Postdoktor inom bioinformatik i regulatorisk genomik - Under tillsättning eller tillsatt, ej sökbar

Vill du bidra till medicinsk forskning av toppkvalitet?

Institutionen för cell -och molekylärbiologi (CMB) är en institution med fokus på grundforskning. CMB bedriver forskning och utbildning inom cellbiologi, molekylärbiologi, utvecklingsbiologi, stamcellsbiologi, cancer och infektionsbiologi. CMB ligger i Biomedicum, ett nytt interdisciplinärt forskningscenter utformat för att samla den experimentella forskningen som bedrivs på Karolinska Institutet Campus Solna under ett tak för att främja och uppmuntra samarbete. Biomedicum inhyser ca 1200 forskare och möjliggör att dyrare utrustning kan delas mellan grupperna och användas så effektivt som möjligt.

Forskargruppen

Llorens-laboratoriet erbjuder en levande, stimulerande och internationell miljö. Vi är en del av institutionen för cell- och molekylärbiologi vid Karolinska Institutet i Stockholm, Sverige, ett av världens ledande medicinska universitet. Labbet ligger i Biomedicum, ett av Europas största laboratorier med toppmoderna faciliteter och rika möjligheter till samarbete och karriärutveckling.

Vårt labb är intresserade av att stimulera regenerering i däggdjurens centrala nervsystem (CNS). Vi strävar efter att avslöja principerna för reglering av genuttryck under utveckling och återanvända dem för regenerering. Vi använder ett multidisciplinärt tillvägagångssätt som involverar stamcellsbiologi, systembiologi, beräkningsbiologi, molekylär ingenjörskonst och djurmodeller av sjukdomar.

I nyligen genomförda arbeten upptäckte vi nyligen en latent regenerativ potential i vuxna ryggmärgsstamceller med hjälp av enkelcellsmultiomik och designade en riktad intervention för att framkalla sådan potential (Llorens-Bobadilla et al. Science 2020). Parallellt utvecklar vi också nya teknologier för rumsligt upplöst multiomik (Llorens-Bobadilla et al. Nature Biotech 2023).

De aktuella projekten syftar till att använda beräkningsmodellering av multiomiska encells- och rumsgenomiska datauppsättningar, för att avslöja principer för genuttrycksreglering under CNS-skada och återanvända dem för regenerering med hjälp av syntetisk genomik.

Länk till labbets hemsida: https://ki.se/en/cmb/enric-llorens-group

Din roll

Vi söker en mycket motiverad och entusiastisk postdoktor för att driva tillämpningen av ML-modeller på stora transkriptomik- och epigenomikdatauppsättningar för att stödja utformningen av regenerativa terapier i nervsystemet.

Vem är du?

För att anställas som postdoktor krävs avlagd doktorsexamen eller en utländsk examen som bedöms motsvara doktorsexamen. Detta behörighetskrav ska vara uppfyllt senast vid tidpunkten då anställningsbeslutet fattas. Det är meriterande om du har avlagt din doktorsexamen inom de tre senaste åren, om det finns särskilda skäl kan din examen ha avlagts tidigare.

Vi söker mycket motiverade, självgående kandidater med en stark meritlista och relevant erfarenhet under doktorsexamen. Den framgångsrika sökande förväntas ha en bakgrund och ett starkt intresse för ett eller flera av följande områden: beräkningsbiologi, maskininlärning, bioinformatik, encellig och rumslig genomik och jämförande genomik.
God kommunikationsförmåga på engelska i tal och skrift krävs.

• Du har en doktorsexamen i artificiell intelligens, bioinformatik, datavetenskap, fysik, teknik, bioteknik eller motsvarande samt följande:
• Kunskaper i Python-programmering
• Erfarenhet av högpresterande datoranvändning
• Erfarenhet av maskininlärning ses som meriterande (t.ex. Tensorflow/Keras/PyTorch)
• Erfarenhet av encellig eller rumslig genomik ses som meriterande

Vad erbjuder vi?

En kreativ, internationell inspirerande miljö fylld av kompetens och nyfikenhet. Karolinska Institutet är ett av världens ledande medicinska universitet. Här bedriver vi framgångsrik medicinsk forskning och har det största utbudet av medicinska utbildningar i Sverige. På KI får du träffa forskare med olika forskningsinriktningar som jobbar tillsammans. Det är det gränsöverskridande samarbetet som bidrar till KI:s världsledande position inom forskning. Flera av de personer du möter inom vården är utbildade på KI. En nära relationen till hälso- och sjukvården är viktig för att skapa utbildning och forskning av högsta kvalitet. Som universitet är Karolinska Institutet också en statlig myndighet. Det gör att du som anställd får goda förmåner genom vårt kollektivavtal.

Placering: Stockholm

Video om Karolinska Institutet, hur vi alla bidrar till "en bättre hälsa för alla"

Ansökan

Ansökan ska bestå av följande handlingar, skrivna på engelska eller svenska:

• En komplett CV inkluderande disputationsdatum, avhandlingens titel, tidigare akademiska befattningar, akademisk titel, nuvarande befattning, akademiska utmärkelser samt kommittéarbete
• En komplett publikationslista
• En sammanfattning av nuvarande arbete (maximalt en sida)
• Ett motiveringsbrev
• Namn på tre referenser

Ansökan ska göras via rekryteringssystemet Varbi.

Vill du göra skillnad – och bidra till en bättre hälsa för alla? Sök jobb hos oss