Bioinformatiker - vikariat

Vill du bidra till medicinsk forskning av toppkvalitet?

Institutionen för laboratoriemedicin består av sju avdelningar inom vilka det bedrivs både forskning och undervisning. Institutionen är involverad i avancerad forskning inom såväl grundforskning som tillämpad forskning. Samtliga avdelningar bedriver verksamhet i nära kontakt med kliniker vid Karolinska universitetssjukhuset. Institutionens utbildningsverksamhet bidrar till flertalet program och kurser inom KI:s totala utbildningsutbud.

Din roll

Vid avdelningen för klinisk mikrobiologi erbjuds du ett vikariat som postdoktoral forskare med profil mot bioinformatik. Du kommer att jobba självständigt kring forskningsprojekt inom antibiotikaresistens – mer specifikt kring hur vi bäst bevarar effekten av nya antibiotika. Forskningen syftar till att kartlägga mekanismer för antibiotikaresistens och hur vi kan förebygga att resistens utvecklas. I arbetet ingår även kunskap om det humana mikrobiomet. Inom Christian Giskes forskargrupp kommer du ansvara för att driva forskningsprojekt där vi förutsätter mycket god kunskap inom antibiotikaresistens och genomiska metoder för att studera antibiotikaresistens. Du kommer att handleda både doktorander och masterstudenter och interagera i team med andra forskare på postdoktoral nivå.

Vem är du?

Vi söker dig som har disputerat och som har lång erfarenhet av bioinformatikfrågor. Mycket god kunskap om sekvensering med long-read sekvensering och av bioinformatiska analysmetoder är ett krav. Därutöver krävs specifikt dokumenterad erfarenhet av självständigt bioinformatiskt arbete med inriktning mot antibiotikaresistens och specifikt av long-read next-generation DNA sekvensering. Det är meriterande med erfarenhet av metagenomisk diagnostik. Det är också meriterande med erfarenhet av att självständigt utföra DNA-sekvensering med long-read teknik (t ex Nanopore), erfarenhet av undersökning av mobila genetiska element – särskilt plasmider, erfarenhet av att arbeta med antibiotikaresistens och analys av mobila genetiska element samt erfarenhet av att självständigt analysera metagenomiska data från long-read sekvensering – både för bakterier, virus och andra smittämnen.

Som person ser vi gärna att du kan arbeta självständigt i en forskningsmiljö, inklusive att definiera forskningsproblem, identifiera potentiella lösningar på dessa problem och utvärdera dem med en lämplig metodik. Du har utmärkt kommunikations- och samarbetsförmåga och du har mycket god förmåga att använda och delvis utveckla pipelines för analys av bioinformatiska data.

Vad erbjuder vi?

En kreativ, internationell och inspirerande miljö fylld av kompetens och nyfikenhet. Karolinska Institutet är ett av världens ledande medicinska universitet. Vår vision är att driva utvecklingen av kunskap om livet och verka för en bättre hälsa för alla. Här bedriver vi framgångsrik medicinsk forskning och har det största utbudet av medicinska utbildningar i Sverige. Som universitet är Karolinska Institutet en statlig myndighet. Det gör att du får goda förmåner genom vårt kollektivavtal. Medarbetare på KI erbjuds också möjlighet till ett flexibelt arbetssätt. Det innebär att om den verksamhet du jobbar i tillåter, så kan du arbeta en del av din arbetstid på distans. Du får även träna fritt i våra moderna friskvårdsanläggningar där utbildad personal finns på plats.

Placering: Flemingsberg

Läs mer om Christian Giske forskargrupp

Ansökan

Varmt välkommen med din ansökan senast den 30 november.

Ansökan ska göras via rekryteringssystemet Varbi. I denna rekrytering söker du med ditt CV utan personligt brev. I ansökningsformuläret kommer du istället att få svara på några frågor om varför du söker jobbet.

Vid tillsvidareanställning tillämpar Karolinska Institutet 6 månaders provanställning.

Vill du göra skillnad – och bidra till en bättre hälsa för alla? Sök jobb hos oss