem är du?

Krav:

Högskoleexamen inom bioinformatik
Utmärkta programmeringskunskaper. Erfarenhet att arbeta med Python, R eller Java
Erfarenhet av arbete med versionshanteringsverktyg som git
Väl förtrogen med att arbeta i Linux-/Unixmiljö
Utmärkt kommunikations- och samarbetsförmåga
Obehindrat tala och skriva engelska
Tidigare erfarenhet av att analysera NGS data.
Erfarenhet av att arbeta med LIMS (Laboratory Information Management Systems)
Erfarenhet av att jobba inom ackrediterad verksamhet enligt ISO 17025
Erfarenhet av användning av datorkluster

Meriterande:

Erfarenhet av webbapplikationsutveckling, databasadministration.

Vad erbjuder vi?

En kreativ, internationell och inspirerande miljö fylld av kompetens och nyfikenhet. Karolinska Institutet är ett av världens ledande medicinska universitet. Vår vision är att driva utvecklingen av kunskap om livet och verka för en bättre hälsa för alla. Här bedriver vi framgångsrik medicinsk forskning och har det största utbudet av medicinska utbildningar i Sverige. Som universitet är Karolinska Institutet en statlig myndighet. Det gör att du får goda förmåner genom vårt kollektivavtal. Medarbetare på KI erbjuds också möjlighet till ett flexibelt arbetssätt. Det innebär att om den verksamhet du jobbar i tillåter, så kan du arbeta en del av din arbetstid på distans. Du får även träna fritt i våra moderna friskvårdsanläggningar där utbildad personal finns på plats.

Placering: Solna

Tio skäl att välja Karolinska Institutet

https://ki.se/bionut

Ansökan

Varmt välkommen med din ansökan senast den 26 juni 2024.

Ansökan ska göras via rekryteringssystemet Varbi. I denna rekrytering söker du med ditt CV utan personligt brev. I ansökningsformuläret kommer du istället att få svara på några frågor om varför du söker jobbet.

Vid tillsvidareanställning tillämpar Karolinska Institutet 6 månaders provanställning.

Vill du göra skillnad – och bidra till en bättre hälsa för alla? Sök jobb hos oss